RNA–Protein interactions for RNA: YOL022C

TSR4, Cytoplasmic protein required for correct processing of 20S pre-rRNA, yeast

Gene TSR4, Length 1,227 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TSR4	YOL022C	LIP5	P32875	414 aa		5.16	□□□□□ -1.58
TSR4	YOL022C	NNK1	P36003	928 aa		5.16	□□□□□ -1.58
TSR4	YOL022C	RCM1	P53972	490 aa		5.16	□□□□□ -1.58
TSR4	YOL022C	YOR059C	Q08448	450 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
TSR4	YOL022C	YVC1	Q12324	675 aa		5.16	□□□□□ -1.58
TSR4	YOL022C	CYC8	P14922	966 aa		5.15	□□□□□ -1.59
TSR4	YOL022C	FYV10	P40492	516 aa		5.15	□□□□□ -1.59
TSR4	YOL022C	RAD2	P07276	1031 aa		5.14	□□□□□ -1.59
TSR4	YOL022C	PRE9	P23638	258 aa	Known RBP	5.14	□□□□□ -1.59
TSR4	YOL022C	HEM3	P28789	327 aa		5.14	□□□□□ -1.59
TSR4	YOL022C	MCM2	P29469	868 aa		5.14	□□□□□ -1.59
TSR4	YOL022C	PEX7	P39108	375 aa		5.14	□□□□□ -1.59
TSR4	YOL022C	RKM2	Q03942	479 aa		5.14	□□□□□ -1.59
TSR4	YOL022C	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	5.14	□□□□□ -1.59
TSR4	YOL022C	PUS7	Q08647	676 aa	Known RBP	5.14	□□□□□ -1.59
TSR4	YOL022C	AFG2	P32794	780 aa		5.13	□□□□□ -1.59
TSR4	YOL022C	RPS26A	P39938	119 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59
TSR4	YOL022C	RPS26B	P39939	119 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59
TSR4	YOL022C	GNP1	P48813	663 aa		5.13	□□□□□ -1.59
TSR4	YOL022C	YLR257W	Q06146	321 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59
TSR4	YOL022C	MCD1	Q12158	566 aa		5.13	□□□□□ -1.59
TSR4	YOL022C	RET1	P22276	1149 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
TSR4	YOL022C	ADD66	P36040	267 aa		5.12	□□□□□ -1.59
TSR4	YOL022C	MGE1	P38523	228 aa		5.12	□□□□□ -1.59
TSR4	YOL022C	SPR28	Q04921	423 aa		5.12	□□□□□ -1.59
TSR4	YOL022C	TAF13	P11747	167 aa		5.11	□□□□□ -1.59
TSR4	YOL022C	MRPS18	P42847	217 aa		5.11	□□□□□ -1.59
TSR4	YOL022C	TPP1	Q03796	238 aa		5.11	□□□□□ -1.59
TSR4	YOL022C	HDA2	Q06629	674 aa		5.11	□□□□□ -1.59
TSR4	YOL022C	SAM35	P14693	329 aa		5.1	□□□□□ -1.59
TSR4	YOL022C	LRG1	P35688	1017 aa		5.1	□□□□□ -1.59
TSR4	YOL022C	QNS1	P38795	714 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
TSR4	YOL022C	NMD3	P38861	518 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
TSR4	YOL022C	HXT13	P39924	564 aa		5.1	□□□□□ -1.59
TSR4	YOL022C	HXT17	P53631	564 aa		5.1	□□□□□ -1.59
TSR4	YOL022C	HXT15	P54854	567 aa		5.1	□□□□□ -1.59
TSR4	YOL022C	EST2	Q06163	884 aa		5.1	□□□□□ -1.59
TSR4	YOL022C	TRE1	Q08919	783 aa		5.1	□□□□□ -1.59
TSR4	YOL022C	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
TSR4	YOL022C	NSI1	Q12457	570 aa		5.1	□□□□□ -1.59
TSR4	YOL022C	ASF1	P32447	279 aa		5.09	□□□□□ -1.59
TSR4	YOL022C	HSE1	P38753	452 aa		5.09	□□□□□ -1.59
TSR4	YOL022C	YNR063W	P53749	607 aa		5.09	□□□□□ -1.59
TSR4	YOL022C	ORC3	P54790	616 aa		5.09	□□□□□ -1.59
TSR4	YOL022C	SSY1	Q03770	852 aa		5.09	□□□□□ -1.59
TSR4	YOL022C	LAP2	Q10740	671 aa		5.09	□□□□□ -1.59
TSR4	YOL022C	ELM1	P32801	640 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TSR4	YOL022C	SEC8	P32855	1065 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TSR4	YOL022C	YJL045W	P47052	634 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TSR4	YOL022C	SIW14	P53965	281 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TSR4	YOL022C	ROD1	Q02805	837 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TSR4	YOL022C	HRK1	Q08732	759 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
