RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000047904.3

Hoxd4-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Hoxd4, Length 2,560 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Map4k4P97820 1233 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Hs1bp3Q3TC93 395 aa21.4■■□□□ 1.02
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ncapd2Q8K2Z4 1392 aa21.39■■□□□ 1.01
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 CenpjQ569L8 1344 aa21.39■■□□□ 1.01
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Wdr78E9PYY5 807 aa21.39■■□□□ 1.01
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 PtmaP26350 111 aa21.39■■□□□ 1.01
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Dmrtc1Q9D9R7 182 aa21.39■■□□□ 1.01
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 NcapgE9PWG6 1004 aa21.38■■□□□ 1.01
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Gprasp1Q5U4C1 1347 aa21.38■■□□□ 1.01
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Zhx1P70121 873 aa21.38■■□□□ 1.01
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Cog6Q8R3I3 657 aa21.38■■□□□ 1.01
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Exosc9Q9JHI7 438 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 InsrP15208 1372 aa21.37■■□□□ 1.01
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 NpatQ8BMA5 1420 aa21.36■■□□□ 1.01
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Utp14aQ640M1 767 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Kdm4cQ8VCD7 1054 aa21.36■■□□□ 1.01
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 MaddQ80U28 1577 aa21.35■■□□□ 1.01
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Bag4Q8CI61 457 aa21.35■■□□□ 1.01
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ercc6l2Q9JIM3 1537 aa21.34■■□□□ 1.01
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 CltcQ68FD5 1675 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Bloc1s4Q8VED2 215 aa21.34■■□□□ 1.01
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Naip7Q9JIB3 1402 aa21.34■■□□□ 1.01
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Cbx1P83917 185 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Mindy4Q3UQI9 744 aa21.33■■□□□ 1.01
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ksr2Q3UVC0 959 aa21.33■■□□□ 1.01
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ift172Q6VH22 1749 aa21.33■■□□□ 1
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 MsnP26041 577 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Kif13aQ9EQW7 1749 aa21.32■■□□□ 1
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Sox12Q04890 314 aa21.32■■□□□ 1
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Chmp4bQ9D8B3 224 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Atp2b2Q9R0K7 1198 aa21.31■■□□□ 1
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Scaf11E9PZM7 1456 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Tfip11Q9ERA6 838 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Kank4Q6P9J5 1016 aa21.3■■□□□ 1
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Arhgap23Q69ZH9 1483 aa21.29■■□□□ 1
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Lmod3E9QA62 571 aa21.29■■□□□ 1
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Iqsec2Q5DU25 1478 aa21.29■■□□□ 1
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Brd1E9PZ26 1189 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 MpndQ3TV65 487 aa21.29■■□□□ 1
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 KnstrnQ9D9Z1 312 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ecm2Q5FW85 670 aa21.28■■□□□ 1
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 SkilQ60665 675 aa21.28■■□□□ 1
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Itsn1Q9Z0R4 1714 aa21.28■■□□□ 1
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Cald1E9QA15 768 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Grpel1Q99LP6 217 aa21.28■■□□□ 1
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 IbtkQ6ZPR6 1352 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 ImpactO55091 318 aa21.27■■□□□ 1
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Cdk19Q8BWD8 501 aa21.27■■□□□ 1
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 4931400O07RikQ9D4M5 137 aa21.27■□□□□ 0.99
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Atp2b3Q0VF55 1220 aa21.26■□□□□ 0.99
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ccar1Q8CH18 1146 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 IghaA0A0A6YXW6 389 aa21.25■□□□□ 0.99
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Casq1O09165 405 aa21.25■□□□□ 0.99
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Zscan25B2RX31 543 aa21.25■□□□□ 0.99
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Cers3Q1A3B0 383 aa21.24■□□□□ 0.99
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Gtpbp6Q3U6U5 514 aa21.24■□□□□ 0.99
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Plcd3Q8K2J0 785 aa21.24■□□□□ 0.99
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Fam114a1Q9D281 569 aa21.24■□□□□ 0.99
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 GsdmaQ9EST1 446 aa21.24■□□□□ 0.99
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Rasa1E9PYG6 1038 aa21.23■□□□□ 0.99
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Apaf1O88879 1249 aa21.23■□□□□ 0.99
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Gm9992B2RWK3 458 aa21.23■□□□□ 0.99
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Gsto1O09131 240 aa21.23■□□□□ 0.99
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Kif3aP28741 701 aa21.23■□□□□ 0.99
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Aplp1Q03157 653 aa21.23■□□□□ 0.99
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Unc93aQ710D3 458 aa21.23■□□□□ 0.99
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Rcan3Q9JKK0 239 aa21.23■□□□□ 0.99
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 FanciQ8K368 1330 aa21.23■□□□□ 0.99
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Txndc2Q6P902 515 aa21.22■□□□□ 0.99
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Arhgef28P97433 1693 aa21.22■□□□□ 0.99
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 GorabQ8BRM2 368 aa21.2■□□□□ 0.98
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 NinlQ6ZQ12 1394 aa21.19■□□□□ 0.98
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 KdrP35918 1367 aa21.19■□□□□ 0.98
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Psme1P97371 249 aa21.19■□□□□ 0.98
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 U2af1Q9D883 239 aaKnown RBP21.19■□□□□ 0.98
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Nrxn1Q9CS84 1514 aa21.18■□□□□ 0.98
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Tbc1d9Q3UYK3 1264 aa21.18■□□□□ 0.98
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Maco1Q7TQE6 664 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Zfp251Q6PCX8 632 aa21.18■□□□□ 0.98
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Rsph4aQ8BYM7 716 aa21.18■□□□□ 0.98
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Inpp5bQ8K337 993 aa21.18■□□□□ 0.98
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ncbp1Q3UYV9 790 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Tsen2Q6P7W5 460 aa21.17■□□□□ 0.98
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Gm45140A0A0N4SUM8 220 aa21.17■□□□□ 0.98
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Anp32cQ64G17 123 aa21.17■□□□□ 0.98
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Abca14E9Q8F8 1683 aa21.17■□□□□ 0.98
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Wdr63B2RY71 923 aa21.16■□□□□ 0.98
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Rbm27Q5SFM8 1060 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 1700010I14RikQ7TPG0 532 aa21.16■□□□□ 0.98
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Tbc1d31Q6NXY1 996 aa21.15■□□□□ 0.98
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Kdm4aQ8BW72 1064 aa21.15■□□□□ 0.98
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 EngaseQ8BX80 734 aa21.15■□□□□ 0.98
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 RictorQ6QI06 1708 aa21.15■□□□□ 0.98
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Zkscan1Q8BGS3 561 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.98
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 NktrP30415 1453 aa21.14■□□□□ 0.97
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ercc6lQ8BHK9 1240 aa21.14■□□□□ 0.97
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Znf330Q922H9 316 aa21.14■□□□□ 0.97
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Eif2ak4Q9QZ05 1648 aa21.13■□□□□ 0.97
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ptgs1P22437 602 aa21.13■□□□□ 0.97
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Nek4Q9Z1J2 792 aa21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 17.5 ms