Protein–RNA interactions for Protein: Q8VIG1

Rest, RE1-silencing transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RestQ8VIG1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC44.5■■■■■ 4.71
RestQ8VIG1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
RestQ8VIG1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
RestQ8VIG1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
RestQ8VIG1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.35■■■■■ 4.05
RestQ8VIG1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
RestQ8VIG1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC39.5■■■■□ 3.91
RestQ8VIG1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC38.89■■■■□ 3.82
RestQ8VIG1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
RestQ8VIG1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC38.81■■■■□ 3.8
RestQ8VIG1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC38.33■■■■□ 3.73
RestQ8VIG1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
RestQ8VIG1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC38.08■■■■□ 3.69
RestQ8VIG1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
RestQ8VIG1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
RestQ8VIG1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
RestQ8VIG1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
RestQ8VIG1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
RestQ8VIG1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
RestQ8VIG1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
RestQ8VIG1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
RestQ8VIG1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
RestQ8VIG1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
RestQ8VIG1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
RestQ8VIG1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
RestQ8VIG1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
RestQ8VIG1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
RestQ8VIG1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
RestQ8VIG1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
RestQ8VIG1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
RestQ8VIG1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
RestQ8VIG1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
RestQ8VIG1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
RestQ8VIG1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
RestQ8VIG1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
RestQ8VIG1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
RestQ8VIG1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC36.3■■■■□ 3.4
RestQ8VIG1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
RestQ8VIG1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
RestQ8VIG1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
RestQ8VIG1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
RestQ8VIG1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
RestQ8VIG1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
RestQ8VIG1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
RestQ8VIG1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
RestQ8VIG1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
RestQ8VIG1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
RestQ8VIG1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
RestQ8VIG1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC35.49■■■■□ 3.27
RestQ8VIG1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
RestQ8VIG1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
RestQ8VIG1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
RestQ8VIG1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
RestQ8VIG1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
RestQ8VIG1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
RestQ8VIG1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
RestQ8VIG1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
RestQ8VIG1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
RestQ8VIG1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
RestQ8VIG1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
RestQ8VIG1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
RestQ8VIG1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
RestQ8VIG1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
RestQ8VIG1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
RestQ8VIG1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
RestQ8VIG1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
RestQ8VIG1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34.77■■■■□ 3.16
RestQ8VIG1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
RestQ8VIG1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
RestQ8VIG1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
RestQ8VIG1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
RestQ8VIG1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
RestQ8VIG1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
RestQ8VIG1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
RestQ8VIG1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
RestQ8VIG1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
RestQ8VIG1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
RestQ8VIG1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
RestQ8VIG1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
RestQ8VIG1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
RestQ8VIG1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
RestQ8VIG1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
RestQ8VIG1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
RestQ8VIG1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
RestQ8VIG1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
RestQ8VIG1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
RestQ8VIG1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
RestQ8VIG1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
RestQ8VIG1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
RestQ8VIG1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
RestQ8VIG1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
RestQ8VIG1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
RestQ8VIG1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
RestQ8VIG1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
RestQ8VIG1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
RestQ8VIG1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
RestQ8VIG1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
RestQ8VIG1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
RestQ8VIG1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
RestQ8VIG1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC33.8■■■■□ 3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms