RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283628.9

UBP1-201, Transcript of upstream binding protein 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene UBP1, Length 2,074 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1-201ENST00000283628 RGPD1P0DJD0 1748 aa34.85■■■■□ 3.17
UBP1-201ENST00000283628 FSD2A1L4K1 749 aa34.85■■■■□ 3.17
UBP1-201ENST00000283628 TRAK2O60296 914 aa34.85■■■■□ 3.17
UBP1-201ENST00000283628 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP34.85■■■■□ 3.17
UBP1-201ENST00000283628 DCTPP1Q9H773 170 aa34.85■■■■□ 3.17
UBP1-201ENST00000283628 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa34.83■■■■□ 3.17
UBP1-201ENST00000283628 CHL1O00533 1208 aa34.83■■■■□ 3.17
UBP1-201ENST00000283628 SULT6B1Q6IMI4 303 aa34.83■■■■□ 3.17
UBP1-201ENST00000283628 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa34.83■■■■□ 3.17
UBP1-201ENST00000283628 ACEP12821 1306 aa34.83■■■■□ 3.17
UBP1-201ENST00000283628 RGS12O14924 1447 aa34.81■■■■□ 3.16
UBP1-201ENST00000283628 AEBP1Q8IUX7 1158 aa34.8■■■■□ 3.16
UBP1-201ENST00000283628 USP6P35125 1406 aa34.8■■■■□ 3.16
UBP1-201ENST00000283628 PTPRCP08575 1304 aa34.8■■■■□ 3.16
UBP1-201ENST00000283628 ANKRD44Q8N8A2 993 aa34.79■■■■□ 3.16
UBP1-201ENST00000283628 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa34.78■■■■□ 3.16
UBP1-201ENST00000283628 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP34.78■■■■□ 3.16
UBP1-201ENST00000283628 ATP10DQ9P241 1426 aa34.78■■■■□ 3.16
UBP1-201ENST00000283628 PEAK1Q9H792 1746 aa34.78■■■■□ 3.16
UBP1-201ENST00000283628 USP31Q70CQ4 1352 aa34.78■■■■□ 3.16
UBP1-201ENST00000283628 NUTM2FA1L443 756 aa34.76■■■■□ 3.16
UBP1-201ENST00000283628 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP34.76■■■■□ 3.16
UBP1-201ENST00000283628 SSH2Q76I76 1423 aa34.75■■■■□ 3.15
UBP1-201ENST00000283628 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP34.75■■■■□ 3.15
UBP1-201ENST00000283628 PTMSP20962 102 aa34.75■■■■□ 3.15
UBP1-201ENST00000283628 RAB3GAP1Q15042 981 aa34.75■■■■□ 3.15
UBP1-201ENST00000283628 GBP4Q96PP9 640 aa34.75■■■■□ 3.15
UBP1-201ENST00000283628 ANKLE2Q86XL3 938 aa34.74■■■■□ 3.15
UBP1-201ENST00000283628 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP34.74■■■■□ 3.15
UBP1-201ENST00000283628 KCNA6P17658 529 aa34.74■■■■□ 3.15
UBP1-201ENST00000283628 TTC22Q5TAA0 569 aa34.74■■■■□ 3.15
UBP1-201ENST00000283628 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP34.74■■■■□ 3.15
UBP1-201ENST00000283628 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP34.73■■■■□ 3.15
UBP1-201ENST00000283628 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP34.72■■■■□ 3.15
UBP1-201ENST00000283628 ARHGEF10O15013 1369 aa34.72■■■■□ 3.15
UBP1-201ENST00000283628 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP34.71■■■■□ 3.15
UBP1-201ENST00000283628 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP34.71■■■■□ 3.15
UBP1-201ENST00000283628 CRB1P82279 1406 aa34.71■■■■□ 3.15
UBP1-201ENST00000283628 ANKARQ7Z5J8 1434 aa34.71■■■■□ 3.15
UBP1-201ENST00000283628 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP34.7■■■■□ 3.15
UBP1-201ENST00000283628 FMN2Q9NZ56 1722 aa34.7■■■■□ 3.15
UBP1-201ENST00000283628 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP34.7■■■■□ 3.15
UBP1-201ENST00000283628 CEP85Q6P2H3 762 aa34.7■■■■□ 3.15
UBP1-201ENST00000283628 MCM10Q7L590 875 aa34.7■■■■□ 3.15
UBP1-201ENST00000283628 RTL1A6NKG5 1358 aa34.69■■■■□ 3.14
UBP1-201ENST00000283628 MSH6P52701 1360 aa34.68■■■■□ 3.14
UBP1-201ENST00000283628 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP34.67■■■■□ 3.14
UBP1-201ENST00000283628 KRT24Q2M2I5 525 aa34.67■■■■□ 3.14
