RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000042312.13

Trafd1-201, Transcript of TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trafd1, Length 2,503 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Mdc1Q5PSV9 1707 aa27.34■■□□□ 1.97
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Dnajc5gQ8C632 165 aa27.33■■□□□ 1.97
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Adgrb1Q3UHD1 1582 aa27.33■■□□□ 1.97
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Anapc15-psA0A140T8L6 141 aa27.33■■□□□ 1.97
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Pdia3P27773 505 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
Trafd1-201ENSMUST00000042312 DekQ7TNV0 380 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Phf23Q8BSN5 401 aa27.33■■□□□ 1.97
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Chd2E9PZM4 1827 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Slit3Q9WVB4 1523 aa27.32■■□□□ 1.96
Trafd1-201ENSMUST00000042312 N4bp2F8VQG7 1678 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Sox12Q04890 314 aa27.31■■□□□ 1.96
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tet3Q8BG87 1668 aa27.31■■□□□ 1.96
Trafd1-201ENSMUST00000042312 AU015836B2RUM3 263 aa27.31■■□□□ 1.96
Trafd1-201ENSMUST00000042312 1700010I14RikQ7TPG0 532 aa27.3■■□□□ 1.96
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cc2d1aQ8K1A6 943 aa27.3■■□□□ 1.96
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Mcm2P97310 904 aa27.3■■□□□ 1.96
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Nucb1Q02819 459 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Atg4a-psA0A0G2JFS9 396 aa27.29■■□□□ 1.96
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Atg4aQ8C9S8 396 aa27.29■■□□□ 1.96
Trafd1-201ENSMUST00000042312 PzpQ61838 1495 aa27.28■■□□□ 1.96
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Sirt1Q923E4 737 aa27.28■■□□□ 1.96
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Phf14Q9D4H9 881 aa27.28■■□□□ 1.96
Trafd1-201ENSMUST00000042312 NalcnQ8BXR5 1738 aa27.27■■□□□ 1.96
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Sv2bQ8BG39 683 aa27.27■■□□□ 1.96
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Casq1O09165 405 aa27.26■■□□□ 1.95
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rtf1A2AQ19 715 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Bloc1s4Q8VED2 215 aa27.26■■□□□ 1.95
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Nckap5lQ6GQX2 1323 aa27.25■■□□□ 1.95
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Map2P20357 1828 aa27.25■■□□□ 1.95
Trafd1-201ENSMUST00000042312 CalcaP70160 136 aa27.25■■□□□ 1.95
Trafd1-201ENSMUST00000042312 CemipQ8BI06 1361 aa27.25■■□□□ 1.95
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Eya1P97767 591 aa27.24■■□□□ 1.95
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cyp46a1Q9WVK8 500 aa27.24■■□□□ 1.95
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ubr1O70481 1757 aa27.24■■□□□ 1.95
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rreb1Q3UH06 1700 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Fam83gQ5SWY7 812 aa27.24■■□□□ 1.95
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Pik3c2aQ61194 1686 aa27.23■■□□□ 1.95
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Kcnn1Q9EQR3 537 aa27.23■■□□□ 1.95
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Znf335A2A5K6 1337 aa27.23■■□□□ 1.95
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cabp4Q8VHC5 271 aa27.23■■□□□ 1.95
Trafd1-201ENSMUST00000042312 FancaQ9JL70 1439 aa27.23■■□□□ 1.95
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cdk12Q14AX6 1484 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Dennd6aQ8BH65 605 aa27.22■■□□□ 1.95
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Bcar3Q9QZK2 820 aa27.22■■□□□ 1.95
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Camta1A2A891 1682 aa27.22■■□□□ 1.95
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Vsig10D3YX43 558 aa27.22■■□□□ 1.95
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Plppr3Q7TPB0 716 aa27.22■■□□□ 1.95
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Q9D2X8 372 aa27.22■■□□□ 1.95
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Larp1bA0A0A6YXJ7 370 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Idi1P58044 227 aa27.21■■□□□ 1.95
