RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525151.5

TRAF3IP2-AS1-208, TRAF3IP2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAF3IP2-AS1, Length 609 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 BCL9O00512 1426 aa25.21■■□□□ 1.63
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 MTFR1LQ9H019 292 aa25.21■■□□□ 1.63
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 MAP3K5Q99683 1374 aa25.2■■□□□ 1.63
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 TXNRD1Q16881 649 aa25.2■■□□□ 1.62
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 COL24A1Q17RW2 1714 aa25.2■■□□□ 1.62
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 DDB1Q16531 1140 aa25.19■■□□□ 1.62
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 ABTB2Q8N961 1025 aa25.19■■□□□ 1.62
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 GCP02774 474 aa25.18■■□□□ 1.62
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 STK32BQ9NY57 414 aa25.18■■□□□ 1.62
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 ARXQ96QS3 562 aa25.16■■□□□ 1.62
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 CDK19Q9BWU1 502 aa25.15■■□□□ 1.62
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 AATKQ6ZMQ8 1374 aa25.15■■□□□ 1.62
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 PLEKHG3A1L390 1219 aa25.14■■□□□ 1.62
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 NHSQ6T4R5 1651 aa25.13■■□□□ 1.61
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 SLIT3O75094 1523 aa25.12■■□□□ 1.61
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa25.09■■□□□ 1.61
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 QSER1Q2KHR3 1735 aa25.09■■□□□ 1.61
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 AXIN2Q9Y2T1 843 aa25.09■■□□□ 1.61
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 CCDC61Q9Y6R9 512 aa25.09■■□□□ 1.61
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 BTAF1O14981 1849 aa25.09■■□□□ 1.61
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 GPR162Q16538 588 aa25.08■■□□□ 1.61
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 NLRP13Q86W25 1043 aa25.08■■□□□ 1.61
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa25.07■■□□□ 1.6
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 PIK3C2AO00443 1686 aa25.07■■□□□ 1.6
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 ZBTB7CA1YPR0 619 aa25.05■■□□□ 1.6
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 ZNF827Q17R98 1081 aa25.05■■□□□ 1.6
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa25.05■■□□□ 1.6
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 WDR17Q8IZU2 1322 aa25.04■■□□□ 1.6
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 KAT6BQ8WYB5 2073 aa25.03■■□□□ 1.6
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa25.01■■□□□ 1.59
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 NLGN2Q8NFZ4 835 aa25■■□□□ 1.59
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 DCAF11Q8TEB1 546 aa25■■□□□ 1.59
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa25■■□□□ 1.59
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 LRRC4BQ9NT99 713 aa24.98■■□□□ 1.59
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 TNS2Q63HR2 1409 aa24.96■■□□□ 1.59
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP24.96■■□□□ 1.59
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 USP6P35125 1406 aa24.95■■□□□ 1.59
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 NLRP6P59044 892 aa24.95■■□□□ 1.58
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 ACSBG1Q96GR2 724 aa24.95■■□□□ 1.58
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 CARD10Q9BWT7 1032 aa24.95■■□□□ 1.58
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 KLHL34Q8N239 644 aa24.94■■□□□ 1.58
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 ABCC6O95255 1503 aa24.94■■□□□ 1.58
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 EXOC5O00471 708 aa24.93■■□□□ 1.58
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 AKT1S1Q96B36 256 aa24.93■■□□□ 1.58
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 ATP10DQ9P241 1426 aa24.93■■□□□ 1.58
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 QRICH2Q9H0J4 1663 aa24.92■■□□□ 1.58
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 ARHGEF25Q86VW2 580 aa24.92■■□□□ 1.58
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa24.91■■□□□ 1.58
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa24.89■■□□□ 1.58
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 CABP2Q9NPB3 220 aa24.89■■□□□ 1.58
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 NFAT5O94916 1531 aa24.88■■□□□ 1.57
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 HSPA6P17066 643 aa24.88■■□□□ 1.57
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 SLC16A10Q8TF71 515 aa24.86■■□□□ 1.57
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 LY75O60449 1722 aa24.85■■□□□ 1.57
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 ADCY9O60503 1353 aa24.84■■□□□ 1.57
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 CCDC7Q96M83 1385 aa24.84■■□□□ 1.57
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 CABP1Q9NZU7 370 aa24.84■■□□□ 1.57
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa24.82■■□□□ 1.56
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 POLD1P28340 1107 aa24.82■■□□□ 1.56
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 STAC3Q96MF2 364 aa24.82■■□□□ 1.56
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 GRIN3BO60391 1043 aa24.8■■□□□ 1.56
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 KCNQ4P56696 695 aa24.8■■□□□ 1.56
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 NBPF1Q3BBV0 1214 aa24.8■■□□□ 1.56
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 LTN1O94822 1766 aa24.8■■□□□ 1.56
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 SOX12O15370 315 aa24.79■■□□□ 1.56
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 DOT1LQ8TEK3 1739 aa24.75■■□□□ 1.55
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 KCNH5Q8NCM2 988 aa24.74■■□□□ 1.55
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa24.74■■□□□ 1.55
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa24.73■■□□□ 1.55
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 SLC27A3Q5K4L6 730 aa24.73■■□□□ 1.55
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 USP54Q70EL1 1684 aa24.72■■□□□ 1.55
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa24.72■■□□□ 1.55
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 ERBB3P21860 1342 aa24.71■■□□□ 1.55
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 IL2RBP14784 551 aa24.7■■□□□ 1.54
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 MON2Q7Z3U7 1717 aa24.69■■□□□ 1.54
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 KIF3CO14782 793 aa24.69■■□□□ 1.54
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa24.69■■□□□ 1.54
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 NSD2O96028 1365 aa24.68■■□□□ 1.54
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 NLRP2Q9NX02 1062 aa24.67■■□□□ 1.54
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 PCNTO95613 3336 aa24.66■■□□□ 1.54
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 TAF1LQ8IZX4 1826 aa24.66■■□□□ 1.54
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 MSL1Q68DK7 614 aa24.65■■□□□ 1.54
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 C5P01031 1676 aa24.63■■□□□ 1.53
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 RGPD2P0DJD1 1756 aa24.63■■□□□ 1.53
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 TTC21AQ8NDW8 1320 aa24.62■■□□□ 1.53
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 WDR90Q96KV7 1748 aa24.61■■□□□ 1.53
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 CD2APQ9Y5K6 639 aa24.6■■□□□ 1.53
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa24.6■■□□□ 1.53
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.9 ms