UBP1-201ENST00000283628 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa34.67■■■■□ 3.14
UBP1-201ENST00000283628 MRE11P49959 708 aa34.67■■■■□ 3.14
UBP1-201ENST00000283628 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP34.66■■■■□ 3.14
UBP1-201ENST00000283628 TTC21AQ8NDW8 1320 aa34.66■■■■□ 3.14
UBP1-201ENST00000283628 RABEP1Q15276 862 aa34.65■■■■□ 3.14
UBP1-201ENST00000283628 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP34.62■■■■□ 3.13
UBP1-201ENST00000283628 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP34.62■■■■□ 3.13
UBP1-201ENST00000283628 CASC1Q6TDU7 716 aa34.61■■■■□ 3.13
UBP1-201ENST00000283628 SBNO1A3KN83 1393 aa34.6■■■■□ 3.13
UBP1-201ENST00000283628 KDRP35968 1356 aa34.6■■■■□ 3.13
UBP1-201ENST00000283628 FLT4P35916 1363 aa34.59■■■■□ 3.13
UBP1-201ENST00000283628 HMMRO75330 724 aa34.59■■■■□ 3.13
UBP1-201ENST00000283628 CLEC17AQ6ZS10 378 aa34.59■■■■□ 3.13
UBP1-201ENST00000283628 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP34.59■■■■□ 3.13
UBP1-201ENST00000283628 SLC4A2P04920 1241 aa34.58■■■■□ 3.13
UBP1-201ENST00000283628 MEIS3Q99687 375 aa34.58■■■■□ 3.13
UBP1-201ENST00000283628 USP26Q9BXU7 913 aa34.58■■■■□ 3.13
UBP1-201ENST00000283628 MAP3K19Q56UN5 1328 aa34.58■■■■□ 3.13
UBP1-201ENST00000283628 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP34.57■■■■□ 3.12
UBP1-201ENST00000283628 GAS2L2Q8NHY3 880 aa34.57■■■■□ 3.12
UBP1-201ENST00000283628 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP34.57■■■■□ 3.12
UBP1-201ENST00000283628 CCT4P50991 539 aaKnown RBP34.56■■■■□ 3.12
UBP1-201ENST00000283628 ARXQ96QS3 562 aa34.54■■■■□ 3.12
UBP1-201ENST00000283628 GRPEL1Q9HAV7 217 aa34.54■■■■□ 3.12
UBP1-201ENST00000283628 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP34.54■■■■□ 3.12
UBP1-201ENST00000283628 SDSP20132 328 aa34.54■■■■□ 3.12
UBP1-201ENST00000283628 TSPYL4Q9UJ04 414 aa34.54■■■■□ 3.12
UBP1-201ENST00000283628 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP34.53■■■■□ 3.12
UBP1-201ENST00000283628 PIK3C2AO00443 1686 aa34.53■■■■□ 3.12
UBP1-201ENST00000283628 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP34.52■■■■□ 3.12
UBP1-201ENST00000283628 PANK2Q9BZ23 570 aa34.52■■■■□ 3.12
UBP1-201ENST00000283628 FOXD4L1Q9NU39 408 aa34.52■■■■□ 3.12
UBP1-201ENST00000283628 GOLGA6L22H0YM25 854 aa34.51■■■■□ 3.12
UBP1-201ENST00000283628 IGSF1Q8N6C5 1336 aa34.51■■■■□ 3.11
UBP1-201ENST00000283628 LRRC37A3O60309 1634 aa34.5■■■■□ 3.11
UBP1-201ENST00000283628 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP34.5■■■■□ 3.11
UBP1-201ENST00000283628 OSBPL3Q9H4L5 887 aa34.5■■■■□ 3.11
UBP1-201ENST00000283628 REC8O95072 547 aa34.49■■■■□ 3.11
UBP1-201ENST00000283628 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP34.48■■■■□ 3.11
UBP1-201ENST00000283628 USP54Q70EL1 1684 aa34.48■■■■□ 3.11
UBP1-201ENST00000283628 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP34.48■■■■□ 3.11
UBP1-201ENST00000283628 SSFA2P28290 1259 aa34.47■■■■□ 3.11
UBP1-201ENST00000283628 FOXO3O43524 673 aa34.46■■■■□ 3.11
UBP1-201ENST00000283628 MIS18AQ9NYP9 233 aa34.46■■■■□ 3.11
UBP1-201ENST00000283628 SOX12O15370 315 aa34.46■■■■□ 3.11
UBP1-201ENST00000283628 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa34.45■■■■□ 3.11
UBP1-201ENST00000283628 NUCB2P80303 420 aa34.45■■■■□ 3.11
UBP1-201ENST00000283628 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP34.44■■■■□ 3.1
UBP1-201ENST00000283628 G2E3Q7L622 706 aa34.44■■■■□ 3.1
UBP1-201ENST00000283628 STK31Q9BXU1 1019 aa34.44■■■■□ 3.1
UBP1-201ENST00000283628 ST18O60284 1047 aa34.43■■■■□ 3.1
UBP1-201ENST00000283628 AMPHP49418 695 aa34.43■■■■□ 3.1
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