RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000170476.7

Usp20-211, Transcript of Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Usp20, Length 4,970 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20-211ENSMUST00000170476 Rhox8Q6VSS7 320 aa22.87■■□□□ 1.25
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Usp20-211ENSMUST00000170476 Cngb1E1AZ71 1325 aa20.22■□□□□ 0.83
Usp20-211ENSMUST00000170476 Trim41Q5NCC3 630 aa20.21■□□□□ 0.83
Usp20-211ENSMUST00000170476 Abcc9P70170 1546 aa20.14■□□□□ 0.81
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Usp20-211ENSMUST00000170476 Zeb1Q64318 1117 aa19.68■□□□□ 0.74
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Usp20-211ENSMUST00000170476 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa19.51■□□□□ 0.71
Usp20-211ENSMUST00000170476 Ccdc180J3QNE4 1664 aa19.49■□□□□ 0.71
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Usp20-211ENSMUST00000170476 Wdr66E9Q743 1299 aa19.14■□□□□ 0.65
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Usp20-211ENSMUST00000170476 Ccdc18Q640L5 1455 aa17.78■□□□□ 0.44
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Usp20-211ENSMUST00000170476 Crybg2B7ZCC2 1516 aa17.77■□□□□ 0.44
Usp20-211ENSMUST00000170476 ScribQ80U72 1612 aa17.76■□□□□ 0.43
Usp20-211ENSMUST00000170476 Setd5Q5XJV7 1441 aa17.7■□□□□ 0.42
Usp20-211ENSMUST00000170476 BlmO88700 1416 aa17.68■□□□□ 0.42
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Usp20-211ENSMUST00000170476 Tnnt3Q9QZ47 272 aa17.66■□□□□ 0.42
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Usp20-211ENSMUST00000170476 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa17.47■□□□□ 0.39
Usp20-211ENSMUST00000170476 Zbtb4Q5F293 982 aa17.46■□□□□ 0.39
Usp20-211ENSMUST00000170476 Atp1b4Q99ME6 356 aa17.46■□□□□ 0.39
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Usp20-211ENSMUST00000170476 Clstn2Q9ER65 966 aa17.42■□□□□ 0.38
Usp20-211ENSMUST00000170476 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
Usp20-211ENSMUST00000170476 Synj1Q8CHC4 1574 aa17.36■□□□□ 0.37
Usp20-211ENSMUST00000170476 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa17.35■□□□□ 0.37
Usp20-211ENSMUST00000170476 Gm13695A2AK44 830 aa17.35■□□□□ 0.37
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Usp20-211ENSMUST00000170476 Cep162Q6ZQ06 1403 aa17.31■□□□□ 0.36
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