Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4M5

4931400O07Rik, MCG14882, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931400O07RikQ9D4M5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
4931400O07RikQ9D4M5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
4931400O07RikQ9D4M5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
4931400O07RikQ9D4M5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC38.12■■■■□ 3.69
4931400O07RikQ9D4M5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC37.68■■■■□ 3.62
4931400O07RikQ9D4M5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
4931400O07RikQ9D4M5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
4931400O07RikQ9D4M5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
4931400O07RikQ9D4M5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
4931400O07RikQ9D4M5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
4931400O07RikQ9D4M5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
4931400O07RikQ9D4M5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
4931400O07RikQ9D4M5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
4931400O07RikQ9D4M5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
4931400O07RikQ9D4M5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
4931400O07RikQ9D4M5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
4931400O07RikQ9D4M5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
4931400O07RikQ9D4M5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC35.05■■■■□ 3.2
4931400O07RikQ9D4M5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
4931400O07RikQ9D4M5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
4931400O07RikQ9D4M5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
4931400O07RikQ9D4M5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
4931400O07RikQ9D4M5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
4931400O07RikQ9D4M5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
4931400O07RikQ9D4M5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
4931400O07RikQ9D4M5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
4931400O07RikQ9D4M5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
4931400O07RikQ9D4M5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
4931400O07RikQ9D4M5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
4931400O07RikQ9D4M5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
4931400O07RikQ9D4M5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
4931400O07RikQ9D4M5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
4931400O07RikQ9D4M5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
4931400O07RikQ9D4M5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
4931400O07RikQ9D4M5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
4931400O07RikQ9D4M5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
4931400O07RikQ9D4M5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
4931400O07RikQ9D4M5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
4931400O07RikQ9D4M5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
4931400O07RikQ9D4M5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
4931400O07RikQ9D4M5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
4931400O07RikQ9D4M5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
4931400O07RikQ9D4M5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
4931400O07RikQ9D4M5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
4931400O07RikQ9D4M5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
4931400O07RikQ9D4M5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
4931400O07RikQ9D4M5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
4931400O07RikQ9D4M5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
4931400O07RikQ9D4M5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
4931400O07RikQ9D4M5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
4931400O07RikQ9D4M5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
4931400O07RikQ9D4M5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
4931400O07RikQ9D4M5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
4931400O07RikQ9D4M5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
4931400O07RikQ9D4M5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
4931400O07RikQ9D4M5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
4931400O07RikQ9D4M5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
4931400O07RikQ9D4M5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
4931400O07RikQ9D4M5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
4931400O07RikQ9D4M5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
4931400O07RikQ9D4M5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
4931400O07RikQ9D4M5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
4931400O07RikQ9D4M5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
4931400O07RikQ9D4M5 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
4931400O07RikQ9D4M5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
4931400O07RikQ9D4M5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
4931400O07RikQ9D4M5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
4931400O07RikQ9D4M5 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
4931400O07RikQ9D4M5 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
4931400O07RikQ9D4M5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC32.42■■■□□ 2.78
4931400O07RikQ9D4M5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
4931400O07RikQ9D4M5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
4931400O07RikQ9D4M5 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC32.25■■■□□ 2.75
4931400O07RikQ9D4M5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
4931400O07RikQ9D4M5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
4931400O07RikQ9D4M5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
4931400O07RikQ9D4M5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
4931400O07RikQ9D4M5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
4931400O07RikQ9D4M5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
4931400O07RikQ9D4M5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
4931400O07RikQ9D4M5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
4931400O07RikQ9D4M5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
4931400O07RikQ9D4M5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
4931400O07RikQ9D4M5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
4931400O07RikQ9D4M5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
4931400O07RikQ9D4M5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.88■■■□□ 2.69
4931400O07RikQ9D4M5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
4931400O07RikQ9D4M5 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
4931400O07RikQ9D4M5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
4931400O07RikQ9D4M5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
4931400O07RikQ9D4M5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
4931400O07RikQ9D4M5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
4931400O07RikQ9D4M5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
4931400O07RikQ9D4M5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
4931400O07RikQ9D4M5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
4931400O07RikQ9D4M5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
4931400O07RikQ9D4M5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
4931400O07RikQ9D4M5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
4931400O07RikQ9D4M5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.65■■■□□ 2.66
4931400O07RikQ9D4M5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 6.5 ms