RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375011.3

GALNT12-201, Transcript of polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 12, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GALNT12, Length 2,735 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALNT12-201ENST00000375011 MEIS3Q99687 375 aa28.88■■■□□ 2.21
GALNT12-201ENST00000375011 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
GALNT12-201ENST00000375011 RGS12O14924 1447 aa28.87■■■□□ 2.21
GALNT12-201ENST00000375011 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
GALNT12-201ENST00000375011 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
GALNT12-201ENST00000375011 MSH6P52701 1360 aa28.86■■■□□ 2.21
GALNT12-201ENST00000375011 F6X3S4 739 aa28.86■■■□□ 2.21
GALNT12-201ENST00000375011 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP28.86■■■□□ 2.21
GALNT12-201ENST00000375011 AMPHP49418 695 aa28.86■■■□□ 2.21
GALNT12-201ENST00000375011 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
GALNT12-201ENST00000375011 G2E3Q7L622 706 aa28.86■■■□□ 2.21
GALNT12-201ENST00000375011 KIF2CQ99661 725 aa28.86■■■□□ 2.21
GALNT12-201ENST00000375011 SLC4A10Q6U841 1118 aa28.85■■■□□ 2.21
GALNT12-201ENST00000375011 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa28.85■■■□□ 2.21
GALNT12-201ENST00000375011 CHMP5Q9NZZ3 219 aa28.85■■■□□ 2.21
GALNT12-201ENST00000375011 EYA1Q99502 592 aa28.84■■■□□ 2.21
GALNT12-201ENST00000375011 DCTPP1Q9H773 170 aa28.84■■■□□ 2.21
GALNT12-201ENST00000375011 TSPYL4Q9UJ04 414 aa28.84■■■□□ 2.21
GALNT12-201ENST00000375011 USP31Q70CQ4 1352 aa28.84■■■□□ 2.21
GALNT12-201ENST00000375011 NECTIN2Q92692 538 aa28.84■■■□□ 2.21
GALNT12-201ENST00000375011 MCM4P33991 863 aa28.83■■■□□ 2.21
GALNT12-201ENST00000375011 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
GALNT12-201ENST00000375011 CRB1P82279 1406 aa28.82■■■□□ 2.2
GALNT12-201ENST00000375011 SSH2Q76I76 1423 aa28.82■■■□□ 2.2
GALNT12-201ENST00000375011 NLRP6P59044 892 aa28.82■■■□□ 2.2
GALNT12-201ENST00000375011 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP28.82■■■□□ 2.2
GALNT12-201ENST00000375011 CEP85Q6P2H3 762 aa28.81■■■□□ 2.2
GALNT12-201ENST00000375011 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP28.81■■■□□ 2.2
GALNT12-201ENST00000375011 NALCNQ8IZF0 1738 aa28.81■■■□□ 2.2
GALNT12-201ENST00000375011 ANKRD44Q8N8A2 993 aa28.8■■■□□ 2.2
GALNT12-201ENST00000375011 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP28.8■■■□□ 2.2
GALNT12-201ENST00000375011 ATP10DQ9P241 1426 aa28.8■■■□□ 2.2
GALNT12-201ENST00000375011 RGPD1P0DJD0 1748 aa28.8■■■□□ 2.2
GALNT12-201ENST00000375011 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
GALNT12-201ENST00000375011 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP28.78■■■□□ 2.2
GALNT12-201ENST00000375011 RTL1A6NKG5 1358 aa28.77■■■□□ 2.2
GALNT12-201ENST00000375011 FLT4P35916 1363 aa28.77■■■□□ 2.2
GALNT12-201ENST00000375011 KIAA0232Q92628 1395 aa28.77■■■□□ 2.2
GALNT12-201ENST00000375011 CDC45O75419 566 aa28.77■■■□□ 2.2
GALNT12-201ENST00000375011 C14orf37Q86TY3 774 aa28.76■■■□□ 2.19
GALNT12-201ENST00000375011 TBX22Q9Y458 520 aa28.76■■■□□ 2.19
GALNT12-201ENST00000375011 KCNA6P17658 529 aa28.76■■■□□ 2.19
GALNT12-201ENST00000375011 TTC21AQ8NDW8 1320 aa28.76■■■□□ 2.19
GALNT12-201ENST00000375011 SBNO1A3KN83 1393 aa28.75■■■□□ 2.19
GALNT12-201ENST00000375011 ARHGEF10O15013 1369 aa28.75■■■□□ 2.19
GALNT12-201ENST00000375011 SNX21Q969T3 373 aa28.75■■■□□ 2.19
GALNT12-201ENST00000375011 TTC22Q5TAA0 569 aa28.74■■■□□ 2.19
GALNT12-201ENST00000375011 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP28.74■■■□□ 2.19
GALNT12-201ENST00000375011 FMN2Q9NZ56 1722 aa28.74■■■□□ 2.19
GALNT12-201ENST00000375011 PTPRCP08575 1304 aa28.73■■■□□ 2.19
