RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000059272.9

Hoxd9-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd9, Length 2,136 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 EspnQ9ET47 871 aa29.63■■■□□ 2.33
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 NudcO35685 332 aaKnown RBP29.61■■■□□ 2.33
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 CastP51125 788 aa29.61■■■□□ 2.33
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Tspyl2Q7TQI8 677 aa29.61■■■□□ 2.33
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Zranb3Q6NZP1 1069 aa29.6■■■□□ 2.33
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ggt6Q6PDE7 497 aa29.6■■■□□ 2.33
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ccdc171E9Q1U1 1324 aa29.6■■■□□ 2.33
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Trpm3Q5F4S9 1721 aa29.59■■■□□ 2.33
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ahnak2E9PYB0 1738 aaKnown RBP29.58■■■□□ 2.33
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Plekhd1B2RPU2 505 aa29.58■■■□□ 2.33
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Arfgef2A2A5R2 1792 aa29.57■■■□□ 2.32
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Amotl1Q9D4H4 968 aa29.57■■■□□ 2.32
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Chmp5Q9D7S9 219 aa29.57■■■□□ 2.32
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Polr3glQ8R0C0 218 aa29.54■■■□□ 2.32
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Rbm25B2RY56 838 aaKnown RBP29.54■■■□□ 2.32
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Zpr1Q62384 459 aa29.53■■■□□ 2.32
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Nyap1Q6PFX7 833 aa29.53■■■□□ 2.32
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ipo9Q91YE6 1041 aa29.53■■■□□ 2.32
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Snap23O09044 210 aa29.52■■■□□ 2.32
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 ThemisQ8BGW0 636 aa29.52■■■□□ 2.32
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Nup153E9Q3G8 1462 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.31
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Sema6bO54951 886 aa29.5■■■□□ 2.31
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Duxf3A0A0N4SV92 674 aa29.5■■■□□ 2.31
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Zeb2Q9R0G7 1215 aa29.5■■■□□ 2.31
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Rtf1A2AQ19 715 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Cc2d1aQ8K1A6 943 aa29.47■■■□□ 2.31
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Trim26Q99PN3 545 aa29.47■■■□□ 2.31
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Cntnap1O54991 1385 aa29.47■■■□□ 2.31
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gnai1B2RSH2 354 aa29.46■■■□□ 2.31
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gnai3Q9DC51 354 aa29.46■■■□□ 2.31
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Fam50bQ9WTJ8 334 aa29.46■■■□□ 2.31
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 B4galnt3Q6L8S8 986 aa29.45■■■□□ 2.31
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Nhsl1Q8CAF4 1587 aa29.45■■■□□ 2.31
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Aox2Q5SGK3 1345 aa29.45■■■□□ 2.3
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ccdc60Q8C4J0 545 aa29.43■■■□□ 2.3
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 MypopQ8R4U1 393 aa29.43■■■□□ 2.3
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Cdc37l1Q9CZP7 335 aa29.43■■■□□ 2.3
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Psrc1Q9D0P7 329 aa29.43■■■□□ 2.3
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Adgrb1Q3UHD1 1582 aa29.42■■■□□ 2.3
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Emilin2Q8K482 1074 aa29.42■■■□□ 2.3
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 4930572O03RikQ8C5Y0 211 aa29.42■■■□□ 2.3
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Lrp6O88572 1613 aa29.41■■■□□ 2.3
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 G3bp1P97855 465 aaKnown RBP29.41■■■□□ 2.3
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Tnks1bp1P58871 1720 aa29.41■■■□□ 2.3
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Sos1Q62245 1319 aa29.41■■■□□ 2.3
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Tns2Q8CGB6 1400 aa29.4■■■□□ 2.3
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Shank2Q80Z38 1476 aa29.39■■■□□ 2.3
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ccdc129Q14B48 1034 aa29.39■■■□□ 2.3
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Klhdc4Q921I2 584 aa29.38■■■□□ 2.29
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Rlbp1Q9Z275 317 aa29.38■■■□□ 2.29