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Bag4Q8CI61 457 aa27.2■■□□□ 1.94
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Nlgn1Q99K10 843 aa27.2■■□□□ 1.94
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm21190A0A0G2JGJ6 266 aa27.18■■□□□ 1.94
Trafd1-201ENSMUST00000042312 SlkO54988 1233 aa27.18■■□□□ 1.94
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ccne1Q61457 408 aa27.18■■□□□ 1.94
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Elp1Q7TT37 1333 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Kif20aP97329 887 aa27.16■■□□□ 1.94
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Q3TQI7 289 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cyp27a1Q9DBG1 533 aa27.16■■□□□ 1.94
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Slit2Q9R1B9 1521 aa27.15■■□□□ 1.94
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Msh6P54276 1358 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rasa1E9PYG6 1038 aa27.15■■□□□ 1.94
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Prune1Q8BIW1 454 aa27.15■■□□□ 1.94
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Pdcl3Q8BVF2 240 aa27.15■■□□□ 1.94
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Abcc10Q8R4P9 1501 aa27.15■■□□□ 1.94
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Col16a1Q8BLX7 1580 aa27.14■■□□□ 1.94
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Srgap3Q812A2 1099 aa27.14■■□□□ 1.94
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gnai2P08752 355 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.93
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ppp1r42Q8R1Z4 357 aa27.13■■□□□ 1.93
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Erc2Q6PH08 957 aa27.12■■□□□ 1.93
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Safb2Q80YR5 991 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Zkscan1Q8BGS3 561 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Nphp1Q9QY53 687 aa27.12■■□□□ 1.93
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Foxp4Q9DBY0 795 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Frmpd2A0A140LI67 1392 aa27.1■■□□□ 1.93
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Zkscan16A2ALW2 728 aa27.1■■□□□ 1.93
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tnnt1O88346 262 aa27.1■■□□□ 1.93
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Isy1Q69ZQ2 285 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
Trafd1-201ENSMUST00000042312 RestQ8VIG1 1082 aa27.1■■□□□ 1.93
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tmx3Q8BXZ1 456 aa27.09■■□□□ 1.93
Trafd1-201ENSMUST00000042312 D430041D05RikF6ZGR6 1678 aa27.09■■□□□ 1.93
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Adamtsl3G3UXC7 1706 aa27.09■■□□□ 1.93
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Hmox1P14901 289 aa27.09■■□□□ 1.93
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Igsf1Q7TQA1 1317 aa27.08■■□□□ 1.93
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Scn7aB1AYL1 1681 aa27.08■■□□□ 1.93
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm10563F6WIE4 79 aa27.08■■□□□ 1.92
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tmem132eQ6IEE6 982 aa27.08■■□□□ 1.92
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cyp2d12Q8BVD2 504 aa27.08■■□□□ 1.92
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Paxip1Q6NZQ4 1056 aa27.07■■□□□ 1.92
Trafd1-201ENSMUST00000042312 PtprvP70289 1705 aa27.07■■□□□ 1.92
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Arap3Q8R5G7 1538 aa27.07■■□□□ 1.92
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Hoxc9P09633 260 aa27.07■■□□□ 1.92
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ptpdc1Q6NZK8 747 aa27.07■■□□□ 1.92
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gdpd2Q9ESM6 539 aa27.07■■□□□ 1.92
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Zkscan2G3X952 960 aa27.06■■□□□ 1.92
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Zdhhc9P59268 364 aa27.06■■□□□ 1.92
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Trpm3Q5F4S9 1721 aa27.06■■□□□ 1.92
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Mmp8O70138 465 aa27.06■■□□□ 1.92
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Chpf2Q3UU43 768 aa27.06■■□□□ 1.92
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Chmp4cQ9D7F7 232 aa27.06■■□□□ 1.92
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