RNA–Protein interactions for RNA: YOL093W

TRM10, Transcript of tRNA methyltransferase, yeastyeast

Gene TRM10, Length 882 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TRM10YOL093W ESL2P36168 1195 aa6.6□□□□□ -1.35
TRM10YOL093W MAK10Q02197 733 aa6.6□□□□□ -1.35
TRM10YOL093W TY3B-IQ7LHG5 1498 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.36
TRM10YOL093W MRX12P47084 519 aa6.58□□□□□ -1.36
TRM10YOL093W BUD9P53226 547 aa6.58□□□□□ -1.36
TRM10YOL093W CFT1Q06632 1357 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
TRM10YOL093W SPT5P27692 1063 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
TRM10YOL093W YBL036CP38197 257 aa6.57□□□□□ -1.36
TRM10YOL093W TFB3Q03290 321 aa6.57□□□□□ -1.36
TRM10YOL093W MSC7P38694 644 aa6.55□□□□□ -1.36
TRM10YOL093W APL6P46682 809 aa6.55□□□□□ -1.36
TRM10YOL093W YLR419WQ06698 1435 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
TRM10YOL093W TAF5P38129 798 aa6.54□□□□□ -1.36
TRM10YOL093W HAL5P38970 855 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
TRM10YOL093W MLP1Q02455 1875 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
TRM10YOL093W NHA1Q99271 985 aa6.53□□□□□ -1.36
TRM10YOL093W KRE5P22023 1365 aa6.53□□□□□ -1.36
TRM10YOL093W MHP1P43638 1398 aa6.53□□□□□ -1.36
TRM10YOL093W ALD4P46367 519 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
TRM10YOL093W RAD9P14737 1309 aa6.51□□□□□ -1.37
TRM10YOL093W PGM1P33401 570 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
TRM10YOL093W PGM2P37012 569 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
TRM10YOL093W SLX8P40072 274 aa6.51□□□□□ -1.37
TRM10YOL093W EMP47P43555 445 aa6.51□□□□□ -1.37
TRM10YOL093W SEC3P33332 1336 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
TRM10YOL093W ISF1P32488 338 aa6.5□□□□□ -1.37
TRM10YOL093W ALG14P38242 237 aa6.5□□□□□ -1.37
TRM10YOL093W KIP3P53086 805 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
TRM10YOL093W RIA1P53893 1110 aa6.5□□□□□ -1.37
TRM10YOL093W CAB1Q04430 367 aa6.5□□□□□ -1.37
TRM10YOL093W RPS31P05759 152 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
TRM10YOL093W AOS1Q06624 347 aa6.49□□□□□ -1.37
TRM10YOL093W AI3P03877 415 aa6.48□□□□□ -1.37
TRM10YOL093W SPE2P21182 396 aa6.48□□□□□ -1.37
TRM10YOL093W PKC1P24583 1151 aa6.48□□□□□ -1.37
TRM10YOL093W YPP1P46951 817 aa6.48□□□□□ -1.37
TRM10YOL093W TAF8Q03750 510 aa6.48□□□□□ -1.37
TRM10YOL093W YKR073CP36153 106 aa6.47□□□□□ -1.37
TRM10YOL093W LEU1P07264 779 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
TRM10YOL093W RPP1AP05318 106 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
TRM10YOL093W LIP5P32875 414 aa6.45□□□□□ -1.38
TRM10YOL093W MED7Q08278 222 aa6.45□□□□□ -1.38
TRM10YOL093W MCM16Q12262 181 aa6.45□□□□□ -1.38
TRM10YOL093W TRP3P00937 484 aa6.44□□□□□ -1.38
TRM10YOL093W ATG3P40344 310 aa6.44□□□□□ -1.38
TRM10YOL093W ALD2P47771 506 aa6.44□□□□□ -1.38
TRM10YOL093W YNR029CP53729 429 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
TRM10YOL093W ORC1P54784 914 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
