RNA–Protein interactions for RNA: YOL077C

BRX1, Transcript of Nucleolar protein, yeastyeast

Gene BRX1, Length 876 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BRX1YOL077C ERS1P17261 260 aa5.38□□□□□ -1.55
BRX1YOL077C YKL077WP36081 392 aa5.38□□□□□ -1.55
BRX1YOL077C LSB3P43603 459 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
BRX1YOL077C GCV1P48015 400 aa5.38□□□□□ -1.55
BRX1YOL077C ULP1Q02724 621 aa5.38□□□□□ -1.55
BRX1YOL077C MCA1Q08601 432 aa5.38□□□□□ -1.55
BRX1YOL077C KIP3P53086 805 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
BRX1YOL077C ARI1P53111 347 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
BRX1YOL077C PEX13P80667 386 aa5.37□□□□□ -1.55
BRX1YOL077C UGA4P32837 571 aa5.36□□□□□ -1.55
BRX1YOL077C FAA3P39002 694 aa5.36□□□□□ -1.55
BRX1YOL077C CCT8P47079 568 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
BRX1YOL077C YJR107WP47145 328 aa5.36□□□□□ -1.55
BRX1YOL077C YGR122WP53272 402 aa5.36□□□□□ -1.55
BRX1YOL077C YOR223WQ12015 292 aa5.36□□□□□ -1.55
BRX1YOL077C COQ2P32378 372 aa5.35□□□□□ -1.55
BRX1YOL077C ATG14P38270 344 aa5.35□□□□□ -1.55
BRX1YOL077C RPS26AP39938 119 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
BRX1YOL077C RPS26BP39939 119 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
BRX1YOL077C MEC3Q02574 474 aa5.35□□□□□ -1.55
BRX1YOL077C YPL034WQ03083 165 aa5.35□□□□□ -1.55
BRX1YOL077C TOS4Q06266 489 aa5.35□□□□□ -1.55
BRX1YOL077C RRP15Q06511 250 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
BRX1YOL077C HXK1P04806 485 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
BRX1YOL077C MSH3P25336 1018 aa5.34□□□□□ -1.55
BRX1YOL077C REI1P38344 393 aaPredicted RBP5.34□□□□□ -1.55
BRX1YOL077C MRPS18P42847 217 aa5.34□□□□□ -1.55
BRX1YOL077C YPL109CQ02981 657 aa5.34□□□□□ -1.55
BRX1YOL077C ADI1Q03677 179 aa5.34□□□□□ -1.55
BRX1YOL077C MCD1Q12158 566 aa5.34□□□□□ -1.55
BRX1YOL077C REC8Q12188 680 aa5.34□□□□□ -1.55
BRX1YOL077C TY1A-LR4P0C2I8 440 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
BRX1YOL077C TY1A-DR6P0CX70 440 aa5.33□□□□□ -1.56
BRX1YOL077C TY1A-ER1P0CX71 440 aa5.33□□□□□ -1.56
BRX1YOL077C TY1A-LR2P0CX72 440 aa5.33□□□□□ -1.56
BRX1YOL077C TY1A-PLP0CX73 440 aa5.33□□□□□ -1.56
BRX1YOL077C TY1A-JR1P0CX74 440 aa5.33□□□□□ -1.56
BRX1YOL077C TY1A-LR3P0CX75 440 aa5.33□□□□□ -1.56
BRX1YOL077C TY1A-ML2P0CX76 440 aa5.33□□□□□ -1.56
BRX1YOL077C MCM2P29469 868 aa5.33□□□□□ -1.56
BRX1YOL077C SEC8P32855 1065 aa5.33□□□□□ -1.56
BRX1YOL077C ARL1P38116 183 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
BRX1YOL077C EXO5P38289 585 aa5.33□□□□□ -1.56
BRX1YOL077C AKR1P39010 764 aa5.33□□□□□ -1.56
BRX1YOL077C MTR4P47047 1073 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
BRX1YOL077C NCE103P53615 221 aa5.33□□□□□ -1.56
BRX1YOL077C NOG1Q02892 647 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
BRX1YOL077C OYE2Q03558 400 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
BRX1YOL077C TY1A-GR1Q12085 440 aa5.33□□□□□ -1.56
BRX1YOL077C TY1A-PR3Q6Q5H1 440 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
