RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000054930.6

Ptx4-201, Transcript of Pentraxin-4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptx4, Length 1,582 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx4-201ENSMUST00000054930 FocadA2AKG8 1798 aa18.33■□□□□ 0.52
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Nhsl1Q8CAF4 1587 aa18.32■□□□□ 0.52
Ptx4-201ENSMUST00000054930 NrdcQ8BHG1 1161 aa18.32■□□□□ 0.52
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Nol11Q8BJW5 723 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
Ptx4-201ENSMUST00000054930 U2af1Q9D883 239 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Sema6bO54951 886 aa18.31■□□□□ 0.52
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Col15a1O35206 1367 aa18.31■□□□□ 0.52
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Tcerg1Q8CGF7 1100 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Map4k4P97820 1233 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Q4VA45 678 aa18.3■□□□□ 0.52
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Nyap1Q6PFX7 833 aa18.3■□□□□ 0.52
Ptx4-201ENSMUST00000054930 RgmbQ7TQ33 436 aa18.3■□□□□ 0.52
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Cntnap1O54991 1385 aa18.29■□□□□ 0.52
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Slit1Q80TR4 1531 aa18.29■□□□□ 0.52
Ptx4-201ENSMUST00000054930 MpripP97434 1024 aa18.29■□□□□ 0.52
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Uspl1Q3ULM6 1089 aa18.29■□□□□ 0.52
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Ddx54Q8K4L0 874 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Znf541Q0GGX2 1363 aa18.29■□□□□ 0.52
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Lrp6O88572 1613 aa18.28■□□□□ 0.52
Ptx4-201ENSMUST00000054930 CrklP47941 303 aa18.28■□□□□ 0.52
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Mcm10Q0VBD2 885 aa18.27■□□□□ 0.52
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Fchsd2Q3USJ8 740 aa18.27■□□□□ 0.52
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Mak16Q8BGS0 296 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
Ptx4-201ENSMUST00000054930 OptnQ8K3K8 584 aa18.27■□□□□ 0.52
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Apaf1O88879 1249 aa18.26■□□□□ 0.51
Ptx4-201ENSMUST00000054930 HdgfP51859 237 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Ecm2Q5FW85 670 aa18.25■□□□□ 0.51
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Ppp1r37Q8BKR5 712 aa18.25■□□□□ 0.51
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Golga2Q921M4 999 aa18.25■□□□□ 0.51
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Rtl5Q5DTT4 599 aa18.24■□□□□ 0.51
Ptx4-201ENSMUST00000054930 MypopQ8R4U1 393 aa18.24■□□□□ 0.51
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Kdm6aO70546 1401 aa18.24■□□□□ 0.51
Ptx4-201ENSMUST00000054930 TnikP83510 1323 aa18.23■□□□□ 0.51
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Shank2Q80Z38 1476 aa18.21■□□□□ 0.51
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Fnbp4Q6ZQ03 1031 aa18.21■□□□□ 0.51
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Simc1E9Q6E9 1354 aa18.2■□□□□ 0.5
Ptx4-201ENSMUST00000054930 TkfcQ8VC30 578 aa18.19■□□□□ 0.5
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Ahnak2E9PYB0 1738 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Fer1l6E0CZ42 1862 aa18.18■□□□□ 0.5
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Ncbp3Q8BZR9 615 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Uhrf1bp1B2KF50 1429 aa18.17■□□□□ 0.5
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Trpm3Q5F4S9 1721 aa18.17■□□□□ 0.5
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Akap11E9Q777 1895 aa18.17■□□□□ 0.5
Ptx4-201ENSMUST00000054930 CrbnQ8C7D2 445 aa18.17■□□□□ 0.5
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Arfgef2A2A5R2 1792 aa18.16■□□□□ 0.5
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Zfp777B9EKF4 885 aa18.16■□□□□ 0.5
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Ggt6Q6PDE7 497 aa18.16■□□□□ 0.5
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Plin1Q8CGN5 517 aa18.16■□□□□ 0.5
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Tnks1bp1P58871 1720 aa18.15■□□□□ 0.5
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Adgrb1Q3UHD1 1582 aa18.15■□□□□ 0.5
