RNA–Protein interactions for RNA: YNL046W

YNL046W, Transcript of Putative protein of unknown function, yeast

Gene YNL046W, Length 519 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL046W	YNL046W	ALD3	P54114	506 aa		5.81	□□□□□ -1.48
YNL046W	YNL046W	CHS2	P14180	963 aa		5.8	□□□□□ -1.48
YNL046W	YNL046W	SUT1	P53032	299 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
YNL046W	YNL046W	PNP1	Q05788	311 aa		5.8	□□□□□ -1.48
YNL046W	YNL046W	PUF3	Q07807	879 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.8	□□□□□ -1.48	not detected
YNL046W	YNL046W	SSA4	P22202	642 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
YNL046W	YNL046W	LIP5	P32875	414 aa		5.79	□□□□□ -1.48
YNL046W	YNL046W	YBR287W	P38355	427 aa		5.79	□□□□□ -1.48
YNL046W	YNL046W	GUP1	P53154	560 aa		5.79	□□□□□ -1.48
YNL046W	YNL046W	SOG2	Q08817	791 aa		5.79	□□□□□ -1.48
YNL046W	YNL046W	FUS1	P11710	512 aa		5.78	□□□□□ -1.48
YNL046W	YNL046W	RPB10	P22139	70 aa		5.78	□□□□□ -1.48
YNL046W	YNL046W	IRC24	P40580	263 aa		5.78	□□□□□ -1.48
YNL046W	YNL046W	AVT1	P47082	602 aa		5.78	□□□□□ -1.48
YNL046W	YNL046W	CTH1	P47976	325 aa		5.78	□□□□□ -1.48
YNL046W	YNL046W	APC11	Q12157	165 aa		5.78	□□□□□ -1.48
YNL046W	YNL046W	PUB1	P32588	453 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.76	□□□□□ -1.49	RIP-Chip
YNL046W	YNL046W	RRN6	P32786	894 aa		5.76	□□□□□ -1.49
YNL046W	YNL046W	POL5	P39985	1022 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
YNL046W	YNL046W	NTA1	P40354	457 aa		5.76	□□□□□ -1.49
YNL046W	YNL046W	LEM3	P42838	414 aa		5.76	□□□□□ -1.49
YNL046W	YNL046W	RAD55	P38953	406 aa		5.75	□□□□□ -1.49
YNL046W	YNL046W	BRE4	Q07660	1125 aa		5.75	□□□□□ -1.49
YNL046W	YNL046W	TIF6	Q12522	245 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
YNL046W	YNL046W	CYC7	P00045	113 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YNL046W	YNL046W	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
YNL046W	YNL046W	NEO1	P40527	1151 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YNL046W	YNL046W	YJR124C	P47159	448 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YNL046W	YNL046W	NCE103	P53615	221 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YNL046W	YNL046W	SPO71	Q03868	1245 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YNL046W	YNL046W	SPO74	P45819	413 aa		5.73	□□□□□ -1.49
YNL046W	YNL046W	MAG2	Q06436	670 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
YNL046W	YNL046W	ELG1	Q12050	791 aa		5.73	□□□□□ -1.49
YNL046W	YNL046W	ERS1	P17261	260 aa		5.72	□□□□□ -1.49
YNL046W	YNL046W	YNR065C	P53751	1116 aa		5.72	□□□□□ -1.49
YNL046W	YNL046W	LSO1	Q3E827	93 aa		5.72	□□□□□ -1.49
YNL046W	YNL046W	IRS4	P36115	615 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
YNL046W	YNL046W	BOL3	P39724	118 aa		5.71	□□□□□ -1.5
YNL046W	YNL046W	PSY2	P40164	858 aa		5.71	□□□□□ -1.5
YNL046W	YNL046W	HAS1	Q03532	505 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
YNL046W	YNL046W	HVG1	P0CE11	249 aa		5.7	□□□□□ -1.5
YNL046W	YNL046W	PYC2	P32327	1180 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
YNL046W	YNL046W	SMC1	P32908	1225 aa		5.7	□□□□□ -1.5
YNL046W	YNL046W	KIP3	P53086	805 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
YNL046W	YNL046W	GLO4	Q12320	285 aa		5.7	□□□□□ -1.5
YNL046W	YNL046W	FUR4	P05316	633 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