BRX1YOL077C TY1A-OLQ92392 440 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
BRX1YOL077C SBP1P10080 294 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
BRX1YOL077C PRE9P23638 258 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
BRX1YOL077C PEP7P32609 515 aa5.32□□□□□ -1.56
BRX1YOL077C PEX28P38848 579 aa5.32□□□□□ -1.56
BRX1YOL077C DOT1Q04089 582 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
BRX1YOL077C AVO1Q08236 1176 aa5.32□□□□□ -1.56
BRX1YOL077C ALG6Q12001 544 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
BRX1YOL077C RAD2P07276 1031 aa5.31□□□□□ -1.56
BRX1YOL077C VMA4P22203 233 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
BRX1YOL077C FYV10P40492 516 aa5.31□□□□□ -1.56
BRX1YOL077C SPR28Q04921 423 aa5.31□□□□□ -1.56
BRX1YOL077C GLT1Q12680 2145 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
BRX1YOL077C CYC8P14922 966 aa5.3□□□□□ -1.56
BRX1YOL077C SAF1P38352 637 aa5.3□□□□□ -1.56
BRX1YOL077C SLS1P42900 643 aa5.3□□□□□ -1.56
BRX1YOL077C ESF1Q06344 628 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
BRX1YOL077C GIC2Q06648 383 aa5.3□□□□□ -1.56
BRX1YOL077C SCP160P06105 1222 aaKnown RBP RIP-Chip data5.29□□□□□ -1.56not detected
BRX1YOL077C CHS2P14180 963 aa5.29□□□□□ -1.56
BRX1YOL077C NAM7P30771 971 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
BRX1YOL077C GPT2P36148 743 aa5.29□□□□□ -1.56
BRX1YOL077C YGL140CP53120 1219 aa5.29□□□□□ -1.56
BRX1YOL077C PGM1P33401 570 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
BRX1YOL077C KAE1P36132 386 aa5.28□□□□□ -1.56
BRX1YOL077C NEM1P38757 446 aa5.28□□□□□ -1.56
BRX1YOL077C ELA1P53861 379 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
BRX1YOL077C PUF3Q07807 879 aaKnown RBP RIP-Chip data5.28□□□□□ -1.56not detected
BRX1YOL077C LAP2Q10740 671 aa5.28□□□□□ -1.56
BRX1YOL077C HSE1P38753 452 aa5.27□□□□□ -1.57
BRX1YOL077C YAR028WP39548 234 aa5.27□□□□□ -1.57
BRX1YOL077C PIC2P40035 300 aa5.27□□□□□ -1.57
BRX1YOL077C XKS1P42826 600 aa5.27□□□□□ -1.57
BRX1YOL077C SPO74P45819 413 aa5.27□□□□□ -1.57
BRX1YOL077C YGR045CP53229 120 aa5.27□□□□□ -1.57
BRX1YOL077C RMD1Q03441 430 aa5.27□□□□□ -1.57
BRX1YOL077C UTP5Q04177 643 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
BRX1YOL077C TAF13P11747 167 aa5.26□□□□□ -1.57
BRX1YOL077C SNU71P53207 620 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
BRX1YOL077C YNR063WP53749 607 aa5.26□□□□□ -1.57
BRX1YOL077C YLR122CQ12312 125 aa5.26□□□□□ -1.57
BRX1YOL077C SEC23P15303 768 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
BRX1YOL077C NNK1P36003 928 aa5.25□□□□□ -1.57
BRX1YOL077C ADD66P36040 267 aa5.25□□□□□ -1.57
BRX1YOL077C MSH4P40965 878 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
BRX1YOL077C MMM1P41800 426 aa5.25□□□□□ -1.57
BRX1YOL077C MRL1Q06815 381 aa5.25□□□□□ -1.57
BRX1YOL077C DED1P06634 604 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
BRX1YOL077C RPS4AP0CX35 261 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
BRX1YOL077C RPS4BP0CX36 261 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 16.7 ms