Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK0

Rcan3, Calcipressin-3, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcan3Q9JKK0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
Rcan3Q9JKK0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.68
Rcan3Q9JKK0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Rcan3Q9JKK0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Rcan3Q9JKK0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
Rcan3Q9JKK0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
Rcan3Q9JKK0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Rcan3Q9JKK0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Rcan3Q9JKK0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Rcan3Q9JKK0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Rcan3Q9JKK0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Rcan3Q9JKK0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Rcan3Q9JKK0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Rcan3Q9JKK0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Rcan3Q9JKK0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Rcan3Q9JKK0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Rcan3Q9JKK0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Rcan3Q9JKK0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Rcan3Q9JKK0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
Rcan3Q9JKK0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Rcan3Q9JKK0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Rcan3Q9JKK0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Rcan3Q9JKK0 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Rcan3Q9JKK0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Rcan3Q9JKK0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Rcan3Q9JKK0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Rcan3Q9JKK0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
Rcan3Q9JKK0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Rcan3Q9JKK0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Rcan3Q9JKK0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
Rcan3Q9JKK0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Rcan3Q9JKK0 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Rcan3Q9JKK0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Rcan3Q9JKK0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Rcan3Q9JKK0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Rcan3Q9JKK0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Rcan3Q9JKK0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
Rcan3Q9JKK0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Rcan3Q9JKK0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
Rcan3Q9JKK0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Rcan3Q9JKK0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC33.2■■■□□ 2.9
Rcan3Q9JKK0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Rcan3Q9JKK0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Rcan3Q9JKK0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Rcan3Q9JKK0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Rcan3Q9JKK0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Rcan3Q9JKK0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Rcan3Q9JKK0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Rcan3Q9JKK0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Rcan3Q9JKK0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Rcan3Q9JKK0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Rcan3Q9JKK0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Rcan3Q9JKK0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Rcan3Q9JKK0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Rcan3Q9JKK0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Rcan3Q9JKK0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Rcan3Q9JKK0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Rcan3Q9JKK0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Rcan3Q9JKK0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Rcan3Q9JKK0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Rcan3Q9JKK0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Rcan3Q9JKK0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Rcan3Q9JKK0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Rcan3Q9JKK0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Rcan3Q9JKK0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Rcan3Q9JKK0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Rcan3Q9JKK0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Rcan3Q9JKK0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
Rcan3Q9JKK0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Rcan3Q9JKK0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Rcan3Q9JKK0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC31.88■■■□□ 2.69
Rcan3Q9JKK0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Rcan3Q9JKK0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Rcan3Q9JKK0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Rcan3Q9JKK0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Rcan3Q9JKK0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Rcan3Q9JKK0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Rcan3Q9JKK0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Rcan3Q9JKK0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Rcan3Q9JKK0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Rcan3Q9JKK0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Rcan3Q9JKK0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
Rcan3Q9JKK0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Rcan3Q9JKK0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Rcan3Q9JKK0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Rcan3Q9JKK0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Rcan3Q9JKK0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Rcan3Q9JKK0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Rcan3Q9JKK0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Rcan3Q9JKK0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Rcan3Q9JKK0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Rcan3Q9JKK0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Rcan3Q9JKK0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Rcan3Q9JKK0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Rcan3Q9JKK0 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Rcan3Q9JKK0 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Rcan3Q9JKK0 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Rcan3Q9JKK0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Rcan3Q9JKK0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Rcan3Q9JKK0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms