RNA–Protein interactions for RNA: YHR103W

SBE22, Transcript of Protein involved in bud growth, yeast

Gene SBE22, Length 2,559 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SBE22	YHR103W	NHA1	Q99271	985 aa		2.68	□□□□□ -1.98
SBE22	YHR103W	VAN1	P23642	535 aa		2.68	□□□□□ -1.98
SBE22	YHR103W	PUF6	Q04373	656 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
SBE22	YHR103W	TY1A-NL1	Q12391	440 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
SBE22	YHR103W	NCL1	P38205	684 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
SBE22	YHR103W	GIP1	P38229	639 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SBE22	YHR103W	CTH1	P47976	325 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SBE22	YHR103W	RRM3	P38766	723 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SBE22	YHR103W	BIO5	P53744	561 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
SBE22	YHR103W	YSP2	Q06681	1438 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SBE22	YHR103W	TRP3	P00937	484 aa		2.66	□□□□□ -1.98
SBE22	YHR103W	YTA6	P40328	754 aa		2.66	□□□□□ -1.98
SBE22	YHR103W	INP51	P40559	946 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
SBE22	YHR103W	YKR073C	P36153	106 aa		2.66	□□□□□ -1.98
SBE22	YHR103W	TED1	P40533	473 aa		2.66	□□□□□ -1.98
SBE22	YHR103W	PDR5	P33302	1511 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
SBE22	YHR103W	MET1	P36150	593 aa		2.65	□□□□□ -1.98
SBE22	YHR103W	SUB2	Q07478	446 aa	Known RBP	2.65	□□□□□ -1.98
SBE22	YHR103W	MNL2	Q12205	849 aa		2.65	□□□□□ -1.98
SBE22	YHR103W	LSO1	Q3E827	93 aa		2.65	□□□□□ -1.98
SBE22	YHR103W	RRP5	Q05022	1729 aa	Known RBP	2.65	□□□□□ -1.99
SBE22	YHR103W	SRS2	P12954	1174 aa		2.65	□□□□□ -1.99
SBE22	YHR103W	POL5	P39985	1022 aa	Known RBP	2.65	□□□□□ -1.99
SBE22	YHR103W	ARI1	P53111	347 aa	Known RBP	2.65	□□□□□ -1.99
SBE22	YHR103W	TIF6	Q12522	245 aa	Known RBP	2.65	□□□□□ -1.99
SBE22	YHR103W	TRS33	Q99394	268 aa		2.65	□□□□□ -1.99
SBE22	YHR103W	GCN2	P15442	1659 aa		2.65	□□□□□ -1.99
SBE22	YHR103W	TAT1	P38085	619 aa		2.64	□□□□□ -1.99
SBE22	YHR103W	DYS1	P38791	387 aa		2.64	□□□□□ -1.99
SBE22	YHR103W	GIP2	P40036	548 aa		2.64	□□□□□ -1.99
SBE22	YHR103W	NCE103	P53615	221 aa		2.64	□□□□□ -1.99
SBE22	YHR103W	YNR065C	P53751	1116 aa		2.64	□□□□□ -1.99
SBE22	YHR103W	ALO1	P54783	526 aa	Known RBP	2.64	□□□□□ -1.99
SBE22	YHR103W	PUN1	Q06991	263 aa		2.64	□□□□□ -1.99
SBE22	YHR103W	SAC7	P17121	654 aa		2.64	□□□□□ -1.99
SBE22	YHR103W	PPT1	P53043	513 aa		2.64	□□□□□ -1.99
SBE22	YHR103W	PNP1	Q05788	311 aa		2.64	□□□□□ -1.99
SBE22	YHR103W	YLR122C	Q12312	125 aa		2.64	□□□□□ -1.99
SBE22	YHR103W	NUP192	P47054	1683 aa		2.63	□□□□□ -1.99
SBE22	YHR103W	NAM7	P30771	971 aa	Known RBP	2.63	□□□□□ -1.99
SBE22	YHR103W	SFA1	P32771	386 aa		2.63	□□□□□ -1.99
SBE22	YHR103W	ISW1	P38144	1129 aa		2.63	□□□□□ -1.99
SBE22	YHR103W	SOK2	P53438	785 aa	Predicted RBP	2.63	□□□□□ -1.99
SBE22	YHR103W	SOG2	Q08817	791 aa		2.63	□□□□□ -1.99
SBE22	YHR103W	LDH1	P38139	375 aa		2.63	□□□□□ -1.99
SBE22	YHR103W	HXT8	P40886	569 aa		2.63	□□□□□ -1.99
SBE22	YHR103W	TRL1	P09880	827 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
SBE22	YHR103W	ERS1	P17261	260 aa		2.62	□□□□□ -1.99
SBE22	YHR103W	PAN5	P38787	379 aa		2.62	□□□□□ -1.99
SBE22	YHR103W	NTA1	P40354	457 aa		2.62	□□□□□ -1.99
SBE22	YHR103W	YMR074C	Q04773	145 aa		2.62	□□□□□ -1.99
SBE22	YHR103W	TAF7	Q05021	590 aa		2.62	□□□□□ -1.99
