RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261169.10

LMO3-201, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 3,810 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-201ENST00000261169 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
LMO3-201ENST00000261169 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
LMO3-201ENST00000261169 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
LMO3-201ENST00000261169 GCC1Q96CN9 775 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-201ENST00000261169 TPM4P67936 248 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-201ENST00000261169 CNTROBQ8N137 903 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-201ENST00000261169 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
LMO3-201ENST00000261169 LRRCC1Q9C099 1032 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-201ENST00000261169 PRDM11Q9NQV5 511 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-201ENST00000261169 KAT6BQ8WYB5 2073 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-201ENST00000261169 PPFIA3O75145 1194 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-201ENST00000261169 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
LMO3-201ENST00000261169 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-201ENST00000261169 SDF4Q9BRK5 362 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-201ENST00000261169 ADAMTS12P58397 1594 aa6.65□□□□□ -1.34
LMO3-201ENST00000261169 FERMT3Q86UX7 667 aa6.65□□□□□ -1.34
LMO3-201ENST00000261169 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa6.65□□□□□ -1.34
LMO3-201ENST00000261169 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa6.65□□□□□ -1.34
LMO3-201ENST00000261169 IQGAP2Q13576 1575 aa6.65□□□□□ -1.34
LMO3-201ENST00000261169 VSIG10Q8N0Z9 540 aa6.65□□□□□ -1.34
LMO3-201ENST00000261169 FAM43AQ8N2R8 423 aa6.65□□□□□ -1.34
LMO3-201ENST00000261169 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
LMO3-201ENST00000261169 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 CCDC141Q6ZP82 1450 aa6.65□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 BTBD11A6QL63 1104 aa6.65□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 TATP17735 454 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP6.65□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 TRIM29Q14134 588 aa6.65□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa6.65□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 CCDC34Q96HJ3 373 aa6.65□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 MCM4P33991 863 aa6.64□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 CABP4P57796 275 aa6.64□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 KRT24Q2M2I5 525 aa6.64□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 AACSQ86V21 672 aa6.64□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa6.64□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 PTPN23Q9H3S7 1636 aa6.64□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 HECW1Q76N89 1606 aa6.64□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 PBRM1Q86U86 1689 aa6.64□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 SPC24Q8NBT2 197 aa6.64□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 CD109Q6YHK3 1445 aa6.64□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 AAMPQ13685 434 aa6.64□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 RABEP1Q15276 862 aa6.64□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 SASS6Q6UVJ0 657 aa6.64□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 MRE11P49959 708 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 CCT4P50991 539 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 ANKLE2Q86XL3 938 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 POTEDQ86YR6 584 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 AEBP1Q8IUX7 1158 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 ATAD2Q6PL18 1390 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 NOS1P29475 1434 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 KLHL34Q8N239 644 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 DDX11Q96FC9 970 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 BOLA2Q9H3K6 86 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 GDPD2Q9HCC8 539 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 IFT57Q9NWB7 429 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 HOMER1Q86YM7 354 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 TBC1D2Q9BYX2 928 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 CNNM1Q9NRU3 951 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 MAPKBP1O60336 1514 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 WASLO00401 505 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 RLBP1P12271 317 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 TESK2Q96S53 571 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 CARD14Q9BXL6 1004 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 GNAT3A8MTJ3 354 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 CHRNA2Q15822 529 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 BICDL1Q6ZP65 573 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 PIBF1Q8WXW3 757 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 TRIM5Q9C035 493 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 RBM10P98175 930 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 TPM3P06753 285 aa6.61□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 TTLL5Q6EMB2 1281 aa6.61□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 TSPYL6Q8N831 410 aa6.61□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 MBIPQ9NS73 344 aa6.61□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 SPG7Q9UQ90 795 aa6.61□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 NUP160Q12769 1436 aa6.61□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 ADGRL1O94910 1474 aa6.61□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 ERICH2A1L162 156 aa6.61□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa6.61□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 PIP4K2BP78356 416 aa6.61□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 CCDC82Q8N4S0 544 aa6.61□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 MEIS3Q99687 375 aa6.61□□□□□ -1.35
LMO3-201ENST00000261169 RSPH6AQ9H0K4 717 aa6.61□□□□□ -1.35
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