RNA–Protein interactions for RNA: YJL197W

UBP12, Transcript of Ubiquitin-specific protease, yeast

Gene UBP12, Length 3,765 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UBP12	YJL197W	MSN1	P22148	382 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBP12	YJL197W	RVS167	P39743	482 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
UBP12	YJL197W	PFD1	P46988	109 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBP12	YJL197W	SPT16	P32558	1035 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
UBP12	YJL197W	PEX6	P33760	1030 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBP12	YJL197W	MKS1	P34072	584 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBP12	YJL197W	SUM1	P46676	1062 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBP12	YJL197W	ARH1	P48360	493 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBP12	YJL197W	EAF1	Q06337	982 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBP12	YJL197W	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
UBP12	YJL197W	TIF11	P38912	153 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
UBP12	YJL197W	DAS1	P47005	663 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBP12	YJL197W	IES5	P40060	125 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBP12	YJL197W	NUT1	P53114	1132 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBP12	YJL197W	MRL1	Q06815	381 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBP12	YJL197W	ARE1	P25628	610 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBP12	YJL197W	RPN12	P32496	274 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBP12	YJL197W	MTC2	P34246	357 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBP12	YJL197W	IOC2	Q12072	812 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBP12	YJL197W	SEC23	P15303	768 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
UBP12	YJL197W	LYP1	P32487	611 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBP12	YJL197W	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
UBP12	YJL197W	SAP155	P43612	1002 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBP12	YJL197W	RTA1	P53047	317 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBP12	YJL197W	NYV1	Q12255	253 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBP12	YJL197W	NUP145	P49687	1317 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBP12	YJL197W	UGA4	P32837	571 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBP12	YJL197W	VBA5	P36172	582 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBP12	YJL197W	ISW1	P38144	1129 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBP12	YJL197W	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
UBP12	YJL197W	NIT1	P40447	199 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBP12	YJL197W	YNL193W	P53870	558 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBP12	YJL197W	UME1	Q03010	460 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBP12	YJL197W	PMT7	Q06644	662 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBP12	YJL197W	GIC2	Q06648	383 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBP12	YJL197W	YDL124W	Q07551	312 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
UBP12	YJL197W	REC8	Q12188	680 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBP12	YJL197W	TRP2	P00899	507 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
UBP12	YJL197W	QDR2	P40474	542 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBP12	YJL197W	XKS1	P42826	600 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBP12	YJL197W	UBX4	P54730	416 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBP12	YJL197W	HIR1	P32479	840 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBP12	YJL197W	SQT1	P35184	431 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBP12	YJL197W	ECM2	P38241	364 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
UBP12	YJL197W	PEA2	P40091	420 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBP12	YJL197W	SIW14	P53965	281 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBP12	YJL197W	IES1	P43579	692 aa		4.52	□□□□□ -1.69
UBP12	YJL197W	MTR4	P47047	1073 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
UBP12	YJL197W	YDL129W	Q07555	291 aa		4.52	□□□□□ -1.69
UBP12	YJL197W	THI73	Q07904	523 aa		4.52	□□□□□ -1.69
UBP12	YJL197W	SRF1	Q12516	437 aa		4.52	□□□□□ -1.69
UBP12	YJL197W	YBR071W	P38243	211 aa		4.52	□□□□□ -1.69
UBP12	YJL197W	GDH3	P39708	457 aa		4.52	□□□□□ -1.69
UBP12	YJL197W	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
UBP12	YJL197W	APP1	P53933	587 aa		4.52	□□□□□ -1.69
UBP12	YJL197W	CTR9	P89105	1077 aa		4.52	□□□□□ -1.69
UBP12	YJL197W	SYH1	Q02875	849 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
UBP12	YJL197W	GIP1	P38229	639 aa		4.52	□□□□□ -1.69
UBP12	YJL197W	AIM21	P40563	679 aa		4.52	□□□□□ -1.69
UBP12	YJL197W	MAL11	P53048	616 aa		4.52	□□□□□ -1.69
UBP12	YJL197W	COG6	P53959	839 aa		4.52	□□□□□ -1.69
UBP12	YJL197W	SND1	Q04007	877 aa		4.52	□□□□□ -1.69
UBP12	YJL197W	YOR296W	Q08748	1289 aa		4.52	□□□□□ -1.69
UBP12	YJL197W	PIF1	P07271	859 aa		4.51	□□□□□ -1.69
UBP12	YJL197W	SEA4	P38164	1038 aa		4.51	□□□□□ -1.69
UBP12	YJL197W	MDM12	Q92328	271 aa		4.51	□□□□□ -1.69
UBP12	YJL197W	BET3	P36149	193 aa		4.51	□□□□□ -1.69
UBP12	YJL197W	ALO1	P54783	526 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
UBP12	YJL197W	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
UBP12	YJL197W	RTG1	P32607	177 aa		4.51	□□□□□ -1.69
UBP12	YJL197W	MRT4	P33201	236 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
UBP12	YJL197W	HXT13	P39924	564 aa		4.51	□□□□□ -1.69
UBP12	YJL197W	DLD3	P39976	496 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
UBP12	YJL197W	RSM26	P47141	266 aa		4.51	□□□□□ -1.69
UBP12	YJL197W	YJR120W	P47157	116 aa		4.51	□□□□□ -1.69
UBP12	YJL197W	MON1	P53129	644 aa		4.51	□□□□□ -1.69
UBP12	YJL197W	HXT17	P53631	564 aa		4.51	□□□□□ -1.69
UBP12	YJL197W	HXT15	P54854	567 aa		4.51	□□□□□ -1.69
UBP12	YJL197W	NOG1	Q02892	647 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
UBP12	YJL197W	MTC5	Q03897	1148 aa		4.51	□□□□□ -1.69
UBP12	YJL197W	ENT2	Q05785	613 aa		4.51	□□□□□ -1.69
UBP12	YJL197W	Q0182	Q9ZZW1	134 aa		4.51	□□□□□ -1.69
UBP12	YJL197W	AIM46	P38885	310 aa		4.5	□□□□□ -1.69
UBP12	YJL197W	VNX1	P42839	908 aa		4.5	□□□□□ -1.69
UBP12	YJL197W	GPG1	P53130	126 aa		4.5	□□□□□ -1.69
UBP12	YJL197W	TRE2	Q08693	809 aa		4.5	□□□□□ -1.69
UBP12	YJL197W	FAP7	Q12055	197 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
UBP12	YJL197W	COB	P00163	385 aa		4.5	□□□□□ -1.69
UBP12	YJL197W	SST2	P11972	698 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
UBP12	YJL197W	HSC82	P15108	705 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
UBP12	YJL197W	RPC31	P17890	251 aa		4.5	□□□□□ -1.69
UBP12	YJL197W	KAP122	P32767	1081 aa		4.5	□□□□□ -1.69
UBP12	YJL197W	ABD1	P32783	436 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
UBP12	YJL197W	PIN4	P34217	668 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.5	□□□□□ -1.69	not detected
UBP12	YJL197W	PTH2	P34222	208 aa		4.5	□□□□□ -1.69
UBP12	YJL197W	RER2	P35196	286 aa		4.5	□□□□□ -1.69
UBP12	YJL197W	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.5	□□□□□ -1.69	not detected
UBP12	YJL197W	HDA2	Q06629	674 aa		4.5	□□□□□ -1.69
UBP12	YJL197W	YLR001C	Q07895	862 aa		4.5	□□□□□ -1.69
UBP12	YJL197W	YEF3	P16521	1044 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69

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