Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC52.97■■■■■ 6.07
Cacna1sQ02789 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC49.49■■■■■ 5.51
Cacna1sQ02789 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.33■■■■■ 5.33
Cacna1sQ02789 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC46.41■■■■■ 5.02
Cacna1sQ02789 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC45.66■■■■■ 4.9
Cacna1sQ02789 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.85■■■■■ 4.77
Cacna1sQ02789 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC44.75■■■■■ 4.75
Cacna1sQ02789 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC44.61■■■■■ 4.73
Cacna1sQ02789 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
Cacna1sQ02789 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.49■■■■■ 4.71
Cacna1sQ02789 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC44.08■■■■■ 4.65
Cacna1sQ02789 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC43.44■■■■■ 4.54
Cacna1sQ02789 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.95■■■■■ 4.47
Cacna1sQ02789 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC42.93■■■■■ 4.46
Cacna1sQ02789 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
Cacna1sQ02789 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
Cacna1sQ02789 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
Cacna1sQ02789 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
Cacna1sQ02789 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
Cacna1sQ02789 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC42.07■■■■■ 4.33
Cacna1sQ02789 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC42.02■■■■■ 4.32
Cacna1sQ02789 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC42.01■■■■■ 4.32
Cacna1sQ02789 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
Cacna1sQ02789 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.26■■■■■ 4.19
Cacna1sQ02789 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
Cacna1sQ02789 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
Cacna1sQ02789 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
Cacna1sQ02789 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.85■■■■■ 4.13
Cacna1sQ02789 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
Cacna1sQ02789 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC40.57■■■■■ 4.08
Cacna1sQ02789 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC40.53■■■■■ 4.08
Cacna1sQ02789 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
Cacna1sQ02789 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC40.5■■■■■ 4.07
Cacna1sQ02789 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC40.44■■■■■ 4.06
Cacna1sQ02789 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
Cacna1sQ02789 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
Cacna1sQ02789 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.1■■■■■ 4.01
Cacna1sQ02789 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC40.07■■■■■ 4
Cacna1sQ02789 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
Cacna1sQ02789 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC40.03■■■■■ 4
Cacna1sQ02789 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC40.02■■■■■ 4
Cacna1sQ02789 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC40.02■■■■■ 4
Cacna1sQ02789 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
Cacna1sQ02789 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
Cacna1sQ02789 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.85■■■■□ 3.97
Cacna1sQ02789 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC39.84■■■■□ 3.97
Cacna1sQ02789 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.82■■■■□ 3.97
Cacna1sQ02789 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC39.81■■■■□ 3.96
Cacna1sQ02789 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC39.68■■■■□ 3.94
Cacna1sQ02789 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC39.55■■■■□ 3.92
Cacna1sQ02789 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC39.47■■■■□ 3.91
Cacna1sQ02789 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
Cacna1sQ02789 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
Cacna1sQ02789 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
Cacna1sQ02789 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
Cacna1sQ02789 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
Cacna1sQ02789 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC39.18■■■■□ 3.86
Cacna1sQ02789 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
Cacna1sQ02789 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
Cacna1sQ02789 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
Cacna1sQ02789 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC38.94■■■■□ 3.82
Cacna1sQ02789 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC38.87■■■■□ 3.81
Cacna1sQ02789 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
Cacna1sQ02789 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC38.81■■■■□ 3.8
Cacna1sQ02789 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC38.77■■■■□ 3.8
Cacna1sQ02789 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC38.77■■■■□ 3.8
Cacna1sQ02789 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.79
Cacna1sQ02789 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Cacna1sQ02789 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
Cacna1sQ02789 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Cacna1sQ02789 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC38.46■■■■□ 3.75
Cacna1sQ02789 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
Cacna1sQ02789 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
Cacna1sQ02789 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
Cacna1sQ02789 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Cacna1sQ02789 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Cacna1sQ02789 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC38.19■■■■□ 3.7
Cacna1sQ02789 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
Cacna1sQ02789 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Cacna1sQ02789 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Cacna1sQ02789 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
Cacna1sQ02789 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
Cacna1sQ02789 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
Cacna1sQ02789 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
Cacna1sQ02789 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC37.88■■■■□ 3.65
Cacna1sQ02789 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.65
Cacna1sQ02789 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC37.86■■■■□ 3.65
Cacna1sQ02789 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
Cacna1sQ02789 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
Cacna1sQ02789 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.64
Cacna1sQ02789 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Cacna1sQ02789 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Cacna1sQ02789 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Cacna1sQ02789 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC37.68■■■■□ 3.62
Cacna1sQ02789 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC37.68■■■■□ 3.62
Cacna1sQ02789 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Cacna1sQ02789 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
Cacna1sQ02789 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Cacna1sQ02789 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC37.66■■■■□ 3.62
Cacna1sQ02789 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms