RNA–Protein interactions for RNA: YOL093W

TRM10, Transcript of tRNA methyltransferase, yeastyeast

Gene TRM10, Length 882 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TRM10YOL093W DMA2P53924 522 aa6.33□□□□□ -1.4
TRM10YOL093W SPT7P35177 1332 aa6.32□□□□□ -1.4
TRM10YOL093W PPH3P32345 308 aa6.32□□□□□ -1.4
TRM10YOL093W RTG2P32608 588 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
TRM10YOL093W SFA1P32771 386 aa6.32□□□□□ -1.4
TRM10YOL093W ENP1P38333 483 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
TRM10YOL093W ATG32P40458 529 aa6.32□□□□□ -1.4
TRM10YOL093W BRE4Q07660 1125 aa6.32□□□□□ -1.4
TRM10YOL093W SWI5P08153 709 aa6.31□□□□□ -1.4
TRM10YOL093W YML133CQ03099 1374 aa6.31□□□□□ -1.4
TRM10YOL093W YLL067CQ07888 1374 aa6.31□□□□□ -1.4
TRM10YOL093W YLL066CQ99208 1374 aa6.31□□□□□ -1.4
TRM10YOL093W CBC2Q08920 208 aaKnown RBP RIP-Chip data6.3□□□□□ -1.4not detected
TRM10YOL093W URB1P34241 1764 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
TRM10YOL093W KAR2P16474 682 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
TRM10YOL093W MLF3P32047 452 aa6.29□□□□□ -1.4
TRM10YOL093W GRX4P32642 244 aa6.29□□□□□ -1.4
TRM10YOL093W SIS2P36024 562 aa6.29□□□□□ -1.4
TRM10YOL093W UBP5P39944 805 aa6.29□□□□□ -1.4
TRM10YOL093W TAP42Q04372 366 aa6.28□□□□□ -1.4
TRM10YOL093W MRX10Q05648 414 aa6.28□□□□□ -1.4
TRM10YOL093W YIL177CP40434 1758 aa6.27□□□□□ -1.41
TRM10YOL093W YJL225CP40889 1758 aa6.27□□□□□ -1.41
TRM10YOL093W ENO1P00924 437 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
TRM10YOL093W YFL034WP43564 1073 aa6.27□□□□□ -1.41
TRM10YOL093W YGR130CP53278 816 aa6.27□□□□□ -1.41
TRM10YOL093W APC1P53886 1748 aa6.26□□□□□ -1.41
TRM10YOL093W RDS2P19541 446 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
TRM10YOL093W PRP45P28004 379 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
TRM10YOL093W PRP43P53131 767 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
TRM10YOL093W RPO41P13433 1351 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
TRM10YOL093W RPS24AP0CX31 135 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
TRM10YOL093W RPS24BP0CX32 135 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
TRM10YOL093W MCM1P11746 286 aa6.24□□□□□ -1.41
TRM10YOL093W PRP5P21372 849 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
TRM10YOL093W RNQ1P25367 405 aa6.24□□□□□ -1.41
TRM10YOL093W SAF1P38352 637 aa6.24□□□□□ -1.41
TRM10YOL093W MAG2Q06436 670 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
TRM10YOL093W NGR1P32831 672 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
TRM10YOL093W NCL1P38205 684 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
TRM10YOL093W PAP2P53632 584 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
TRM10YOL093W RSF2P46974 1380 aa6.22□□□□□ -1.41
TRM10YOL093W CHS2P14180 963 aa6.22□□□□□ -1.41
TRM10YOL093W RSC6P25632 483 aa6.22□□□□□ -1.41
TRM10YOL093W AIM9P40053 627 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
TRM10YOL093W IOC4Q04213 475 aa6.22□□□□□ -1.41
TRM10YOL093W Q0182Q9ZZW1 134 aa6.22□□□□□ -1.41
TRM10YOL093W AUS1Q08409 1394 aa6.21□□□□□ -1.41