SBE22	YHR103W	SLP1	Q12232	587 aa		2.62	□□□□□ -1.99
SBE22	YHR103W	YJL181W	P46987	611 aa		2.62	□□□□□ -1.99
SBE22	YHR103W	GPI13	Q07830	1017 aa		2.62	□□□□□ -1.99
SBE22	YHR103W	REC8	Q12188	680 aa		2.62	□□□□□ -1.99
SBE22	YHR103W	RPP1A	P05318	106 aa	Predicted RBP	2.61	□□□□□ -1.99
SBE22	YHR103W	GLO4	Q12320	285 aa		2.61	□□□□□ -1.99
SBE22	YHR103W	GEA1	P47102	1408 aa	Predicted RBP	2.61	□□□□□ -1.99
SBE22	YHR103W	PYC2	P32327	1180 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
SBE22	YHR103W	YJR124C	P47159	448 aa		2.61	□□□□□ -1.99
SBE22	YHR103W	FUS1	P11710	512 aa		2.6	□□□□□ -1.99
SBE22	YHR103W	HAS1	Q03532	505 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
SBE22	YHR103W	CFT1	Q06632	1357 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
SBE22	YHR103W	RIM11	P38615	370 aa		2.6	□□□□□ -1.99
SBE22	YHR103W	PSY2	P40164	858 aa		2.6	□□□□□ -1.99
SBE22	YHR103W	SUT1	P53032	299 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
SBE22	YHR103W	SBP1	P10080	294 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
SBE22	YHR103W	THI12	P42883	340 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SBE22	YHR103W	THI5	P43534	340 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SBE22	YHR103W	THI11	P47183	340 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SBE22	YHR103W	HGH1	P48362	394 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
SBE22	YHR103W	THI13	Q07748	340 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SBE22	YHR103W	PUF3	Q07807	879 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.59	□□□□□ -1.99	not detected
SBE22	YHR103W	PRP5	P21372	849 aa	Predicted RBP	2.59	□□□□□ -1.99
SBE22	YHR103W	CWH41	P53008	833 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SBE22	YHR103W	RSC4	Q02206	625 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SBE22	YHR103W	CMR1	Q12510	522 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
SBE22	YHR103W	URB1	P34241	1764 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
SBE22	YHR103W	MAG2	Q06436	670 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
SBE22	YHR103W	PDR11	P40550	1411 aa		2.58	□□□□□ -2
SBE22	YHR103W	FKS3	Q04952	1785 aa		2.58	□□□□□ -2
SBE22	YHR103W	SSA4	P22202	642 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
SBE22	YHR103W	SAF1	P38352	637 aa		2.58	□□□□□ -2
SBE22	YHR103W	AIM46	P38885	310 aa		2.58	□□□□□ -2
SBE22	YHR103W	TOS4	Q06266	489 aa		2.58	□□□□□ -2
SBE22	YHR103W	GUP1	P53154	560 aa		2.57	□□□□□ -2
SBE22	YHR103W	FRT1	Q99332	602 aa		2.57	□□□□□ -2
SBE22	YHR103W	SNF2	P22082	1703 aa		2.57	□□□□□ -2
SBE22	YHR103W	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
SBE22	YHR103W	IRS4	P36115	615 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
SBE22	YHR103W	RAD55	P38953	406 aa		2.57	□□□□□ -2
SBE22	YHR103W	MDJ2	P42834	146 aa		2.57	□□□□□ -2
SBE22	YHR103W	SRB8	P25648	1427 aa		2.57	□□□□□ -2
SBE22	YHR103W	SSA1	P10591	642 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
SBE22	YHR103W	LRG1	P35688	1017 aa		2.56	□□□□□ -2
SBE22	YHR103W	OMA1	P36163	345 aa		2.56	□□□□□ -2
SBE22	YHR103W	SAP155	P43612	1002 aa		2.56	□□□□□ -2
SBE22	YHR103W	DSE4	P53753	1117 aa		2.56	□□□□□ -2
SBE22	YHR103W	PUB1	P32588	453 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.56	□□□□□ -2	not detected

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 51.1 ms