GALNT12-201ENST00000375011 DIP2AQ14689 1571 aa28.73■■■□□ 2.19
GALNT12-201ENST00000375011 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
GALNT12-201ENST00000375011 KIF24Q5T7B8 1368 aa28.73■■■□□ 2.19
GALNT12-201ENST00000375011 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP28.73■■■□□ 2.19
GALNT12-201ENST00000375011 USHBP1Q8N6Y0 703 aa28.73■■■□□ 2.19
GALNT12-201ENST00000375011 PLEKHG5O94827 1062 aa28.71■■■□□ 2.19
GALNT12-201ENST00000375011 IGSF1Q8N6C5 1336 aa28.71■■■□□ 2.19
GALNT12-201ENST00000375011 DDIT3P35638 169 aa28.71■■■□□ 2.19
GALNT12-201ENST00000375011 TRAK2O60296 914 aa28.7■■■□□ 2.19
GALNT12-201ENST00000375011 ABTB2Q8N961 1025 aa28.7■■■□□ 2.19
GALNT12-201ENST00000375011 PIK3C2AO00443 1686 aa28.7■■■□□ 2.18
GALNT12-201ENST00000375011 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa28.69■■■□□ 2.18
GALNT12-201ENST00000375011 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP28.69■■■□□ 2.18
GALNT12-201ENST00000375011 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP28.69■■■□□ 2.18
GALNT12-201ENST00000375011 SDSP20132 328 aa28.69■■■□□ 2.18
GALNT12-201ENST00000375011 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP28.68■■■□□ 2.18
GALNT12-201ENST00000375011 KDRP35968 1356 aa28.68■■■□□ 2.18
GALNT12-201ENST00000375011 HOXC9P31274 260 aa28.68■■■□□ 2.18
GALNT12-201ENST00000375011 TSHZ3Q63HK5 1081 aa28.68■■■□□ 2.18
GALNT12-201ENST00000375011 GAS2L2Q8NHY3 880 aa28.66■■■□□ 2.18
GALNT12-201ENST00000375011 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa28.66■■■□□ 2.18
GALNT12-201ENST00000375011 ZBTB7CA1YPR0 619 aa28.65■■■□□ 2.18
GALNT12-201ENST00000375011 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP28.65■■■□□ 2.18
GALNT12-201ENST00000375011 ARHGAP23Q9P227 1491 aa28.65■■■□□ 2.18
GALNT12-201ENST00000375011 SLIT1O75093 1534 aa28.65■■■□□ 2.18
GALNT12-201ENST00000375011 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP28.65■■■□□ 2.18
GALNT12-201ENST00000375011 IL17REQ8NFR9 667 aa28.64■■■□□ 2.18
GALNT12-201ENST00000375011 STK31Q9BXU1 1019 aa28.64■■■□□ 2.18
GALNT12-201ENST00000375011 GNAT3A8MTJ3 354 aa28.63■■■□□ 2.17
GALNT12-201ENST00000375011 AK9Q5TCS8 1911 aa28.63■■■□□ 2.17
GALNT12-201ENST00000375011 FLIIQ13045 1269 aa28.62■■■□□ 2.17
GALNT12-201ENST00000375011 USP26Q9BXU7 913 aa28.61■■■□□ 2.17
GALNT12-201ENST00000375011 CCT4P50991 539 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
GALNT12-201ENST00000375011 PANK2Q9BZ23 570 aa28.59■■■□□ 2.17
GALNT12-201ENST00000375011 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa28.58■■■□□ 2.17
GALNT12-201ENST00000375011 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa28.58■■■□□ 2.17
GALNT12-201ENST00000375011 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa28.57■■■□□ 2.16
GALNT12-201ENST00000375011 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP28.57■■■□□ 2.16
GALNT12-201ENST00000375011 HMMRO75330 724 aa28.57■■■□□ 2.16
GALNT12-201ENST00000375011 GNAI2P04899 355 aa28.57■■■□□ 2.16
GALNT12-201ENST00000375011 SSFA2P28290 1259 aa28.57■■■□□ 2.16
GALNT12-201ENST00000375011 RAB3GAP1Q15042 981 aa28.57■■■□□ 2.16
GALNT12-201ENST00000375011 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa28.57■■■□□ 2.16
GALNT12-201ENST00000375011 CCDC30Q5VVM6 783 aa28.56■■■□□ 2.16
GALNT12-201ENST00000375011 DDX11L8A8MPP1 907 aa28.55■■■□□ 2.16
GALNT12-201ENST00000375011 PDE1AP54750 535 aa28.54■■■□□ 2.16
GALNT12-201ENST00000375011 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
GALNT12-201ENST00000375011 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
GALNT12-201ENST00000375011 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
GALNT12-201ENST00000375011 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms