RNA–Protein interactions for RNA: YKL115C

YKL115C, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YKL115C, Length 393 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKL115CYKL115C NMD3P38861 518 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
YKL115CYKL115C SLS1P42900 643 aa5.37□□□□□ -1.55
YKL115CYKL115C TOD6P34219 525 aa5.36□□□□□ -1.55
YKL115CYKL115C RVS167P39743 482 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
YKL115CYKL115C SOD2P00447 233 aa5.35□□□□□ -1.55
YKL115CYKL115C EXO5P38289 585 aa5.35□□□□□ -1.55
YKL115CYKL115C YHL012WP38709 493 aa5.35□□□□□ -1.55
YKL115CYKL115C FOL2P51601 243 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
YKL115CYKL115C RPS13P05756 151 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
YKL115CYKL115C RET1P22276 1149 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
YKL115CYKL115C NEM1P38757 446 aa5.34□□□□□ -1.55
YKL115CYKL115C YAR028WP39548 234 aa5.34□□□□□ -1.55
YKL115CYKL115C YPL277CQ08989 487 aa5.34□□□□□ -1.55
YKL115CYKL115C SAM35P14693 329 aa5.33□□□□□ -1.56
YKL115CYKL115C HEM3P28789 327 aa5.33□□□□□ -1.56
YKL115CYKL115C SHU2P38957 223 aa5.33□□□□□ -1.56
YKL115CYKL115C POL32P47110 350 aa5.33□□□□□ -1.56
YKL115CYKL115C SNO2P53823 222 aa5.33□□□□□ -1.56
YKL115CYKL115C YLR257WQ06146 321 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
YKL115CYKL115C RRP15Q06511 250 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
YKL115CYKL115C PPX1P38698 397 aa5.32□□□□□ -1.56
YKL115CYKL115C TOS4Q06266 489 aa5.32□□□□□ -1.56
YKL115CYKL115C SEC20P28791 383 aa5.31□□□□□ -1.56
YKL115CYKL115C MDL2P33311 773 aa5.31□□□□□ -1.56
YKL115CYKL115C MTR4P47047 1073 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
YKL115CYKL115C GIS1Q03833 894 aa5.31□□□□□ -1.56
YKL115CYKL115C AIM26P32858 118 aa5.3□□□□□ -1.56
YKL115CYKL115C GSF2Q04697 403 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
YKL115CYKL115C NOC3Q07896 663 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
YKL115CYKL115C MCM2P29469 868 aa5.29□□□□□ -1.56
YKL115CYKL115C HSE1P38753 452 aa5.29□□□□□ -1.56
YKL115CYKL115C RSA3Q05942 220 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
YKL115CYKL115C YLR358CO13565 187 aa5.28□□□□□ -1.56
YKL115CYKL115C PHO4P07270 312 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
YKL115CYKL115C SEC8P32855 1065 aa5.28□□□□□ -1.56
YKL115CYKL115C ATG14P38270 344 aa5.28□□□□□ -1.56
YKL115CYKL115C HRK1Q08732 759 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
YKL115CYKL115C LAP2Q10740 671 aa5.28□□□□□ -1.56
YKL115CYKL115C ABZ1P37254 787 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
YKL115CYKL115C FYV10P40492 516 aa5.27□□□□□ -1.57
YKL115CYKL115C YNR063WP53749 607 aa5.27□□□□□ -1.57
YKL115CYKL115C UBP3Q01477 912 aaKnown RBP RIP-Chip data5.27□□□□□ -1.57not detected
YKL115CYKL115C NOG1Q02892 647 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
YKL115CYKL115C CLU1Q03690 1277 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
YKL115CYKL115C UTP5Q04177 643 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
YKL115CYKL115C YCS4Q06156 1176 aa5.27□□□□□ -1.57
YKL115CYKL115C MSH3P25336 1018 aa5.26□□□□□ -1.57
YKL115CYKL115C RPT1P33299 467 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
