RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)P

tW(CCA)P, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)P, Length 72 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)PtW(CCA)P NOP2P40991 618 aaKnown RBP3.17□□□□□ -1.9
tW(CCA)PtW(CCA)P NET1P47035 1189 aa3.17□□□□□ -1.9
tW(CCA)PtW(CCA)P PCL8Q08966 492 aa3.17□□□□□ -1.9
tW(CCA)PtW(CCA)P NCB2Q92317 146 aa3.17□□□□□ -1.9
tW(CCA)PtW(CCA)P FIG2P25653 1609 aa3.17□□□□□ -1.9
tW(CCA)PtW(CCA)P PIF1P07271 859 aa3.16□□□□□ -1.9
tW(CCA)PtW(CCA)P KIN1P13185 1064 aa3.16□□□□□ -1.9
tW(CCA)PtW(CCA)P CDC60P26637 1090 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
tW(CCA)PtW(CCA)P PBY1P38254 753 aa3.16□□□□□ -1.9
tW(CCA)PtW(CCA)P VAB2P40003 282 aa3.16□□□□□ -1.9
tW(CCA)PtW(CCA)P YMR147WP40218 223 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
tW(CCA)PtW(CCA)P YGL242CP53066 181 aa3.16□□□□□ -1.9
tW(CCA)PtW(CCA)P PIB2P53191 635 aa3.16□□□□□ -1.9
tW(CCA)PtW(CCA)P ALO1P54783 526 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
tW(CCA)PtW(CCA)P NAB6Q03735 1134 aaKnown RBP RIP-Chip data3.16□□□□□ -1.9not detected
tW(CCA)PtW(CCA)P MAM3Q12296 706 aa3.16□□□□□ -1.9
tW(CCA)PtW(CCA)P CYB2P00175 591 aa3.15□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P VMA2P16140 517 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P KTR2P33550 425 aa3.15□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P LDH1P38139 375 aa3.15□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P CST26P38226 397 aa3.15□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P VPS62P53285 467 aa3.15□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P BRE5P53741 515 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P BUL2Q03758 920 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P UBX5Q06682 500 aa3.15□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P YPL260WQ08977 551 aa3.15□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P YOR131CQ12486 218 aa3.15□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P YDR461C-AQ2V2P7 80 aa3.15□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P HKR1P41809 1802 aa3.14□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P NOT3P06102 836 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P HIP1P06775 603 aa3.14□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P ERG12P07277 443 aa3.14□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P PRE8P23639 250 aa3.14□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P GCD7P32502 381 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P SRP40P32583 406 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P NMD2P38798 1089 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P FPR3P38911 411 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P SLN1P39928 1220 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P IRC8P47046 822 aa3.14□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P POL32P47110 350 aa3.14□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P CLA4P48562 842 aa3.14□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P SNU71P53207 620 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P YVH1Q02256 364 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P MRD1Q06106 887 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P SUB2Q07478 446 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P TY3A-GQ12173 290 aa3.14□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P ARP8Q12386 881 aaKnown RBP RIP-Chip data3.14□□□□□ -1.91not detected
tW(CCA)PtW(CCA)P TY3A-IQ99219 290 aa3.14□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P PDR18P53756 1333 aa3.14□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P CHO2P05374 869 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P SAM2P19358 384 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P SRM1P21827 482 aa3.13□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P CHS3P29465 1165 aa3.13□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P EUG1P32474 517 aa3.13□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P UIP5P36137 443 aa3.13□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P RFC1P38630 861 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P VID27P40157 782 aa3.13□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P YJR107WP47145 328 aa3.13□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P MLC1P53141 149 aa3.13□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P SLD5Q03406 294 aa3.13□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P YML037CQ03703 340 aa3.13□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P DUS4Q06063 367 aa3.13□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P ISW2Q08773 1120 aa3.13□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P SUT2Q12286 268 aa3.13□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P MPH3P0CE00 602 aa3.12□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P SAM1P10659 382 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P COQ1P18900 473 aa3.12□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P PRE10P21242 288 aaKnown RBP RIP-Chip data3.12□□□□□ -1.91not detected
tW(CCA)PtW(CCA)P PKC1P24583 1151 aa3.12□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P DBP1P24784 617 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P PER1P25625 357 aa3.12□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P SPB4P25808 606 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P AVT3P36062 692 aa3.12□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P ECM21P38167 1117 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P RRP8P38961 392 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P VPS8P39702 1274 aa3.12□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P AFG3P39925 761 aa3.12□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P TIF4631P39935 952 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P MSH4P40965 878 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P ENP2P48234 707 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P HGH1P48362 394 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P MET7Q08645 548 aa3.12□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P MSC6Q08818 692 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P RKM4Q12504 494 aa3.12□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P RAD18P10862 487 aa3.11□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P MIP1P15801 1254 aa3.11□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P UTR4P32626 227 aa3.11□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P SHP1P34223 423 aa3.11□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P RTS1P38903 757 aa3.11□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P UBP9P39967 754 aa3.11□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P FIR1P40020 876 aa3.11□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P EPS1P40557 701 aa3.11□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P IOC3P43596 787 aa3.11□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P SCS3P53012 380 aa3.11□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P YRB30P53107 440 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P YGL039WP53183 348 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P MRPS35P53292 345 aa3.11□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P YPL034WQ03083 165 aa3.11□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P PKH3Q03306 898 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P KAR5Q04746 504 aa3.11□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 35.2 ms