RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623495.1

LETMD1-238, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

Gene LETMD1, Length 2,948 nt, Biotype TEC.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-238	ENST00000623495	NEFM	P07197	916 aa		9.4	□□□□□ -0.9
LETMD1-238	ENST00000623495	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	9.4	□□□□□ -0.9
LETMD1-238	ENST00000623495	PRKAR2B	P31323	418 aa		9.4	□□□□□ -0.9
LETMD1-238	ENST00000623495	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	9.4	□□□□□ -0.9
LETMD1-238	ENST00000623495	DCTN1	Q14203	1278 aa		9.4	□□□□□ -0.9
LETMD1-238	ENST00000623495	VPS72	Q15906	364 aa		9.4	□□□□□ -0.9
LETMD1-238	ENST00000623495	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		9.4	□□□□□ -0.91
LETMD1-238	ENST00000623495	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	9.4	□□□□□ -0.91
LETMD1-238	ENST00000623495	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	9.39	□□□□□ -0.91
LETMD1-238	ENST00000623495	NUDC	Q9Y266	331 aa		9.39	□□□□□ -0.91
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	9.39	□□□□□ -0.91
LETMD1-238	ENST00000623495	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	9.39	□□□□□ -0.91
LETMD1-238	ENST00000623495	SSH2	Q76I76	1423 aa		9.39	□□□□□ -0.91
LETMD1-238	ENST00000623495	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		9.39	□□□□□ -0.91
LETMD1-238	ENST00000623495	FLT4	P35916	1363 aa		9.39	□□□□□ -0.91
LETMD1-238	ENST00000623495	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	9.39	□□□□□ -0.91
LETMD1-238	ENST00000623495	ANP32A	P39687	249 aa	Known RBP	9.38	□□□□□ -0.91
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	9.38	□□□□□ -0.91
LETMD1-238	ENST00000623495	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	9.38	□□□□□ -0.91
LETMD1-238	ENST00000623495	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		9.38	□□□□□ -0.91
LETMD1-238	ENST00000623495	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		9.38	□□□□□ -0.91
LETMD1-238	ENST00000623495	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	9.38	□□□□□ -0.91
LETMD1-238	ENST00000623495	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	9.38	□□□□□ -0.91
LETMD1-238	ENST00000623495	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		9.38	□□□□□ -0.91
LETMD1-238	ENST00000623495	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		9.38	□□□□□ -0.91
LETMD1-238	ENST00000623495	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		9.38	□□□□□ -0.91
LETMD1-238	ENST00000623495	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	9.37	□□□□□ -0.91
LETMD1-238	ENST00000623495	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	9.37	□□□□□ -0.91
LETMD1-238	ENST00000623495	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		9.37	□□□□□ -0.91
LETMD1-238	ENST00000623495	APBA3	O96018	575 aa		9.37	□□□□□ -0.91
LETMD1-238	ENST00000623495	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	9.37	□□□□□ -0.91
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF428	Q96B54	188 aa		9.37	□□□□□ -0.91
LETMD1-238	ENST00000623495	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		9.37	□□□□□ -0.91
LETMD1-238	ENST00000623495		A0A0U1RQG5	324 aa	Predicted RBP	9.36	□□□□□ -0.91
LETMD1-238	ENST00000623495	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	9.36	□□□□□ -0.91
LETMD1-238	ENST00000623495	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		9.36	□□□□□ -0.91
LETMD1-238	ENST00000623495	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		9.36	□□□□□ -0.91
LETMD1-238	ENST00000623495	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		9.36	□□□□□ -0.91
LETMD1-238	ENST00000623495	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		9.36	□□□□□ -0.91
LETMD1-238	ENST00000623495	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	9.36	□□□□□ -0.91
LETMD1-238	ENST00000623495	PPP4R2	Q9NY27	417 aa		9.36	□□□□□ -0.91
LETMD1-238	ENST00000623495	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		9.36	□□□□□ -0.91
LETMD1-238	ENST00000623495	KIF1A	Q12756	1690 aa		9.35	□□□□□ -0.91
LETMD1-238	ENST00000623495	SMIM5	Q71RC9	77 aa		9.35	□□□□□ -0.91
LETMD1-238	ENST00000623495	MCM10	Q7L590	875 aa		9.35	□□□□□ -0.91
LETMD1-238	ENST00000623495	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		9.35	□□□□□ -0.91
LETMD1-238	ENST00000623495	RALBP1	Q15311	655 aa		9.35	□□□□□ -0.91
LETMD1-238	ENST00000623495	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	9.35	□□□□□ -0.91
