RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399451.6

ANKRD28-201, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD28, Length 6,564 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-201ENST00000399451 CCDC112Q8NEF3 446 aa25.27■■□□□ 1.64
ANKRD28-201ENST00000399451 ATAD2Q6PL18 1390 aa25.27■■□□□ 1.64
ANKRD28-201ENST00000399451 LEKR1Q6ZMV7 388 aa25.27■■□□□ 1.64
ANKRD28-201ENST00000399451 FCHSD2O94868 740 aa25.26■■□□□ 1.63
ANKRD28-201ENST00000399451 RAI14Q9P0K7 980 aa25.26■■□□□ 1.63
ANKRD28-201ENST00000399451 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
ANKRD28-201ENST00000399451 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
ANKRD28-201ENST00000399451 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa25.26■■□□□ 1.63
ANKRD28-201ENST00000399451 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
ANKRD28-201ENST00000399451 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa25.25■■□□□ 1.63
ANKRD28-201ENST00000399451 PRXQ9BXM0 1461 aa25.25■■□□□ 1.63
ANKRD28-201ENST00000399451 SRGAP3O43295 1099 aa25.25■■□□□ 1.63
ANKRD28-201ENST00000399451 STIM1Q13586 685 aa25.25■■□□□ 1.63
ANKRD28-201ENST00000399451 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
ANKRD28-201ENST00000399451 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
ANKRD28-201ENST00000399451 TMOD2Q9NZR1 351 aa25.25■■□□□ 1.63
ANKRD28-201ENST00000399451 TOP2BQ02880 1626 aa25.24■■□□□ 1.63
ANKRD28-201ENST00000399451 PDCL3Q9H2J4 239 aa25.24■■□□□ 1.63
ANKRD28-201ENST00000399451 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
ANKRD28-201ENST00000399451 CFAP45Q9UL16 551 aa25.24■■□□□ 1.63
ANKRD28-201ENST00000399451 NSD3Q9BZ95 1437 aa25.24■■□□□ 1.63
ANKRD28-201ENST00000399451 STARD3NLO95772 234 aa25.24■■□□□ 1.63
ANKRD28-201ENST00000399451 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
ANKRD28-201ENST00000399451 CDKL5O76039 1030 aa25.23■■□□□ 1.63
ANKRD28-201ENST00000399451 PPP6R1Q9UPN7 881 aa25.23■■□□□ 1.63
ANKRD28-201ENST00000399451 NUP62CLQ9H1M0 184 aa25.23■■□□□ 1.63
ANKRD28-201ENST00000399451 IFT140Q96RY7 1462 aa25.23■■□□□ 1.63
ANKRD28-201ENST00000399451 SKIDA1Q1XH10 827 aa25.23■■□□□ 1.63
ANKRD28-201ENST00000399451 CCDC191Q8NCU4 936 aa25.23■■□□□ 1.63
ANKRD28-201ENST00000399451 TDO2P48775 406 aa25.22■■□□□ 1.63
ANKRD28-201ENST00000399451 TMEM57Q8N5G2 664 aa25.22■■□□□ 1.63
ANKRD28-201ENST00000399451 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
ANKRD28-201ENST00000399451 KRT32Q14532 448 aa25.22■■□□□ 1.63
ANKRD28-201ENST00000399451 NFE2L2Q16236 605 aa25.22■■□□□ 1.63
ANKRD28-201ENST00000399451 ZPR1O75312 459 aa25.22■■□□□ 1.63
ANKRD28-201ENST00000399451 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
ANKRD28-201ENST00000399451 UQCRHLA0A096LP55 91 aa25.21■■□□□ 1.63
ANKRD28-201ENST00000399451 UQCRHP07919 91 aa25.21■■□□□ 1.63
ANKRD28-201ENST00000399451 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
ANKRD28-201ENST00000399451 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
ANKRD28-201ENST00000399451 LRP2BPQ9P2M1 347 aa25.21■■□□□ 1.63
ANKRD28-201ENST00000399451 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.2■■□□□ 1.635e-13■□□□□ 9.7
ANKRD28-201ENST00000399451 TMPOP42166 694 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
ANKRD28-201ENST00000399451 TXLNBQ8N3L3 684 aa25.2■■□□□ 1.62
ANKRD28-201ENST00000399451 MPNDQ8N594 471 aa25.2■■□□□ 1.62
ANKRD28-201ENST00000399451 CTNNA3Q9UI47 895 aa25.2■■□□□ 1.62
ANKRD28-201ENST00000399451 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
ANKRD28-201ENST00000399451 CEP57L1Q8IYX8 460 aa25.2■■□□□ 1.62
ANKRD28-201ENST00000399451 ADAMTS2O95450 1211 aa25.2■■□□□ 1.62
ANKRD28-201ENST00000399451 DEF6Q9H4E7 631 aa25.2■■□□□ 1.62