TRM10YOL093W GAS5Q08193 484 aa6.44□□□□□ -1.38
TRM10YOL093W BIO2P32451 375 aa6.43□□□□□ -1.38
TRM10YOL093W YJL007CP47080 104 aa6.43□□□□□ -1.38
TRM10YOL093W HDA3Q06623 655 aa6.43□□□□□ -1.38
TRM10YOL093W TY4B-HP0C2J7 1802 aa6.43□□□□□ -1.38
TRM10YOL093W TY4B-JP47024 1803 aa6.43□□□□□ -1.38
TRM10YOL093W PSK1P31374 1356 aa6.43□□□□□ -1.38
TRM10YOL093W RGP1P16664 663 aa6.42□□□□□ -1.38
TRM10YOL093W SAC7P17121 654 aa6.42□□□□□ -1.38
TRM10YOL093W YDJ1P25491 409 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
TRM10YOL093W ELM1P32801 640 aa6.42□□□□□ -1.38
TRM10YOL093W YRF1-2P40105 1681 aa6.42□□□□□ -1.38
TRM10YOL093W SUP45P12385 437 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
TRM10YOL093W NAR1P23503 491 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
TRM10YOL093W COQ2P32378 372 aa6.4□□□□□ -1.38
TRM10YOL093W THI12P42883 340 aa6.4□□□□□ -1.38
TRM10YOL093W THI5P43534 340 aa6.4□□□□□ -1.38
TRM10YOL093W THI11P47183 340 aa6.4□□□□□ -1.38
TRM10YOL093W ARI1P53111 347 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
TRM10YOL093W YNL108CP53929 270 aa6.4□□□□□ -1.38
TRM10YOL093W THI13Q07748 340 aa6.4□□□□□ -1.38
TRM10YOL093W TOS1P38288 455 aa6.39□□□□□ -1.39
TRM10YOL093W CHZ1P40019 153 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
TRM10YOL093W RPL34BP40525 121 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
TRM10YOL093W RCM1P53972 490 aa6.39□□□□□ -1.39
TRM10YOL093W PDS5Q04264 1277 aa6.39□□□□□ -1.39
TRM10YOL093W UTP13Q05946 817 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
TRM10YOL093W YPQ2Q06328 317 aa6.39□□□□□ -1.39
TRM10YOL093W KAE1P36132 386 aa6.38□□□□□ -1.39
TRM10YOL093W RRP5Q05022 1729 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
TRM10YOL093W CPS1P27614 576 aa6.37□□□□□ -1.39
TRM10YOL093W SOH1P38633 127 aa6.37□□□□□ -1.39
TRM10YOL093W RRM3P38766 723 aa6.37□□□□□ -1.39
TRM10YOL093W BIM1P40013 344 aa6.37□□□□□ -1.39
TRM10YOL093W PRK1P40494 810 aa6.37□□□□□ -1.39
TRM10YOL093W CTH1P47976 325 aa6.37□□□□□ -1.39
TRM10YOL093W GIS4Q04233 774 aa6.37□□□□□ -1.39
TRM10YOL093W SNF2P22082 1703 aa6.36□□□□□ -1.39
TRM10YOL093W ENO2P00925 437 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
TRM10YOL093W MTR4P47047 1073 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
TRM10YOL093W YLR122CQ12312 125 aa6.36□□□□□ -1.39
TRM10YOL093W NAB2P32505 525 aaKnown RBP RIP-Chip data6.35□□□□□ -1.39 RIP-Chip
TRM10YOL093W YNL165WP53891 406 aa6.35□□□□□ -1.39
TRM10YOL093W HEH2Q03281 663 aa6.35□□□□□ -1.39
TRM10YOL093W FKS3Q04952 1785 aa6.35□□□□□ -1.39
TRM10YOL093W ADE6P38972 1358 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
TRM10YOL093W PDI1P17967 522 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
TRM10YOL093W PUB1P32588 453 aaKnown RBP RIP-Chip data6.34□□□□□ -1.39not detected
TRM10YOL093W YTA6P40328 754 aa6.34□□□□□ -1.39
TRM10YOL093W RIM21P48565 533 aa6.34□□□□□ -1.39
TRM10YOL093W LEU2P04173 364 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
TRM10YOL093W TIF1P10081 395 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 27.3 ms