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Zfp444Q3TDV8 331 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Psrc1Q9D0P7 329 aa18.15■□□□□ 0.5
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Cabp2Q9JLK4 216 aa18.15■□□□□ 0.5
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Nup153E9Q3G8 1462 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.5
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Dusp27Q148W8 1138 aa18.14■□□□□ 0.49
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Ccdc129Q14B48 1034 aa18.14■□□□□ 0.49
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Stk31Q99MW1 1018 aa18.14■□□□□ 0.49
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Cavin4A2AMM0 362 aa18.13■□□□□ 0.49
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Zranb3Q6NZP1 1069 aa18.13■□□□□ 0.49
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Emilin2Q8K482 1074 aa18.13■□□□□ 0.49
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Gm10471E9Q1C7 252 aa18.13■□□□□ 0.49
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Eno4Q8C042 619 aa18.13■□□□□ 0.49
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Larp1bA0A0A6YXJ7 370 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
Ptx4-201ENSMUST00000054930 TmpoQ61033 693 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Tnrc6cQ3UHC0 1690 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Mast2Q60592 1734 aa18.11■□□□□ 0.49
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Mapk8ip3Q9ESN9 1337 aa18.11■□□□□ 0.49
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Kat6bQ8BRB7 1872 aa18.11■□□□□ 0.49
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Plekhd1B2RPU2 505 aa18.11■□□□□ 0.49
Ptx4-201ENSMUST00000054930 HypkQ9CR41 129 aa18.11■□□□□ 0.49
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Znf710Q3U288 666 aa18.1■□□□□ 0.49
Ptx4-201ENSMUST00000054930 ThemisQ8BGW0 636 aa18.1■□□□□ 0.49
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Amotl1Q9D4H4 968 aa18.1■□□□□ 0.49
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Tns2Q8CGB6 1400 aa18.1■□□□□ 0.49
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Cacna1sQ02789 1880 aa18.1■□□□□ 0.49
Ptx4-201ENSMUST00000054930 InhbeO08717 350 aa18.08■□□□□ 0.49
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Snap23O09044 210 aa18.08■□□□□ 0.49
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Gsdma3Q5Y4Y6 464 aa18.08■□□□□ 0.49
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Pak3Q61036 559 aa18.08■□□□□ 0.49
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Speer4f1Q9D5Q6 258 aa18.08■□□□□ 0.49
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Zeb2Q9R0G7 1215 aa18.08■□□□□ 0.49
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Aox2Q5SGK3 1345 aa18.08■□□□□ 0.48
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Stra8P70278 393 aa18.08■□□□□ 0.48
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Zpr1Q62384 459 aa18.08■□□□□ 0.48
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Ofd1Q80Z25 1017 aa18.08■□□□□ 0.48
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Ciz1Q8VEH2 845 aa18.08■□□□□ 0.48
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Atxn3Q9CVD2 355 aa18.08■□□□□ 0.48
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Rad21Q61550 635 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Ralbp1Q62172 648 aa18.07■□□□□ 0.48
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Swt1Q9DBQ9 907 aa18.07■□□□□ 0.48
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Nkx2-3P97334 362 aa18.06■□□□□ 0.48
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Rab11fip3Q8CHD8 1047 aa18.06■□□□□ 0.48
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Iqcf3Q9D498 203 aa18.06■□□□□ 0.48
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Ltbp1Q8CG19 1712 aa18.05■□□□□ 0.48
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Gas2l2Q5SSG4 860 aa18.04■□□□□ 0.48
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Neurod2Q62414 383 aa18.04■□□□□ 0.48
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Pm20d1Q8C165 503 aa18.04■□□□□ 0.48
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Cc2d1aQ8K1A6 943 aa18.04■□□□□ 0.48
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Fam50bQ9WTJ8 334 aa18.04■□□□□ 0.48
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Aplp2Q06335 707 aa18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 14.4 ms