ANKRD28-201ENST00000399451 ZNF652Q9Y2D9 606 aa25.2■■□□□ 1.62
ANKRD28-201ENST00000399451 ERLIN2O94905 339 aa25.19■■□□□ 1.62
ANKRD28-201ENST00000399451 ZNF76P36508 570 aa25.19■■□□□ 1.62
ANKRD28-201ENST00000399451 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP25.19■■□□□ 1.622e-6■■■■□ 22.8
ANKRD28-201ENST00000399451 CEP126Q9P2H0 1117 aa25.19■■□□□ 1.62
ANKRD28-201ENST00000399451 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa25.19■■□□□ 1.62
ANKRD28-201ENST00000399451 TMOD3Q9NYL9 352 aa25.18■■□□□ 1.62
ANKRD28-201ENST00000399451 CCDC181Q5TID7 509 aa25.18■■□□□ 1.62
ANKRD28-201ENST00000399451 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.17■■□□□ 1.62
ANKRD28-201ENST00000399451 ERLIN1O75477 346 aa25.17■■□□□ 1.62
ANKRD28-201ENST00000399451 KCNH5Q8NCM2 988 aa25.17■■□□□ 1.62
ANKRD28-201ENST00000399451 UBAC1Q9BSL1 405 aa25.16■■□□□ 1.62
ANKRD28-201ENST00000399451 GOLGA6L10A6NI86 522 aa25.16■■□□□ 1.62
ANKRD28-201ENST00000399451 CASTP20810 708 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
ANKRD28-201ENST00000399451 TSPYL1Q9H0U9 437 aa25.15■■□□□ 1.62
ANKRD28-201ENST00000399451 ESPNB1AK53 854 aa25.15■■□□□ 1.62
ANKRD28-201ENST00000399451 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
ANKRD28-201ENST00000399451 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
ANKRD28-201ENST00000399451 TANGO6Q9C0B7 1094 aa25.15■■□□□ 1.62
ANKRD28-201ENST00000399451 SMTNL1A8MU46 457 aa25.15■■□□□ 1.62
ANKRD28-201ENST00000399451 USP5P45974 858 aa25.14■■□□□ 1.61
ANKRD28-201ENST00000399451 NUTM1Q86Y26 1132 aa25.14■■□□□ 1.61
ANKRD28-201ENST00000399451 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.61
ANKRD28-201ENST00000399451 NESP48681 1621 aa25.13■■□□□ 1.61
ANKRD28-201ENST00000399451 GNAT3A8MTJ3 354 aa25.13■■□□□ 1.61
ANKRD28-201ENST00000399451 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
ANKRD28-201ENST00000399451 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
ANKRD28-201ENST00000399451 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
ANKRD28-201ENST00000399451 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP25.13■■□□□ 1.61
ANKRD28-201ENST00000399451 PIBF1Q8WXW3 757 aa25.13■■□□□ 1.61
ANKRD28-201ENST00000399451 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
ANKRD28-201ENST00000399451 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
ANKRD28-201ENST00000399451 MAP3K11Q16584 847 aa25.13■■□□□ 1.61
ANKRD28-201ENST00000399451 WASF1Q92558 559 aa25.13■■□□□ 1.61
ANKRD28-201ENST00000399451 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
ANKRD28-201ENST00000399451 IDH1O75874 414 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
ANKRD28-201ENST00000399451 ABCF2Q9UG63 623 aa25.12■■□□□ 1.61
ANKRD28-201ENST00000399451 NAIPQ13075 1403 aa25.12■■□□□ 1.61
ANKRD28-201ENST00000399451 SYCE3A1L190 88 aa25.12■■□□□ 1.61
ANKRD28-201ENST00000399451 RAB11FIP3O75154 756 aa25.11■■□□□ 1.61
ANKRD28-201ENST00000399451 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
ANKRD28-201ENST00000399451 ALDH1L2Q3SY69 923 aa25.11■■□□□ 1.61
ANKRD28-201ENST00000399451 MX1P20591 662 aa25.11■■□□□ 1.61
ANKRD28-201ENST00000399451 METTL24Q5JXM2 366 aa25.11■■□□□ 1.61
ANKRD28-201ENST00000399451 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa25.1■■□□□ 1.61
ANKRD28-201ENST00000399451 CCDC141Q6ZP82 1450 aa25.1■■□□□ 1.61
ANKRD28-201ENST00000399451 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
ANKRD28-201ENST00000399451 IQCEQ6IPM2 695 aa25.09■■□□□ 1.61
ANKRD28-201ENST00000399451 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa25.09■■□□□ 1.61
ANKRD28-201ENST00000399451 CHMP4BP1P59074 171 aa25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.6 ms