TSR4	YOL022C	HSP78	P33416	811 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TSR4	YOL022C	VPS53	P47061	822 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TSR4	YOL022C	AVT1	P47082	602 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TSR4	YOL022C	ENT3	P47160	408 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TSR4	YOL022C	DFG16	Q99234	619 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TSR4	YOL022C	GCR1	P07261	785 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TSR4	YOL022C	ADP1	P25371	1049 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TSR4	YOL022C	PRO1	P32264	428 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TSR4	YOL022C	POL12	P38121	705 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
TSR4	YOL022C	ESF1	Q06344	628 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
TSR4	YOL022C	DED1	P06634	604 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
TSR4	YOL022C	MKK2	P32491	506 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TSR4	YOL022C	ALG3	P38179	458 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TSR4	YOL022C	ATG14	P38270	344 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TSR4	YOL022C	YHL012W	P38709	493 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TSR4	YOL022C	PTC7	P38797	343 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TSR4	YOL022C	RAT1	Q02792	1006 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
TSR4	YOL022C	AOS1	Q06624	347 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TSR4	YOL022C	KIP1	P28742	1111 aa		5.04	□□□□□ -1.6
TSR4	YOL022C	YSC84	P32793	468 aa		5.04	□□□□□ -1.6
TSR4	YOL022C	SEG2	P34250	1132 aa		5.04	□□□□□ -1.6
TSR4	YOL022C	GTS1	P40956	396 aa		5.04	□□□□□ -1.6
TSR4	YOL022C	ECL1	P48235	211 aa		5.04	□□□□□ -1.6
TSR4	YOL022C	RMD1	Q03441	430 aa		5.04	□□□□□ -1.6
TSR4	YOL022C	OYE2	Q03558	400 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
TSR4	YOL022C	MRL1	Q06815	381 aa		5.04	□□□□□ -1.6
TSR4	YOL022C	PTC5	Q12511	572 aa		5.04	□□□□□ -1.6
TSR4	YOL022C	SRO9	P25567	434 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
TSR4	YOL022C	MDL2	P33311	773 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TSR4	YOL022C	DUT1	P33317	147 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TSR4	YOL022C	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
TSR4	YOL022C	IRC24	P40580	263 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TSR4	YOL022C	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
TSR4	YOL022C	BAP2	P38084	609 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TSR4	YOL022C	GPB2	P39717	880 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TSR4	YOL022C	YDL177C	Q12257	170 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TSR4	YOL022C	SNF5	P18480	905 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TSR4	YOL022C	CDA2	Q06703	312 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TSR4	YOL022C	DBP5	P20449	482 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
TSR4	YOL022C	RNQ1	P25367	405 aa		5	□□□□□ -1.61
TSR4	YOL022C	RGD1	P38339	666 aa		5	□□□□□ -1.61
TSR4	YOL022C	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
TSR4	YOL022C	RSC58	Q07979	502 aa		5	□□□□□ -1.61
TSR4	YOL022C	RTT10	Q08924	1013 aa		5	□□□□□ -1.61
TSR4	YOL022C	YPL260W	Q08977	551 aa		5	□□□□□ -1.61
TSR4	YOL022C	SYP1	P25623	870 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TSR4	YOL022C	PEP7	P32609	515 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TSR4	YOL022C	RER2	P35196	286 aa		4.99	□□□□□ -1.61

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