RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
SPCS1-201ENST00000233025 PAPPAQ13219 1627 aa24.56■■□□□ 1.52
SPCS1-201ENST00000233025 SLC15A2Q16348 729 aa24.54■■□□□ 1.52
SPCS1-201ENST00000233025 STK32BQ9NY57 414 aa24.54■■□□□ 1.52
SPCS1-201ENST00000233025 AATKQ6ZMQ8 1374 aa24.54■■□□□ 1.52
SPCS1-201ENST00000233025 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
SPCS1-201ENST00000233025 MPHOSPH9Q99550 1183 aa24.52■■□□□ 1.52
SPCS1-201ENST00000233025 COL24A1Q17RW2 1714 aa24.52■■□□□ 1.52
SPCS1-201ENST00000233025 COL18A1P39060 1754 aa24.52■■□□□ 1.52
SPCS1-201ENST00000233025 DDB1Q16531 1140 aa24.51■■□□□ 1.51
SPCS1-201ENST00000233025 TXNRD1Q16881 649 aa24.51■■□□□ 1.51
SPCS1-201ENST00000233025 ARXQ96QS3 562 aa24.5■■□□□ 1.51
SPCS1-201ENST00000233025 NHSQ6T4R5 1651 aa24.48■■□□□ 1.51
SPCS1-201ENST00000233025 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
SPCS1-201ENST00000233025 ACEP12821 1306 aa24.47■■□□□ 1.51
SPCS1-201ENST00000233025 ABTB2Q8N961 1025 aa24.46■■□□□ 1.51
SPCS1-201ENST00000233025 QSER1Q2KHR3 1735 aa24.46■■□□□ 1.51
SPCS1-201ENST00000233025 GCP02774 474 aa24.45■■□□□ 1.5
SPCS1-201ENST00000233025 GPR162Q16538 588 aa24.45■■□□□ 1.5
SPCS1-201ENST00000233025 RGPD5Q99666 1765 aa24.44■■□□□ 1.5
SPCS1-201ENST00000233025 SLIT3O75094 1523 aa24.43■■□□□ 1.5
SPCS1-201ENST00000233025 BTAF1O14981 1849 aa24.4■■□□□ 1.5
SPCS1-201ENST00000233025 PLEKHG3A1L390 1219 aa24.4■■□□□ 1.5
SPCS1-201ENST00000233025 NLRP13Q86W25 1043 aa24.39■■□□□ 1.49
SPCS1-201ENST00000233025 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa24.39■■□□□ 1.49
SPCS1-201ENST00000233025 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa24.37■■□□□ 1.49
SPCS1-201ENST00000233025 CDK19Q9BWU1 502 aa24.37■■□□□ 1.49
SPCS1-201ENST00000233025 CCDC61Q9Y6R9 512 aa24.37■■□□□ 1.49
SPCS1-201ENST00000233025 KAT6BQ8WYB5 2073 aa24.36■■□□□ 1.49
SPCS1-201ENST00000233025 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
SPCS1-201ENST00000233025 WDR17Q8IZU2 1322 aa24.35■■□□□ 1.49
SPCS1-201ENST00000233025 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa24.35■■□□□ 1.49
SPCS1-201ENST00000233025 PIK3C2AO00443 1686 aa24.34■■□□□ 1.49
SPCS1-201ENST00000233025 TNS2Q63HR2 1409 aa24.33■■□□□ 1.49
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF827Q17R98 1081 aa24.32■■□□□ 1.48
SPCS1-201ENST00000233025 ABCC6O95255 1503 aa24.31■■□□□ 1.48
SPCS1-201ENST00000233025 ZBTB7CA1YPR0 619 aa24.31■■□□□ 1.48
SPCS1-201ENST00000233025 ATP10DQ9P241 1426 aa24.31■■□□□ 1.48
SPCS1-201ENST00000233025 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
SPCS1-201ENST00000233025 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
SPCS1-201ENST00000233025 AXIN2Q9Y2T1 843 aa24.3■■□□□ 1.48
SPCS1-201ENST00000233025 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
SPCS1-201ENST00000233025 HSPA6P17066 643 aa24.29■■□□□ 1.48
SPCS1-201ENST00000233025 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa24.28■■□□□ 1.48
SPCS1-201ENST00000233025 KLHL34Q8N239 644 aa24.28■■□□□ 1.48
SPCS1-201ENST00000233025 NLGN2Q8NFZ4 835 aa24.28■■□□□ 1.48
SPCS1-201ENST00000233025 QRICH2Q9H0J4 1663 aa24.27■■□□□ 1.48
SPCS1-201ENST00000233025 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP24.26■■□□□ 1.473e-9■□□□□ 9
SPCS1-201ENST00000233025 CARD10Q9BWT7 1032 aa24.26■■□□□ 1.47
SPCS1-201ENST00000233025 SLC16A10Q8TF71 515 aa24.25■■□□□ 1.47
SPCS1-201ENST00000233025 USP6P35125 1406 aa24.25■■□□□ 1.47
