RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427220.5

TTLL3-210, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTLL3, Length 3,233 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL3-210ENST00000427220 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa24.75■■□□□ 1.55
TTLL3-210ENST00000427220 NINLQ9Y2I6 1382 aa24.75■■□□□ 1.55
TTLL3-210ENST00000427220 ROBO2Q9HCK4 1378 aa24.75■■□□□ 1.55
TTLL3-210ENST00000427220 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa24.74■■□□□ 1.55
TTLL3-210ENST00000427220 TNRQ92752 1358 aa24.74■■□□□ 1.55
TTLL3-210ENST00000427220 PREX1Q8TCU6 1659 aa24.74■■□□□ 1.55
TTLL3-210ENST00000427220 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa24.73■■□□□ 1.55
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TTLL3-210ENST00000427220 C22orf23Q9BZE7 217 aa24.73■■□□□ 1.55
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TTLL3-210ENST00000427220 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.68■■□□□ 1.54
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TTLL3-210ENST00000427220 IL16Q14005 1332 aa24.64■■□□□ 1.54
TTLL3-210ENST00000427220 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
TTLL3-210ENST00000427220 TSPYL4Q9UJ04 414 aa24.64■■□□□ 1.54
TTLL3-210ENST00000427220 CPS1P31327 1500 aa24.64■■□□□ 1.53
TTLL3-210ENST00000427220 LRRC7Q96NW7 1537 aa24.64■■□□□ 1.53
TTLL3-210ENST00000427220 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
TTLL3-210ENST00000427220 USP35Q9P2H5 1018 aa24.63■■□□□ 1.53
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TTLL3-210ENST00000427220 ALDH1L2Q3SY69 923 aa24.62■■□□□ 1.53
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TTLL3-210ENST00000427220 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa24.5■■□□□ 1.51
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TTLL3-210ENST00000427220 TPRNQ4KMQ1 711 aa24.48■■□□□ 1.51
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TTLL3-210ENST00000427220 STK31Q9BXU1 1019 aa24.46■■□□□ 1.51
TTLL3-210ENST00000427220 USP32Q8NFA0 1604 aa24.46■■□□□ 1.51
TTLL3-210ENST00000427220 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
TTLL3-210ENST00000427220 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
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TTLL3-210ENST00000427220 GCC1Q96CN9 775 aa24.44■■□□□ 1.5
TTLL3-210ENST00000427220 CHL1O00533 1208 aa24.43■■□□□ 1.5
TTLL3-210ENST00000427220 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
TTLL3-210ENST00000427220 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa24.42■■□□□ 1.5
TTLL3-210ENST00000427220 PTPRUQ92729 1446 aa24.42■■□□□ 1.5
TTLL3-210ENST00000427220 PLEKHG3A1L390 1219 aa24.42■■□□□ 1.5
TTLL3-210ENST00000427220 MSH6P52701 1360 aa24.42■■□□□ 1.5
TTLL3-210ENST00000427220 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
TTLL3-210ENST00000427220 ABCC4O15439 1325 aa24.41■■□□□ 1.5
TTLL3-210ENST00000427220 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
TTLL3-210ENST00000427220 MED14O60244 1454 aa24.4■■□□□ 1.5
TTLL3-210ENST00000427220 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
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