YNL046W	YNL046W	MSB1	P21339	1137 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
YNL046W	YNL046W	SEA4	P38164	1038 aa		5.67	□□□□□ -1.5
YNL046W	YNL046W	SDH1	Q00711	640 aa		5.67	□□□□□ -1.5
YNL046W	YNL046W	FET4	P40988	552 aa		5.66	□□□□□ -1.5
YNL046W	YNL046W	GIC2	Q06648	383 aa		5.66	□□□□□ -1.5
YNL046W	YNL046W	AOS1	Q06624	347 aa		5.65	□□□□□ -1.5
YNL046W	YNL046W	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	5.64	□□□□□ -1.51
YNL046W	YNL046W	ELM1	P32801	640 aa		5.64	□□□□□ -1.51
YNL046W	YNL046W	FAR11	P53917	953 aa		5.64	□□□□□ -1.51
YNL046W	YNL046W	SUB2	Q07478	446 aa	Known RBP	5.64	□□□□□ -1.51
YNL046W	YNL046W	CTR9	P89105	1077 aa		5.63	□□□□□ -1.51
YNL046W	YNL046W	YMR074C	Q04773	145 aa		5.63	□□□□□ -1.51
YNL046W	YNL046W	COB	P00163	385 aa		5.61	□□□□□ -1.51
YNL046W	YNL046W	GPT2	P36148	743 aa		5.61	□□□□□ -1.51
YNL046W	YNL046W	YOR223W	Q12015	292 aa		5.61	□□□□□ -1.51
YNL046W	YNL046W	RNQ1	P25367	405 aa		5.6	□□□□□ -1.51
YNL046W	YNL046W	WHI3	P34761	661 aa	Known RBP	5.6	□□□□□ -1.51
YNL046W	YNL046W	LRG1	P35688	1017 aa		5.6	□□□□□ -1.51
YNL046W	YNL046W	GLO3	P38682	493 aa	Known RBP	5.6	□□□□□ -1.51
YNL046W	YNL046W	MMM1	P41800	426 aa		5.59	□□□□□ -1.51
YNL046W	YNL046W	DUR3	P33413	735 aa		5.58	□□□□□ -1.52
YNL046W	YNL046W	SEG2	P34250	1132 aa		5.58	□□□□□ -1.52
YNL046W	YNL046W	POL12	P38121	705 aa	Predicted RBP	5.58	□□□□□ -1.52
YNL046W	YNL046W	QDR1	P40475	563 aa		5.58	□□□□□ -1.52
YNL046W	YNL046W	DOT1	Q04089	582 aa	Known RBP	5.58	□□□□□ -1.52
YNL046W	YNL046W	KAR5	Q04746	504 aa		5.58	□□□□□ -1.52
YNL046W	YNL046W	CMR1	Q12510	522 aa	Known RBP	5.57	□□□□□ -1.52
YNL046W	YNL046W	NPR1	P22211	790 aa		5.56	□□□□□ -1.52
YNL046W	YNL046W	RIM11	P38615	370 aa		5.56	□□□□□ -1.52
YNL046W	YNL046W	CIT3	P43635	486 aa		5.56	□□□□□ -1.52
YNL046W	YNL046W	GCV1	P48015	400 aa		5.56	□□□□□ -1.52
YNL046W	YNL046W	RSC4	Q02206	625 aa		5.56	□□□□□ -1.52
YNL046W	YNL046W	YIG1	Q08956	461 aa		5.56	□□□□□ -1.52
YNL046W	YNL046W	ECM2	P38241	364 aa	Known RBP	5.55	□□□□□ -1.52
YNL046W	YNL046W	UBP5	P39944	805 aa		5.55	□□□□□ -1.52
YNL046W	YNL046W	UFD2	P54860	961 aa		5.55	□□□□□ -1.52
YNL046W	YNL046W	YLL054C	Q12244	843 aa		5.55	□□□□□ -1.52
YNL046W	YNL046W	HTS1	P07263	546 aa	Known RBP	5.54	□□□□□ -1.52
YNL046W	YNL046W	RCM1	P53972	490 aa		5.54	□□□□□ -1.52
YNL046W	YNL046W	DFG16	Q99234	619 aa		5.54	□□□□□ -1.52
YNL046W	YNL046W	RPL34A	P87262	121 aa	Predicted RBP	5.53	□□□□□ -1.52
YNL046W	YNL046W	NSI1	Q12457	570 aa		5.53	□□□□□ -1.52
YNL046W	YNL046W	ECL1	P48235	211 aa		5.52	□□□□□ -1.53
YNL046W	YNL046W	ATG1	P53104	897 aa		5.52	□□□□□ -1.53
YNL046W	YNL046W	ALG6	Q12001	544 aa	Known RBP	5.52	□□□□□ -1.53
YNL046W	YNL046W	RPS4A	P0CX35	261 aa	Known RBP	5.51	□□□□□ -1.53
YNL046W	YNL046W	RPS4B	P0CX36	261 aa	Known RBP	5.51	□□□□□ -1.53
YNL046W	YNL046W	PRP5	P21372	849 aa	Predicted RBP	5.51	□□□□□ -1.53
YNL046W	YNL046W	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	5.51	□□□□□ -1.53
YNL046W	YNL046W	MEC3	Q02574	474 aa		5.51	□□□□□ -1.53
YNL046W	YNL046W	RLF2	Q12495	606 aa		5.51	□□□□□ -1.53
YNL046W	YNL046W	HSP78	P33416	811 aa		5.5	□□□□□ -1.53
YNL046W	YNL046W	YHL008C	P38750	627 aa		5.5	□□□□□ -1.53
YNL046W	YNL046W	MSH4	P40965	878 aa	Predicted RBP	5.5	□□□□□ -1.53

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 15.4 ms