SPCS1-201ENST00000233025 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa24.24■■□□□ 1.47
SPCS1-201ENST00000233025 EXOC5O00471 708 aa24.23■■□□□ 1.47
SPCS1-201ENST00000233025 POLD1P28340 1107 aa24.23■■□□□ 1.47
SPCS1-201ENST00000233025 LRRC4BQ9NT99 713 aa24.23■■□□□ 1.47
SPCS1-201ENST00000233025 ADCY9O60503 1353 aa24.23■■□□□ 1.47
SPCS1-201ENST00000233025 NLRP6P59044 892 aa24.22■■□□□ 1.47
SPCS1-201ENST00000233025 AKT1S1Q96B36 256 aa24.22■■□□□ 1.47
SPCS1-201ENST00000233025 CCDC7Q96M83 1385 aa24.21■■□□□ 1.47
SPCS1-201ENST00000233025 GRIN3BO60391 1043 aa24.21■■□□□ 1.47
SPCS1-201ENST00000233025 DCAF11Q8TEB1 546 aa24.21■■□□□ 1.47
SPCS1-201ENST00000233025 ACSBG1Q96GR2 724 aa24.21■■□□□ 1.47
SPCS1-201ENST00000233025 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa24.21■■□□□ 1.47
SPCS1-201ENST00000233025 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa24.2■■□□□ 1.46
SPCS1-201ENST00000233025 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
SPCS1-201ENST00000233025 ARHGEF25Q86VW2 580 aa24.18■■□□□ 1.46
SPCS1-201ENST00000233025 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
SPCS1-201ENST00000233025 NFAT5O94916 1531 aa24.18■■□□□ 1.46
SPCS1-201ENST00000233025 LY75O60449 1722 aa24.16■■□□□ 1.46
SPCS1-201ENST00000233025 STAC3Q96MF2 364 aa24.16■■□□□ 1.46
SPCS1-201ENST00000233025 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa24.15■■□□□ 1.46
SPCS1-201ENST00000233025 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
SPCS1-201ENST00000233025 SLC27A3Q5K4L6 730 aa24.1■■□□□ 1.45
SPCS1-201ENST00000233025 CABP2Q9NPB3 220 aa24.1■■□□□ 1.45
SPCS1-201ENST00000233025 LTN1O94822 1766 aa24.08■■□□□ 1.45
SPCS1-201ENST00000233025 DOT1LQ8TEK3 1739 aa24.07■■□□□ 1.44
SPCS1-201ENST00000233025 KCNH5Q8NCM2 988 aa24.07■■□□□ 1.44
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
SPCS1-201ENST00000233025 CABP1Q9NZU7 370 aa24.07■■□□□ 1.44
SPCS1-201ENST00000233025 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa24.06■■□□□ 1.44
SPCS1-201ENST00000233025 USP54Q70EL1 1684 aa24.05■■□□□ 1.44
SPCS1-201ENST00000233025 KIF3CO14782 793 aa24.03■■□□□ 1.44
SPCS1-201ENST00000233025 SOX12O15370 315 aa24.03■■□□□ 1.44
SPCS1-201ENST00000233025 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa24.03■■□□□ 1.44
SPCS1-201ENST00000233025 ERBB3P21860 1342 aa24.03■■□□□ 1.44
SPCS1-201ENST00000233025 WDR90Q96KV7 1748 aa24.02■■□□□ 1.44
SPCS1-201ENST00000233025 IL2RBP14784 551 aa24.02■■□□□ 1.44
SPCS1-201ENST00000233025 KCNQ4P56696 695 aa24.01■■□□□ 1.43
SPCS1-201ENST00000233025 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa24.01■■□□□ 1.43
SPCS1-201ENST00000233025 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa24.01■■□□□ 1.43
SPCS1-201ENST00000233025 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
SPCS1-201ENST00000233025 APLP1P51693 650 aa24■■□□□ 1.43
SPCS1-201ENST00000233025 MON2Q7Z3U7 1717 aa23.99■■□□□ 1.43
SPCS1-201ENST00000233025 PCNTO95613 3336 aa23.99■■□□□ 1.43
SPCS1-201ENST00000233025 C5P01031 1676 aa23.98■■□□□ 1.43
SPCS1-201ENST00000233025 NSD2O96028 1365 aa23.97■■□□□ 1.43
SPCS1-201ENST00000233025 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
SPCS1-201ENST00000233025 CD2APQ9Y5K6 639 aa23.97■■□□□ 1.43
SPCS1-201ENST00000233025 TAF1LQ8IZX4 1826 aa23.96■■□□□ 1.43
SPCS1-201ENST00000233025 TTC21AQ8NDW8 1320 aa23.96■■□□□ 1.43
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