LETMD1-238	ENST00000623495	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	9.35	□□□□□ -0.91
LETMD1-238	ENST00000623495	USP31	Q70CQ4	1352 aa		9.35	□□□□□ -0.91
LETMD1-238	ENST00000623495	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	9.34	□□□□□ -0.91
LETMD1-238	ENST00000623495	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	9.34	□□□□□ -0.91
LETMD1-238	ENST00000623495	IL13	P35225	146 aa		9.34	□□□□□ -0.91
LETMD1-238	ENST00000623495	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		9.34	□□□□□ -0.91
LETMD1-238	ENST00000623495	PIK3C2A	O00443	1686 aa		9.34	□□□□□ -0.91
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC39A6	Q13433	755 aa		9.34	□□□□□ -0.91
LETMD1-238	ENST00000623495	NECTIN2	Q92692	538 aa		9.34	□□□□□ -0.91
LETMD1-238	ENST00000623495	CRB1	P82279	1406 aa		9.33	□□□□□ -0.92
LETMD1-238	ENST00000623495	CPD	O75976	1380 aa		9.33	□□□□□ -0.92
LETMD1-238	ENST00000623495	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		9.33	□□□□□ -0.92
LETMD1-238	ENST00000623495	CCER2	I3L3R5	266 aa		9.33	□□□□□ -0.92
LETMD1-238	ENST00000623495	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	9.33	□□□□□ -0.92
LETMD1-238	ENST00000623495	APAF1	O14727	1248 aa		9.33	□□□□□ -0.92
LETMD1-238	ENST00000623495	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	9.33	□□□□□ -0.92
LETMD1-238	ENST00000623495	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	9.33	□□□□□ -0.92
LETMD1-238	ENST00000623495	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	9.33	□□□□□ -0.92
LETMD1-238	ENST00000623495	INSR	P06213	1382 aa		9.32	□□□□□ -0.92
LETMD1-238	ENST00000623495	ITSN1	Q15811	1721 aa		9.32	□□□□□ -0.92
LETMD1-238	ENST00000623495	CYP27B1	O15528	508 aa		9.32	□□□□□ -0.92
LETMD1-238	ENST00000623495	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		9.32	□□□□□ -0.92
LETMD1-238	ENST00000623495	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	9.32	□□□□□ -0.92
LETMD1-238	ENST00000623495	LGR6	Q9HBX8	967 aa		9.32	□□□□□ -0.92
LETMD1-238	ENST00000623495	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		9.32	□□□□□ -0.92
LETMD1-238	ENST00000623495	KLHL34	Q8N239	644 aa		9.32	□□□□□ -0.92
LETMD1-238	ENST00000623495	SPG7	Q9UQ90	795 aa		9.32	□□□□□ -0.92
LETMD1-238	ENST00000623495	RGS12	O14924	1447 aa		9.32	□□□□□ -0.92
LETMD1-238	ENST00000623495	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	9.32	□□□□□ -0.92
LETMD1-238	ENST00000623495	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	9.32	□□□□□ -0.92
LETMD1-238	ENST00000623495	NGEF	Q8N5V2	710 aa		9.32	□□□□□ -0.92
LETMD1-238	ENST00000623495	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		9.32	□□□□□ -0.92
LETMD1-238	ENST00000623495	SLIT2	O94813	1529 aa		9.32	□□□□□ -0.92
LETMD1-238	ENST00000623495	CABP4	P57796	275 aa		9.31	□□□□□ -0.92
LETMD1-238	ENST00000623495	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	9.31	□□□□□ -0.92
LETMD1-238	ENST00000623495	TEF	Q10587	303 aa		9.31	□□□□□ -0.92
LETMD1-238	ENST00000623495	PHF14	O94880	888 aa		9.3	□□□□□ -0.92
LETMD1-238	ENST00000623495	RIPK4	P57078	832 aa		9.3	□□□□□ -0.92
LETMD1-238	ENST00000623495	GSE1	Q14687	1217 aa		9.3	□□□□□ -0.92
LETMD1-238	ENST00000623495	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	9.3	□□□□□ -0.92
LETMD1-238	ENST00000623495	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	9.3	□□□□□ -0.92
LETMD1-238	ENST00000623495		U3KPZ7	1027 aa	Predicted RBP	9.3	□□□□□ -0.92
LETMD1-238	ENST00000623495	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	9.3	□□□□□ -0.92
LETMD1-238	ENST00000623495	NSD2	O96028	1365 aa		9.3	□□□□□ -0.92
LETMD1-238	ENST00000623495	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		9.29	□□□□□ -0.92
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		9.29	□□□□□ -0.92
LETMD1-238	ENST00000623495	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		9.29	□□□□□ -0.92
LETMD1-238	ENST00000623495	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		9.29	□□□□□ -0.92
LETMD1-238	ENST00000623495	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		9.29	□□□□□ -0.92
LETMD1-238	ENST00000623495	MYOM1	P52179	1685 aa		9.29	□□□□□ -0.92
LETMD1-238	ENST00000623495	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	9.28	□□□□□ -0.92
LETMD1-238	ENST00000623495	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	9.28	□□□□□ -0.92	2e-8	■■■□□ 17.9

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