YKL115CYKL115C SHM2P37291 469 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
YKL115CYKL115C XKS1P42826 600 aa5.26□□□□□ -1.57
YKL115CYKL115C DAK2P43550 591 aa5.26□□□□□ -1.57
YKL115CYKL115C YJL045WP47052 634 aa5.26□□□□□ -1.57
YKL115CYKL115C SAM37P50110 327 aa5.26□□□□□ -1.57
YKL115CYKL115C OYE2Q03558 400 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
YKL115CYKL115C SPR28Q04921 423 aa5.26□□□□□ -1.57
YKL115CYKL115C SRO9P25567 434 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
YKL115CYKL115C PEX13P80667 386 aa5.25□□□□□ -1.57
YKL115CYKL115C PRE10P21242 288 aaKnown RBP RIP-Chip data5.24□□□□□ -1.57not detected
YKL115CYKL115C YOR352WQ08816 343 aa5.24□□□□□ -1.57
YKL115CYKL115C TUB2P02557 457 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
YKL115CYKL115C SPS1P08458 490 aa5.23□□□□□ -1.57
YKL115CYKL115C CTS1P29029 562 aa5.23□□□□□ -1.57
YKL115CYKL115C UGA4P32837 571 aa5.23□□□□□ -1.57
YKL115CYKL115C CIC1P38779 376 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
YKL115CYKL115C VMA4P22203 233 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
YKL115CYKL115C PAM1P37304 830 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
YKL115CYKL115C QNS1P38795 714 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
YKL115CYKL115C RSM26P47141 266 aa5.22□□□□□ -1.57
YKL115CYKL115C RSC58Q07979 502 aa5.22□□□□□ -1.57
YKL115CYKL115C NBA1Q08229 501 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
YKL115CYKL115C YSC84P32793 468 aa5.21□□□□□ -1.58
YKL115CYKL115C FAA3P39002 694 aa5.21□□□□□ -1.58
YKL115CYKL115C YJR107WP47145 328 aa5.21□□□□□ -1.58
YKL115CYKL115C MPT5P39016 859 aaKnown RBP RIP-Chip data5.2□□□□□ -1.58not detected
YKL115CYKL115C RPS26AP39938 119 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
YKL115CYKL115C RPS26BP39939 119 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
YKL115CYKL115C SPT20P50875 604 aa5.2□□□□□ -1.58
YKL115CYKL115C ENV11P53246 860 aa5.2□□□□□ -1.58
YKL115CYKL115C PNS1Q12412 539 aa5.2□□□□□ -1.58
YKL115CYKL115C SCP160P06105 1222 aaKnown RBP RIP-Chip data5.19□□□□□ -1.58not detected
YKL115CYKL115C SQT1P35184 431 aa5.19□□□□□ -1.58
YKL115CYKL115C TAT2P38967 592 aa5.19□□□□□ -1.58
YKL115CYKL115C YDR132CQ03900 495 aa5.19□□□□□ -1.58
YKL115CYKL115C SGD1Q06132 899 aa5.19□□□□□ -1.58
YKL115CYKL115C PRP40P33203 583 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
YKL115CYKL115C MGE1P38523 228 aa5.18□□□□□ -1.58
YKL115CYKL115C LAM1P38851 1228 aa5.18□□□□□ -1.58
YKL115CYKL115C VPS53P47061 822 aa5.18□□□□□ -1.58
YKL115CYKL115C SNU71P53207 620 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
YKL115CYKL115C DAL4Q04895 635 aa5.18□□□□□ -1.58
YKL115CYKL115C MEF2P39677 819 aa5.17□□□□□ -1.58
YKL115CYKL115C GCN5Q03330 439 aa5.17□□□□□ -1.58
YKL115CYKL115C COQ4O13525 335 aa5.16□□□□□ -1.58
YKL115CYKL115C KAR2P16474 682 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
YKL115CYKL115C ADD66P36040 267 aa5.16□□□□□ -1.58
YKL115CYKL115C PEX28P38848 579 aa5.16□□□□□ -1.58
YKL115CYKL115C ULP1Q02724 621 aa5.16□□□□□ -1.58
YKL115CYKL115C RKM2Q03942 479 aa5.16□□□□□ -1.58
YKL115CYKL115C RCL1Q08096 367 aaPredicted RBP5.16□□□□□ -1.58
YKL115CYKL115C TAD3Q9URQ3 322 aa5.16□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 15.3 ms