TRM10YOL093W MTO1P53070 669 aa6.21□□□□□ -1.42
TRM10YOL093W RPS6AP0CX37 236 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
TRM10YOL093W RPS6BP0CX38 236 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
TRM10YOL093W PEP12P32854 288 aa6.2□□□□□ -1.42
TRM10YOL093W GAS4Q08271 471 aa6.2□□□□□ -1.42
TRM10YOL093W RPP0P05317 312 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
TRM10YOL093W SLM3Q12093 417 aa6.19□□□□□ -1.42
TRM10YOL093W TSC13Q99190 310 aa6.19□□□□□ -1.42
TRM10YOL093W SIR4P11978 1358 aa6.18□□□□□ -1.42
TRM10YOL093W YEF3P16521 1044 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
TRM10YOL093W YKL222CP35995 705 aa6.18□□□□□ -1.42
TRM10YOL093W RTR1P40084 226 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
TRM10YOL093W EDE1P34216 1381 aa6.18□□□□□ -1.42
TRM10YOL093W ROM2P51862 1356 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
TRM10YOL093W CYC7P00045 113 aa6.17□□□□□ -1.42
TRM10YOL093W YCR015CP25616 317 aa6.17□□□□□ -1.42
TRM10YOL093W AKR1P39010 764 aa6.17□□□□□ -1.42
TRM10YOL093W SKP1P52286 194 aa6.17□□□□□ -1.42
TRM10YOL093W IMH1Q06704 911 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
TRM10YOL093W ENT1Q12518 454 aa6.17□□□□□ -1.42
TRM10YOL093W RIM15P43565 1770 aa6.16□□□□□ -1.42
TRM10YOL093W HAP4P14064 554 aa6.16□□□□□ -1.42
TRM10YOL093W PHO87P25360 923 aa6.16□□□□□ -1.42
TRM10YOL093W MEC3Q02574 474 aa6.16□□□□□ -1.42
TRM10YOL093W HIM1Q06674 414 aa6.16□□□□□ -1.42
TRM10YOL093W YDL144CQ07589 356 aa6.16□□□□□ -1.42
TRM10YOL093W NTH2P35172 780 aa6.15□□□□□ -1.42
TRM10YOL093W VPS27P40343 622 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
TRM10YOL093W XKS1P42826 600 aa6.15□□□□□ -1.42
TRM10YOL093W GIS1Q03833 894 aa6.15□□□□□ -1.42
TRM10YOL093W CDC45Q08032 650 aa6.15□□□□□ -1.42
TRM10YOL093W YRF1-3P0CX14 1859 aa6.15□□□□□ -1.43
TRM10YOL093W YRF1-7P0CX15 1859 aa6.15□□□□□ -1.43
TRM10YOL093W YRF1-6P53819 1859 aa6.15□□□□□ -1.43
TRM10YOL093W MRP10O75012 95 aa6.14□□□□□ -1.43
TRM10YOL093W KTR7P40504 517 aa6.14□□□□□ -1.43
TRM10YOL093W CTF4Q01454 927 aa6.14□□□□□ -1.43
TRM10YOL093W CUS1Q02554 436 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
TRM10YOL093W PUF3Q07807 879 aaKnown RBP RIP-Chip data6.14□□□□□ -1.43not detected
TRM10YOL093W TY1A-NL1Q12391 440 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
TRM10YOL093W YRF1-4O13559 1382 aa6.14□□□□□ -1.43
TRM10YOL093W NAM7P30771 971 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
TRM10YOL093W AKL1P38080 1108 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
TRM10YOL093W YRB30P53107 440 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
TRM10YOL093W SLP1Q12232 587 aa6.13□□□□□ -1.43
TRM10YOL093W CYT1P07143 309 aa6.12□□□□□ -1.43
TRM10YOL093W GAL2P13181 574 aa6.12□□□□□ -1.43
TRM10YOL093W TTI1P36097 1038 aa6.12□□□□□ -1.43
TRM10YOL093W YFR016CP43597 1233 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
TRM10YOL093W SPO74P45819 413 aa6.12□□□□□ -1.43
TRM10YOL093W YNR040WP53736 256 aa6.12□□□□□ -1.43
TRM10YOL093W SEG2P34250 1132 aa6.11□□□□□ -1.43
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