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Prim1P20664 417 aa29.38■■■□□ 2.29
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ggnbp2Q5SV77 696 aa29.38■■■□□ 2.29
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Fbxo41Q6NS60 873 aa29.38■■■□□ 2.29
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Eno4Q8C042 619 aa29.37■■■□□ 2.29
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Dbr1Q923B1 550 aa29.37■■■□□ 2.29
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Pdzd9Q9D9M4 266 aa29.36■■■□□ 2.29
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Senp3Q9EP97 568 aaKnown RBP29.36■■■□□ 2.29
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Hs1bp3Q3TC93 395 aa29.36■■■□□ 2.29
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Abcc12Q80WJ6 1366 aa29.35■■■□□ 2.29
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Phkg2Q9DB30 406 aa29.35■■■□□ 2.29
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Akap11E9Q777 1895 aa29.35■■■□□ 2.29
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Vamp4O70480 141 aa29.35■■■□□ 2.29
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Atl3Q91YH5 541 aa29.35■■■□□ 2.29
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Nkx2-3P97334 362 aa29.34■■■□□ 2.29
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 U2surpQ6NV83 1029 aaKnown RBP29.33■■■□□ 2.29
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Speer4bQ9D9F7 267 aa29.33■■■□□ 2.29
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Cavin2Q63918 418 aaKnown RBP29.33■■■□□ 2.29
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Cypt2Q6P924 180 aa29.33■■■□□ 2.29
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Usp16Q99LG0 825 aa29.33■■■□□ 2.29
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Plekhm2Q80TQ5 1018 aa29.31■■■□□ 2.28
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Pm20d1Q8C165 503 aa29.31■■■□□ 2.28
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm21680A0A0G2JGR8 267 aa29.3■■■□□ 2.28
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 InhbeO08717 350 aa29.29■■■□□ 2.28
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Sf3b2Q3UJB0 878 aaKnown RBP29.29■■■□□ 2.28
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Larp1Q6ZQ58 1072 aaKnown RBP29.29■■■□□ 2.28
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Fnbp4Q6ZQ03 1031 aa29.28■■■□□ 2.28
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Maco1Q7TQE6 664 aaKnown RBP29.28■■■□□ 2.28
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Eif3bQ8JZQ9 803 aaKnown RBP29.28■■■□□ 2.28
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Aldh1l1Q8R0Y6 902 aa29.28■■■□□ 2.28
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ppp1r3fQ9JIG4 799 aa29.28■■■□□ 2.28
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Fer1l6E0CZ42 1862 aa29.28■■■□□ 2.28
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Nsd3Q6P2L6 1439 aa29.27■■■□□ 2.28
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Chmp7Q8R1T1 451 aa29.27■■■□□ 2.28
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Myo5bP21271 1818 aa29.27■■■□□ 2.28
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Asic4Q7TNS7 539 aa29.27■■■□□ 2.28
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Kcnh4A2A5F7 1018 aa29.26■■■□□ 2.27
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ssfa2Q922B9 1252 aa29.26■■■□□ 2.27
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Tmc1Q8R4P5 757 aa29.26■■■□□ 2.27
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm6268A2A3U9 297 aa29.25■■■□□ 2.27
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Chmp4bQ9D8B3 224 aaKnown RBP29.25■■■□□ 2.27
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 KarsQ99MN1 595 aaKnown RBP29.24■■■□□ 2.27
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Foxp4Q9DBY0 795 aaKnown RBP29.24■■■□□ 2.27
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Q3UPC7 1272 aa29.24■■■□□ 2.27
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Tnrc6cQ3UHC0 1690 aaKnown RBP29.23■■■□□ 2.27
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Pibf1E9Q6K3 756 aa29.23■■■□□ 2.27
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ginm1Q91WR6 327 aa29.23■■■□□ 2.27
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Sik1Q60670 779 aa29.22■■■□□ 2.27
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Cacna1sQ02789 1880 aa29.22■■■□□ 2.27
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Kat6bQ8BRB7 1872 aa29.22■■■□□ 2.27
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Mst1rQ62190 1378 aa29.21■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 16.1 ms