RNA–Protein interactions for RNA: YJR132W

NMD5, Transcript of Karyopherin, yeast

Gene NMD5, Length 3,147 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NMD5	YJR132W	SEN2	P16658	377 aa		7.4	□□□□□ -1.23
NMD5	YJR132W	MNR2	P35724	969 aa		7.4	□□□□□ -1.23
NMD5	YJR132W	JNM1	P36224	373 aa		7.4	□□□□□ -1.23
NMD5	YJR132W	PEX8	P53248	589 aa		7.4	□□□□□ -1.23
NMD5	YJR132W	VMS1	Q04311	632 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.23
NMD5	YJR132W	YGR161W-C	Q3E744	92 aa		7.4	□□□□□ -1.23
NMD5	YJR132W	ITR1	P30605	584 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NMD5	YJR132W	YIL055C	P40523	627 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
NMD5	YJR132W	FOL1	P53848	824 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NMD5	YJR132W	PXA2	P34230	853 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NMD5	YJR132W	RRN3	P36070	627 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NMD5	YJR132W	VPS70	P47161	811 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NMD5	YJR132W	RAD27	P26793	382 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NMD5	YJR132W	SLX1	P38324	304 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NMD5	YJR132W	PET100	P38958	111 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NMD5	YJR132W	NDE1	P40215	560 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NMD5	YJR132W	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
NMD5	YJR132W	HAS1	Q03532	505 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
NMD5	YJR132W	PDI1	P17967	522 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
NMD5	YJR132W	GLN1	P32288	370 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
NMD5	YJR132W	SWH1	P35845	1188 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NMD5	YJR132W	MIA40	P36046	403 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NMD5	YJR132W	POP2	P39008	433 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NMD5	YJR132W	BUD6	P41697	788 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NMD5	YJR132W	SPO20	Q04359	397 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NMD5	YJR132W	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
NMD5	YJR132W	PLC1	P32383	869 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NMD5	YJR132W	CCL1	P37366	393 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NMD5	YJR132W	MNN1	P39106	762 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NMD5	YJR132W	SPC72	P39723	622 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NMD5	YJR132W	YRB1	P41920	201 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
NMD5	YJR132W	INP52	P50942	1183 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NMD5	YJR132W	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
NMD5	YJR132W	NOC3	Q07896	663 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
NMD5	YJR132W	RTC5	Q12108	567 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
NMD5	YJR132W	ENT1	Q12518	454 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NMD5	YJR132W	NDC80	P40460	691 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NMD5	YJR132W	SAP155	P43612	1002 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NMD5	YJR132W	ADA2	Q02336	434 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NMD5	YJR132W	PIF1	P07271	859 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NMD5	YJR132W	RGP1	P16664	663 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NMD5	YJR132W	MTC2	P34246	357 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NMD5	YJR132W	CTM1	P38818	585 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NMD5	YJR132W	SAE2	P46946	345 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NMD5	YJR132W	ECM11	Q04110	302 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NMD5	YJR132W	FUS2	Q05670	677 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NMD5	YJR132W	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	7.37	□□□□□ -1.23	not detected
NMD5	YJR132W	OCA4	P25366	362 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NMD5	YJR132W	DNL4	Q08387	944 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
NMD5	YJR132W	YMR084W	A2P2R3	262 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NMD5	YJR132W	SMC2	P38989	1170 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
NMD5	YJR132W	YJL070C	P40361	888 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NMD5	YJR132W	RSM25	P40496	264 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NMD5	YJR132W	YPP1	P46951	817 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NMD5	YJR132W	YJL055W	P47044	245 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NMD5	YJR132W	BNA1	P47096	177 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NMD5	YJR132W	SDA1	P53313	767 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
NMD5	YJR132W	SEC5	P89102	971 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NMD5	YJR132W	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
NMD5	YJR132W	TRP2	P00899	507 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
NMD5	YJR132W	RAD4	P14736	754 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NMD5	YJR132W	KRE6	P32486	720 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NMD5	YJR132W	SET3	P36124	751 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NMD5	YJR132W	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
NMD5	YJR132W	AGX1	P43567	385 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NMD5	YJR132W	BDF2	Q07442	638 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NMD5	YJR132W	BRX1	Q08235	291 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
NMD5	YJR132W	YPL277C	Q08989	487 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NMD5	YJR132W	TRM1	P15565	570 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
NMD5	YJR132W	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
NMD5	YJR132W	CPS1	P27614	576 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NMD5	YJR132W	YKL100C	P34248	587 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NMD5	YJR132W	RSM7	P47150	247 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NMD5	YJR132W	YIG1	Q08956	461 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NMD5	YJR132W	STH1	P32597	1359 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NMD5	YJR132W	OLA1	P38219	394 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
NMD5	YJR132W	BIM1	P40013	344 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NMD5	YJR132W	IML2	P47031	731 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NMD5	YJR132W	YMR018W	Q04364	514 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NMD5	YJR132W	CST9	Q06032	482 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NMD5	YJR132W	TAF3	Q12297	353 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NMD5	YJR132W	TEF1	P02994	458 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
NMD5	YJR132W	CLB1	P24868	471 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NMD5	YJR132W	SMY2	P32909	740 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
NMD5	YJR132W	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
NMD5	YJR132W	CIR2	Q08822	631 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NMD5	YJR132W	GNT1	Q12096	491 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NMD5	YJR132W	PHM7	Q12252	991 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NMD5	YJR132W	SEC39	Q12745	709 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NMD5	YJR132W	RAD50	P12753	1312 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NMD5	YJR132W	RSC6	P25632	483 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NMD5	YJR132W	YKL222C	P35995	705 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NMD5	YJR132W	UIP5	P36137	443 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NMD5	YJR132W	UGA2	P38067	497 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NMD5	YJR132W	VAC8	P39968	578 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NMD5	YJR132W	RET2	P43621	546 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NMD5	YJR132W	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
NMD5	YJR132W	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
NMD5	YJR132W	NOP4	P37838	685 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.24
NMD5	YJR132W	SAP185	P40856	1058 aa		7.34	□□□□□ -1.24

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