RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293683.9

PDE4A-201, Transcript of phosphodiesterase 4A, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4A, Length 2,583 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4A-201ENST00000293683 NFE2L2Q16236 605 aa21.66■■□□□ 1.06
PDE4A-201ENST00000293683 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa21.66■■□□□ 1.06
PDE4A-201ENST00000293683 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa21.66■■□□□ 1.06
PDE4A-201ENST00000293683 MBIPQ9NS73 344 aa21.65■■□□□ 1.06
PDE4A-201ENST00000293683 PREX1Q8TCU6 1659 aa21.65■■□□□ 1.06
PDE4A-201ENST00000293683 ALKQ9UM73 1620 aa21.64■■□□□ 1.05
PDE4A-201ENST00000293683 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
PDE4A-201ENST00000293683 ZRANB1Q9UGI0 708 aa21.64■■□□□ 1.05
PDE4A-201ENST00000293683 PTCH1Q13635 1447 aa21.63■■□□□ 1.05
PDE4A-201ENST00000293683 GCC1Q96CN9 775 aa21.62■■□□□ 1.05
PDE4A-201ENST00000293683 NEO1Q92859 1461 aa21.61■■□□□ 1.05
PDE4A-201ENST00000293683 FAM83GA6ND36 823 aa21.61■■□□□ 1.05
PDE4A-201ENST00000293683 GRPEL1Q9HAV7 217 aa21.61■■□□□ 1.05
PDE4A-201ENST00000293683 PIK3R4Q99570 1358 aa21.61■■□□□ 1.05
PDE4A-201ENST00000293683 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
PDE4A-201ENST00000293683 MRE11P49959 708 aa21.61■■□□□ 1.05
PDE4A-201ENST00000293683 C8orf58Q8NAV2 365 aa21.61■■□□□ 1.05
PDE4A-201ENST00000293683 NME9Q86XW9 330 aa21.6■■□□□ 1.05
PDE4A-201ENST00000293683 ZNF428Q96B54 188 aa21.6■■□□□ 1.05
PDE4A-201ENST00000293683 ABCC4O15439 1325 aa21.6■■□□□ 1.05
PDE4A-201ENST00000293683 RAB3GAP1Q15042 981 aa21.6■■□□□ 1.05
PDE4A-201ENST00000293683 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
PDE4A-201ENST00000293683 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
PDE4A-201ENST00000293683 GAS2L3Q86XJ1 694 aa21.59■■□□□ 1.05
PDE4A-201ENST00000293683 STAG3Q9UJ98 1225 aa21.59■■□□□ 1.05
PDE4A-201ENST00000293683 IL13P35225 146 aa21.59■■□□□ 1.05
PDE4A-201ENST00000293683 GNAI1P63096 354 aa21.59■■□□□ 1.05
PDE4A-201ENST00000293683 DCTN1Q14203 1278 aa21.59■■□□□ 1.05
PDE4A-201ENST00000293683 ARHGAP45Q92619 1136 aa21.59■■□□□ 1.05
PDE4A-201ENST00000293683 IFT57Q9NWB7 429 aa21.59■■□□□ 1.05
PDE4A-201ENST00000293683 RICTORQ6R327 1708 aa21.58■■□□□ 1.05
PDE4A-201ENST00000293683 ZNF853P0CG23 659 aa21.58■■□□□ 1.04
PDE4A-201ENST00000293683 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
PDE4A-201ENST00000293683 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
PDE4A-201ENST00000293683 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
PDE4A-201ENST00000293683 GAS2L2Q8NHY3 880 aa21.57■■□□□ 1.04
PDE4A-201ENST00000293683 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa21.56■■□□□ 1.04
PDE4A-201ENST00000293683 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
PDE4A-201ENST00000293683 SSFA2P28290 1259 aa21.55■■□□□ 1.04
PDE4A-201ENST00000293683 GBP4Q96PP9 640 aa21.55■■□□□ 1.04
PDE4A-201ENST00000293683 KNDC1Q76NI1 1749 aa21.54■■□□□ 1.04
PDE4A-201ENST00000293683 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
PDE4A-201ENST00000293683 ATP7BP35670 1465 aa21.54■■□□□ 1.04
PDE4A-201ENST00000293683 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
PDE4A-201ENST00000293683 ERBB4Q15303 1308 aa21.53■■□□□ 1.04
PDE4A-201ENST00000293683 KRT24Q2M2I5 525 aa21.53■■□□□ 1.04
PDE4A-201ENST00000293683 CFAP44Q96MT7 982 aa21.53■■□□□ 1.04
PDE4A-201ENST00000293683 CDC45O75419 566 aa21.52■■□□□ 1.04
PDE4A-201ENST00000293683 CLCN1P35523 988 aa21.52■■□□□ 1.04
