RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)J

tW(CCA)J, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)J, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)JtW(CCA)J NOP2P40991 618 aaKnown RBP3.17□□□□□ -1.9
tW(CCA)JtW(CCA)J NET1P47035 1189 aa3.17□□□□□ -1.9
tW(CCA)JtW(CCA)J PCL8Q08966 492 aa3.17□□□□□ -1.9
tW(CCA)JtW(CCA)J NCB2Q92317 146 aa3.17□□□□□ -1.9
tW(CCA)JtW(CCA)J FIG2P25653 1609 aa3.17□□□□□ -1.9
tW(CCA)JtW(CCA)J PIF1P07271 859 aa3.16□□□□□ -1.9
tW(CCA)JtW(CCA)J KIN1P13185 1064 aa3.16□□□□□ -1.9
tW(CCA)JtW(CCA)J CDC60P26637 1090 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
tW(CCA)JtW(CCA)J PBY1P38254 753 aa3.16□□□□□ -1.9
tW(CCA)JtW(CCA)J VAB2P40003 282 aa3.16□□□□□ -1.9
tW(CCA)JtW(CCA)J YMR147WP40218 223 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
tW(CCA)JtW(CCA)J YGL242CP53066 181 aa3.16□□□□□ -1.9
tW(CCA)JtW(CCA)J PIB2P53191 635 aa3.16□□□□□ -1.9
tW(CCA)JtW(CCA)J ALO1P54783 526 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
tW(CCA)JtW(CCA)J NAB6Q03735 1134 aaKnown RBP RIP-Chip data3.16□□□□□ -1.9not detected
tW(CCA)JtW(CCA)J MAM3Q12296 706 aa3.16□□□□□ -1.9
tW(CCA)JtW(CCA)J CYB2P00175 591 aa3.15□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J VMA2P16140 517 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J KTR2P33550 425 aa3.15□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J LDH1P38139 375 aa3.15□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J CST26P38226 397 aa3.15□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J VPS62P53285 467 aa3.15□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J BRE5P53741 515 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J BUL2Q03758 920 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J UBX5Q06682 500 aa3.15□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J YPL260WQ08977 551 aa3.15□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J YOR131CQ12486 218 aa3.15□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J YDR461C-AQ2V2P7 80 aa3.15□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J HKR1P41809 1802 aa3.14□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J NOT3P06102 836 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J HIP1P06775 603 aa3.14□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J ERG12P07277 443 aa3.14□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J PRE8P23639 250 aa3.14□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J GCD7P32502 381 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J SRP40P32583 406 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J NMD2P38798 1089 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J FPR3P38911 411 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J SLN1P39928 1220 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J IRC8P47046 822 aa3.14□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J POL32P47110 350 aa3.14□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J CLA4P48562 842 aa3.14□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J SNU71P53207 620 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J YVH1Q02256 364 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J MRD1Q06106 887 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J SUB2Q07478 446 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J TY3A-GQ12173 290 aa3.14□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J ARP8Q12386 881 aaKnown RBP RIP-Chip data3.14□□□□□ -1.91not detected
tW(CCA)JtW(CCA)J TY3A-IQ99219 290 aa3.14□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J PDR18P53756 1333 aa3.14□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J CHO2P05374 869 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J SAM2P19358 384 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J SRM1P21827 482 aa3.13□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J CHS3P29465 1165 aa3.13□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J EUG1P32474 517 aa3.13□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J UIP5P36137 443 aa3.13□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J RFC1P38630 861 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J VID27P40157 782 aa3.13□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J YJR107WP47145 328 aa3.13□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J MLC1P53141 149 aa3.13□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J SLD5Q03406 294 aa3.13□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J YML037CQ03703 340 aa3.13□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J DUS4Q06063 367 aa3.13□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J ISW2Q08773 1120 aa3.13□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J SUT2Q12286 268 aa3.13□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J MPH3P0CE00 602 aa3.12□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J SAM1P10659 382 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J COQ1P18900 473 aa3.12□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J PRE10P21242 288 aaKnown RBP RIP-Chip data3.12□□□□□ -1.91not detected
tW(CCA)JtW(CCA)J PKC1P24583 1151 aa3.12□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J DBP1P24784 617 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J PER1P25625 357 aa3.12□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J SPB4P25808 606 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J AVT3P36062 692 aa3.12□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J ECM21P38167 1117 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J RRP8P38961 392 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J VPS8P39702 1274 aa3.12□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J AFG3P39925 761 aa3.12□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J TIF4631P39935 952 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J MSH4P40965 878 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J ENP2P48234 707 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J HGH1P48362 394 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J MET7Q08645 548 aa3.12□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J MSC6Q08818 692 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J RKM4Q12504 494 aa3.12□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J RAD18P10862 487 aa3.11□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J MIP1P15801 1254 aa3.11□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J UTR4P32626 227 aa3.11□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J SHP1P34223 423 aa3.11□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J RTS1P38903 757 aa3.11□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J UBP9P39967 754 aa3.11□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J FIR1P40020 876 aa3.11□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J EPS1P40557 701 aa3.11□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J IOC3P43596 787 aa3.11□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J SCS3P53012 380 aa3.11□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J YRB30P53107 440 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J YGL039WP53183 348 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J MRPS35P53292 345 aa3.11□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J YPL034WQ03083 165 aa3.11□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J PKH3Q03306 898 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J KAR5Q04746 504 aa3.11□□□□□ -1.91
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