RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000219594.1

Gm33337-201, mousemouse

TSL 3 BASIC

Gene Gm33337, Length 228 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm33337-201ENSMUST00000219594 Chic1Q8CBW7 227 aa34.52■■■■□ 3.12
Gm33337-201ENSMUST00000219594 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa33.35■■■□□ 2.93
Gm33337-201ENSMUST00000219594 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa32.68■■■□□ 2.82
Gm33337-201ENSMUST00000219594 NischQ80TM9 1593 aa32.24■■■□□ 2.75
Gm33337-201ENSMUST00000219594 Abcc8B2RUS7 1588 aa31.19■■■□□ 2.58
Gm33337-201ENSMUST00000219594 Abcc9P70170 1546 aa31.18■■■□□ 2.58
Gm33337-201ENSMUST00000219594 Phf23Q8BSN5 401 aa31.14■■■□□ 2.58
Gm33337-201ENSMUST00000219594 Plppr3Q7TPB0 716 aa30.16■■■□□ 2.42
Gm33337-201ENSMUST00000219594 ScribQ80U72 1612 aa30.14■■■□□ 2.42
Gm33337-201ENSMUST00000219594 Gab3Q8BSM5 595 aa29.81■■■□□ 2.36
Gm33337-201ENSMUST00000219594 NacadQ5SWP3 1504 aa29.14■■■□□ 2.25
Gm33337-201ENSMUST00000219594 Kdm5dQ62240 1548 aa29.11■■■□□ 2.25
Gm33337-201ENSMUST00000219594 Senp3Q9EP97 568 aaKnown RBP28.63■■■□□ 2.17
Gm33337-201ENSMUST00000219594 Dcaf1Q80TR8 1506 aa28.62■■■□□ 2.17
Gm33337-201ENSMUST00000219594 Sycp2Q9CUU3 1500 aa28.59■■■□□ 2.17
Gm33337-201ENSMUST00000219594 BicraF8VPZ9 1578 aa28.24■■■□□ 2.11
Gm33337-201ENSMUST00000219594 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa28.1■■■□□ 2.09
Gm33337-201ENSMUST00000219594 Rhox8Q6VSS7 320 aa27.84■■■□□ 2.05
Gm33337-201ENSMUST00000219594 Kcna4Q61423 654 aa27.8■■■□□ 2.04
Gm33337-201ENSMUST00000219594 Baz1aO88379 1555 aa27.69■■■□□ 2.02
Gm33337-201ENSMUST00000219594 Ccdc180J3QNE4 1664 aa27.64■■■□□ 2.02
Gm33337-201ENSMUST00000219594 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa27.6■■■□□ 2.01
Gm33337-201ENSMUST00000219594 Crybg2B7ZCC2 1516 aa27.56■■■□□ 2
Gm33337-201ENSMUST00000219594 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
Gm33337-201ENSMUST00000219594 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
Gm33337-201ENSMUST00000219594 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
Gm33337-201ENSMUST00000219594 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
Gm33337-201ENSMUST00000219594 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
Gm33337-201ENSMUST00000219594 Smarca2Q6DIC0 1577 aa26.87■■□□□ 1.89
Gm33337-201ENSMUST00000219594 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa26.87■■□□□ 1.89
Gm33337-201ENSMUST00000219594 Ercc6F8VPZ5 1481 aa26.81■■□□□ 1.88
Gm33337-201ENSMUST00000219594 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa26.8■■□□□ 1.88
Gm33337-201ENSMUST00000219594 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa26.77■■□□□ 1.88
Gm33337-201ENSMUST00000219594 Fam135aQ6NS59 1506 aa26.57■■□□□ 1.84
Gm33337-201ENSMUST00000219594 Wdr62Q3U3T8 1523 aa26.55■■□□□ 1.84
Gm33337-201ENSMUST00000219594 Frmpd1A2AKB4 1549 aa26.53■■□□□ 1.84
Gm33337-201ENSMUST00000219594 Rtl1Q7M732 1744 aa26.42■■□□□ 1.82
Gm33337-201ENSMUST00000219594 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
Gm33337-201ENSMUST00000219594 Unc13aQ4KUS2 1712 aa26.22■■□□□ 1.79
Gm33337-201ENSMUST00000219594 CftrP26361 1476 aa26.2■■□□□ 1.78
Gm33337-201ENSMUST00000219594 Ubl4bQ9CQ84 188 aa26.17■■□□□ 1.78
Gm33337-201ENSMUST00000219594 Synj1Q8CHC4 1574 aa26.16■■□□□ 1.78
Gm33337-201ENSMUST00000219594 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa26.16■■□□□ 1.78
Gm33337-201ENSMUST00000219594 Baz1bQ9Z277 1479 aa26.16■■□□□ 1.78
Gm33337-201ENSMUST00000219594 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa26.09■■□□□ 1.77
Gm33337-201ENSMUST00000219594 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
Gm33337-201ENSMUST00000219594 Mrc2Q64449 1479 aa25.95■■□□□ 1.74
Gm33337-201ENSMUST00000219594 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
