RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000227638.7

PANX1-201, Transcript of pannexin 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PANX1, Length 2,769 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PANX1-201ENST00000227638 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
PANX1-201ENST00000227638 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa22.53■■□□□ 1.2
PANX1-201ENST00000227638 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
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PANX1-201ENST00000227638 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
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PANX1-201ENST00000227638 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
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PANX1-201ENST00000227638 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa22.5■■□□□ 1.19
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PANX1-201ENST00000227638 AKAP12Q02952 1782 aa22.44■■□□□ 1.18
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PANX1-201ENST00000227638 ZBTB7CA1YPR0 619 aa22.44■■□□□ 1.18
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PANX1-201ENST00000227638 RTL1A6NKG5 1358 aa22.44■■□□□ 1.18
PANX1-201ENST00000227638 C14orf37Q86TY3 774 aa22.43■■□□□ 1.18
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PANX1-201ENST00000227638 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
PANX1-201ENST00000227638 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa22.39■■□□□ 1.18
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PANX1-201ENST00000227638 OVOS2Q6IE36 1432 aa22.38■■□□□ 1.17
PANX1-201ENST00000227638 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
PANX1-201ENST00000227638 KCNA6P17658 529 aa22.38■■□□□ 1.17
PANX1-201ENST00000227638 ERBB4Q15303 1308 aa22.38■■□□□ 1.17
PANX1-201ENST00000227638 NLRP6P59044 892 aa22.38■■□□□ 1.17
PANX1-201ENST00000227638 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
PANX1-201ENST00000227638 PEAK1Q9H792 1746 aa22.37■■□□□ 1.17
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PANX1-201ENST00000227638 GBP4Q96PP9 640 aa22.37■■□□□ 1.17
PANX1-201ENST00000227638 CRB1P82279 1406 aa22.36■■□□□ 1.17
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PANX1-201ENST00000227638 RILPL2Q969X0 211 aa22.34■■□□□ 1.17
PANX1-201ENST00000227638 UNC5CLQ8IV45 518 aa22.34■■□□□ 1.17
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PANX1-201ENST00000227638 PALD1Q9ULE6 856 aa22.33■■□□□ 1.17
PANX1-201ENST00000227638 MRE11P49959 708 aa22.33■■□□□ 1.17
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PANX1-201ENST00000227638 PDE1AP54750 535 aa22.33■■□□□ 1.16
PANX1-201ENST00000227638 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.16
PANX1-201ENST00000227638 TBX22Q9Y458 520 aa22.33■■□□□ 1.16
PANX1-201ENST00000227638 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
PANX1-201ENST00000227638 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
PANX1-201ENST00000227638 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
PANX1-201ENST00000227638 IL25Q9H293 177 aa22.32■■□□□ 1.16
PANX1-201ENST00000227638 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa22.31■■□□□ 1.16
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