PDE4A-201ENST00000293683 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa21.52■■□□□ 1.04
PDE4A-201ENST00000293683 DLG5Q8TDM6 1919 aa21.52■■□□□ 1.04
PDE4A-201ENST00000293683 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
PDE4A-201ENST00000293683 RIMS2Q9UQ26 1411 aa21.51■■□□□ 1.03
PDE4A-201ENST00000293683 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
PDE4A-201ENST00000293683 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
PDE4A-201ENST00000293683 AK9Q5TCS8 1911 aa21.49■■□□□ 1.03
PDE4A-201ENST00000293683 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
PDE4A-201ENST00000293683 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
PDE4A-201ENST00000293683 CYB5RLQ6IPT4 315 aa21.48■■□□□ 1.03
PDE4A-201ENST00000293683 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
PDE4A-201ENST00000293683 AEBP1Q8IUX7 1158 aa21.48■■□□□ 1.03
PDE4A-201ENST00000293683 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
PDE4A-201ENST00000293683 APBB1O00213 710 aa21.47■■□□□ 1.03
PDE4A-201ENST00000293683 CPS1P31327 1500 aa21.47■■□□□ 1.03
PDE4A-201ENST00000293683 DCTPP1Q9H773 170 aa21.46■■□□□ 1.03
PDE4A-201ENST00000293683 WASLO00401 505 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
PDE4A-201ENST00000293683 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa21.46■■□□□ 1.03
PDE4A-201ENST00000293683 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa21.46■■□□□ 1.03
PDE4A-201ENST00000293683 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa21.46■■□□□ 1.03
PDE4A-201ENST00000293683 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.03
PDE4A-201ENST00000293683 TTC22Q5TAA0 569 aa21.45■■□□□ 1.03
PDE4A-201ENST00000293683 TXNDC2Q86VQ3 553 aa21.45■■□□□ 1.03
PDE4A-201ENST00000293683 ESPNB1AK53 854 aa21.45■■□□□ 1.02
PDE4A-201ENST00000293683 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
PDE4A-201ENST00000293683 COG3Q96JB2 828 aa21.44■■□□□ 1.02
PDE4A-201ENST00000293683 LMOD3Q0VAK6 560 aa21.44■■□□□ 1.02
PDE4A-201ENST00000293683 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
PDE4A-201ENST00000293683 DLC1Q96QB1 1528 aa21.44■■□□□ 1.02
PDE4A-201ENST00000293683 ATP10DQ9P241 1426 aa21.44■■□□□ 1.02
PDE4A-201ENST00000293683 PKP1Q13835 747 aa21.43■■□□□ 1.02
PDE4A-201ENST00000293683 A2ML1A8K2U0 1454 aa21.43■■□□□ 1.02
PDE4A-201ENST00000293683 BAG4O95429 457 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
PDE4A-201ENST00000293683 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
PDE4A-201ENST00000293683 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
PDE4A-201ENST00000293683 RGS12O14924 1447 aa21.42■■□□□ 1.02
PDE4A-201ENST00000293683 AATKQ6ZMQ8 1374 aa21.42■■□□□ 1.02
PDE4A-201ENST00000293683 MCM10Q7L590 875 aa21.42■■□□□ 1.02
PDE4A-201ENST00000293683 METP08581 1390 aa21.42■■□□□ 1.02
PDE4A-201ENST00000293683 USP26Q9BXU7 913 aa21.42■■□□□ 1.02
PDE4A-201ENST00000293683 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
PDE4A-201ENST00000293683 MSH6P52701 1360 aa21.41■■□□□ 1.02
PDE4A-201ENST00000293683 CEP85Q6P2H3 762 aa21.41■■□□□ 1.02
PDE4A-201ENST00000293683 ANKRD44Q8N8A2 993 aa21.41■■□□□ 1.02
PDE4A-201ENST00000293683 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
PDE4A-201ENST00000293683 REREQ9P2R6 1566 aa21.4■■□□□ 1.02
PDE4A-201ENST00000293683 SDSP20132 328 aa21.4■■□□□ 1.02
PDE4A-201ENST00000293683 RABEP1Q15276 862 aa21.4■■□□□ 1.02
PDE4A-201ENST00000293683 SULT6B1Q6IMI4 303 aa21.4■■□□□ 1.02
PDE4A-201ENST00000293683 MEIS3Q99687 375 aa21.4■■□□□ 1.02
PDE4A-201ENST00000293683 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.4 ms