Gm33337-201ENSMUST00000219594 Trim41Q5NCC3 630 aa25.62■■□□□ 1.69
Gm33337-201ENSMUST00000219594 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
Gm33337-201ENSMUST00000219594 Kif15Q6P9L6 1387 aa25.56■■□□□ 1.68
Gm33337-201ENSMUST00000219594 Cux2P70298 1426 aa25.55■■□□□ 1.68
Gm33337-201ENSMUST00000219594 Lamc3Q9R0B6 1581 aa25.45■■□□□ 1.66
Gm33337-201ENSMUST00000219594 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa25.42■■□□□ 1.66
Gm33337-201ENSMUST00000219594 Kif21aQ9QXL2 1672 aa25.4■■□□□ 1.66
Gm33337-201ENSMUST00000219594 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
Gm33337-201ENSMUST00000219594 Top2bQ64511 1612 aa25.18■■□□□ 1.62
Gm33337-201ENSMUST00000219594 Golga3P55937 1487 aa25.17■■□□□ 1.62
Gm33337-201ENSMUST00000219594 Cep164Q5DU05 1446 aa25.17■■□□□ 1.62
Gm33337-201ENSMUST00000219594 Hoxd11P23813 323 aa25.16■■□□□ 1.62
Gm33337-201ENSMUST00000219594 TnnQ80Z71 1560 aa25.14■■□□□ 1.62
Gm33337-201ENSMUST00000219594 Trap1aP19473 224 aa25.14■■□□□ 1.62
Gm33337-201ENSMUST00000219594 Cngb1E1AZ71 1325 aa25.12■■□□□ 1.61
Gm33337-201ENSMUST00000219594 Il27Q8K3I6 234 aa25.07■■□□□ 1.6
Gm33337-201ENSMUST00000219594 Ccdc18Q640L5 1455 aa25.04■■□□□ 1.6
Gm33337-201ENSMUST00000219594 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
Gm33337-201ENSMUST00000219594 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
Gm33337-201ENSMUST00000219594 Camsap1A2AHC3 1581 aa24.99■■□□□ 1.59
Gm33337-201ENSMUST00000219594 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
Gm33337-201ENSMUST00000219594 Dnajc5P60904 198 aa24.97■■□□□ 1.59
Gm33337-201ENSMUST00000219594 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.59
Gm33337-201ENSMUST00000219594 Plb1Q3TTY0 1478 aa24.95■■□□□ 1.58
Gm33337-201ENSMUST00000219594 Crocc2F6XLV1 1638 aa24.89■■□□□ 1.57
Gm33337-201ENSMUST00000219594 Fmn1Q05860 1466 aa24.89■■□□□ 1.57
Gm33337-201ENSMUST00000219594 Dmrt2Q8BG36 561 aa24.87■■□□□ 1.57
Gm33337-201ENSMUST00000219594 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
Gm33337-201ENSMUST00000219594 Shroom2A2ALU4 1481 aa24.73■■□□□ 1.55
Gm33337-201ENSMUST00000219594 Duox2A2AQ99 1517 aa24.7■■□□□ 1.54
Gm33337-201ENSMUST00000219594 Ift140E9PY46 1464 aa24.69■■□□□ 1.54
Gm33337-201ENSMUST00000219594 Grin2bQ01097 1482 aa24.64■■□□□ 1.54
Gm33337-201ENSMUST00000219594 Rusc2Q80U22 1514 aa24.62■■□□□ 1.53
Gm33337-201ENSMUST00000219594 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa24.6■■□□□ 1.53
Gm33337-201ENSMUST00000219594 Fam163aQ8CAA5 168 aa24.55■■□□□ 1.52
Gm33337-201ENSMUST00000219594 Disp1Q3TDN0 1521 aa24.55■■□□□ 1.52
Gm33337-201ENSMUST00000219594 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa24.53■■□□□ 1.52
Gm33337-201ENSMUST00000219594 Samd9lQ69Z37 1561 aa24.51■■□□□ 1.51
Gm33337-201ENSMUST00000219594 Setd1bQ8CFT2 1985 aa24.51■■□□□ 1.51
Gm33337-201ENSMUST00000219594 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
Gm33337-201ENSMUST00000219594 Efcab5A0JP43 1406 aa24.47■■□□□ 1.51
Gm33337-201ENSMUST00000219594 Col17a1Q07563 1470 aa24.44■■□□□ 1.5
Gm33337-201ENSMUST00000219594 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
Gm33337-201ENSMUST00000219594 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
Gm33337-201ENSMUST00000219594 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
Gm33337-201ENSMUST00000219594 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
Gm33337-201ENSMUST00000219594 Rad54l2Q99NG0 1466 aa24.37■■□□□ 1.49
Gm33337-201ENSMUST00000219594 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa24.36■■□□□ 1.49
Gm33337-201ENSMUST00000219594 NrkQ9R0G8 1455 aa24.34■■□□□ 1.49
Gm33337-201ENSMUST00000219594 Magi3Q9EQJ9 1476 aa24.28■■□□□ 1.48
Gm33337-201ENSMUST00000219594 Grin2aP35436 1464 aa24.27■■□□□ 1.48
Gm33337-201ENSMUST00000219594 PtprkP35822 1457 aa24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 24.2 ms