RNA–Protein interactions for RNA: YMR174C

PAI3, Transcript of Cytoplasmic proteinase A (Pep4p) inhibitor, yeast

Gene PAI3, Length 207 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PAI3	YMR174C	PRI2	P20457	528 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PAI3	YMR174C	GPT2	P36148	743 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PAI3	YMR174C	YMR187C	Q03236	431 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PAI3	YMR174C	MCA1	Q08601	432 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PAI3	YMR174C	YOR223W	Q12015	292 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PAI3	YMR174C	TRP2	P00899	507 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PAI3	YMR174C	NAP1	P25293	417 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PAI3	YMR174C	YAR028W	P39548	234 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PAI3	YMR174C	SSF2	Q12153	453 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PAI3	YMR174C	PHM7	Q12252	991 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PAI3	YMR174C	YPR053C	Q6Q5F3	151 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PAI3	YMR174C	NAM7	P30771	971 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PAI3	YMR174C	LYP1	P32487	611 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PAI3	YMR174C	MOT2	P34909	587 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PAI3	YMR174C	NMD3	P38861	518 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PAI3	YMR174C	SKN7	P38889	622 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PAI3	YMR174C	MSH4	P40965	878 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PAI3	YMR174C	EAR1	Q03212	550 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PAI3	YMR174C	TIF35	Q04067	274 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PAI3	YMR174C	OPI10	Q08202	246 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PAI3	YMR174C	AVO1	Q08236	1176 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PAI3	YMR174C	TMA46	Q12000	345 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PAI3	YMR174C	YLL054C	Q12244	843 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PAI3	YMR174C	BAS1	P22035	811 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PAI3	YMR174C	SYP1	P25623	870 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PAI3	YMR174C	RSC6	P25632	483 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PAI3	YMR174C	RAD27	P26793	382 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PAI3	YMR174C	SEA4	P38164	1038 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PAI3	YMR174C	ALG3	P38179	458 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PAI3	YMR174C	OCA5	P38738	679 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PAI3	YMR174C	TAT2	P38967	592 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PAI3	YMR174C	ICP55	P40051	511 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PAI3	YMR174C	ENT3	P47160	408 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PAI3	YMR174C	ARI1	P53111	347 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PAI3	YMR174C	ORC1	P54784	914 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PAI3	YMR174C	RKM2	Q03942	479 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PAI3	YMR174C	AOS1	Q06624	347 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PAI3	YMR174C	YPL066W	Q12194	479 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PAI3	YMR174C	DBP5	P20449	482 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PAI3	YMR174C	ABD1	P32783	436 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PAI3	YMR174C	AKR1	P39010	764 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PAI3	YMR174C	TYW3	P53177	273 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PAI3	YMR174C	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PAI3	YMR174C	YLR225C	Q05948	407 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PAI3	YMR174C	RET1	P22276	1149 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PAI3	YMR174C	PUF4	P25339	888 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.58	□□□□□ -1.68	not detected
PAI3	YMR174C	PGM1	P33401	570 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PAI3	YMR174C	TAT1	P38085	619 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PAI3	YMR174C	MPH1	P40562	993 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PAI3	YMR174C	YLR257W	Q06146	321 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PAI3	YMR174C	FAL1	Q12099	399 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PAI3	YMR174C	PTC5	Q12511	572 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PAI3	YMR174C	INO1	P11986	533 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PAI3	YMR174C	NFS1	P25374	497 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PAI3	YMR174C	MLS1	P30952	554 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PAI3	YMR174C	SMY2	P32909	740 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PAI3	YMR174C	QNS1	P38795	714 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PAI3	YMR174C	GPB2	P39717	880 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PAI3	YMR174C	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PAI3	YMR174C	CNN1	P43618	361 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PAI3	YMR174C	ALT1	P52893	592 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PAI3	YMR174C	YPL034W	Q03083	165 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PAI3	YMR174C	GIC2	Q06648	383 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PAI3	YMR174C	PUF3	Q07807	879 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.57	□□□□□ -1.68	not detected
PAI3	YMR174C	RPS4A	P0CX35	261 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PAI3	YMR174C	RPS4B	P0CX36	261 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PAI3	YMR174C	GRX1	P25373	110 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PAI3	YMR174C	STE5	P32917	917 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PAI3	YMR174C	WHI3	P34761	661 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PAI3	YMR174C	IOC3	P43596	787 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PAI3	YMR174C	YJL045W	P47052	634 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PAI3	YMR174C	KIP1	P28742	1111 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PAI3	YMR174C	NNK1	P36003	928 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PAI3	YMR174C	MCM7	P38132	845 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PAI3	YMR174C	ATG14	P38270	344 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PAI3	YMR174C	YFL054C	P43549	646 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PAI3	YMR174C	CCT8	P47079	568 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PAI3	YMR174C	NNF1	P47149	201 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PAI3	YMR174C	TDA5	Q06417	326 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PAI3	YMR174C	LAP2	Q10740	671 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PAI3	YMR174C	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PAI3	YMR174C	PUS1	Q12211	544 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PAI3	YMR174C	YER152C	P10356	443 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PAI3	YMR174C	AGP1	P25376	633 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PAI3	YMR174C	VBA5	P36172	582 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PAI3	YMR174C	RGD1	P38339	666 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PAI3	YMR174C	YGL176C	P46945	554 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PAI3	YMR174C	VPS53	P47061	822 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PAI3	YMR174C	TPP1	Q03796	238 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PAI3	YMR174C	SPO20	Q04359	397 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PAI3	YMR174C	PUS7	Q08647	676 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PAI3	YMR174C	YLR122C	Q12312	125 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PAI3	YMR174C	SAF1	P38352	637 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PAI3	YMR174C	HSE1	P38753	452 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PAI3	YMR174C	MBP1	P39678	833 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PAI3	YMR174C	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PAI3	YMR174C	SPO21	Q12411	609 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PAI3	YMR174C	RAD4	P14736	754 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PAI3	YMR174C	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
PAI3	YMR174C	SBA1	P28707	216 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69

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