RNA–Protein interactions for RNA: YMR196W

YMR196W, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene YMR196W, Length 3,267 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR196WYMR196W TAH18Q12181 623 aa5.41□□□□□ -1.54
YMR196WYMR196W HSC82P15108 705 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
YMR196WYMR196W SET4P42948 560 aa5.4□□□□□ -1.54
YMR196WYMR196W ECM23Q02710 187 aa5.4□□□□□ -1.54
YMR196WYMR196W MCM1P11746 286 aa5.4□□□□□ -1.55
YMR196WYMR196W TPM1P17536 199 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.55
YMR196WYMR196W HRQ1Q05549 1077 aa5.4□□□□□ -1.55
YMR196WYMR196W PPM2Q08282 695 aa5.4□□□□□ -1.55
YMR196WYMR196W CYB2P00175 591 aa5.4□□□□□ -1.55
YMR196WYMR196W RPT3P33298 428 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.55
YMR196WYMR196W TSR3Q12094 313 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.55
YMR196WYMR196W RET1P22276 1149 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
YMR196WYMR196W NPL4P33755 580 aa5.39□□□□□ -1.55
YMR196WYMR196W MET1P36150 593 aa5.39□□□□□ -1.55
YMR196WYMR196W BDH2P39713 417 aa5.39□□□□□ -1.55
YMR196WYMR196W IRC8P47046 822 aa5.39□□□□□ -1.55
YMR196WYMR196W MSN5P52918 1224 aa5.39□□□□□ -1.55
YMR196WYMR196W TOS4Q06266 489 aa5.39□□□□□ -1.55
YMR196WYMR196W FLO1P32768 1537 aa5.39□□□□□ -1.55
YMR196WYMR196W CLC1P17891 233 aa5.39□□□□□ -1.55
YMR196WYMR196W PEP3P27801 918 aa5.39□□□□□ -1.55
YMR196WYMR196W SKI2P35207 1287 aaKnown RBP RIP-Chip data5.39□□□□□ -1.55not detected
YMR196WYMR196W HAP5Q02516 242 aa5.39□□□□□ -1.55
YMR196WYMR196W COQ1P18900 473 aa5.38□□□□□ -1.55
YMR196WYMR196W GAL11P19659 1081 aa5.38□□□□□ -1.55
YMR196WYMR196W YKL222CP35995 705 aa5.38□□□□□ -1.55
YMR196WYMR196W VID28P40547 921 aa5.38□□□□□ -1.55
YMR196WYMR196W IOC3P43596 787 aa5.38□□□□□ -1.55
YMR196WYMR196W EAF6P47128 113 aa5.38□□□□□ -1.55
YMR196WYMR196W DOS2P54858 310 aa5.38□□□□□ -1.55
YMR196WYMR196W KIN4Q01919 800 aa5.38□□□□□ -1.55
YMR196WYMR196W ETT1Q08421 412 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
YMR196WYMR196W RPL19AP0CX82 189 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
YMR196WYMR196W RPL19BP0CX83 189 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
YMR196WYMR196W PTK1P36002 662 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
YMR196WYMR196W SEC9P40357 651 aa5.38□□□□□ -1.55
YMR196WYMR196W UBX2Q04228 584 aa5.38□□□□□ -1.55
YMR196WYMR196W SNF3P10870 884 aa5.38□□□□□ -1.55
YMR196WYMR196W BIK1P11709 440 aa5.38□□□□□ -1.55
YMR196WYMR196W YFH7P43591 353 aa5.38□□□□□ -1.55
YMR196WYMR196W CTF18P49956 741 aa5.38□□□□□ -1.55
YMR196WYMR196W HST1P53685 503 aa5.38□□□□□ -1.55
YMR196WYMR196W PSK2Q08217 1101 aa5.38□□□□□ -1.55
YMR196WYMR196W CFT2Q12102 859 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
YMR196WYMR196W SSF2Q12153 453 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
YMR196WYMR196W CHO2P05374 869 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
YMR196WYMR196W IMP2'P32351 346 aa5.37□□□□□ -1.55
YMR196WYMR196W FBP26P32604 452 aa5.37□□□□□ -1.55
YMR196WYMR196W CIR1P42940 261 aa5.37□□□□□ -1.55
YMR196WYMR196W MEH1Q02205 184 aa5.37□□□□□ -1.55
YMR196WYMR196W MATALPHA2P0CY08 210 aa5.37□□□□□ -1.55
YMR196WYMR196W HMLALPHA2P0CY09 210 aa5.37□□□□□ -1.55
YMR196WYMR196W MBR1P23493 339 aa5.37□□□□□ -1.55
YMR196WYMR196W BOI1P38041 980 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
YMR196WYMR196W CRG1P38892 291 aaRIP-Chip data5.37□□□□□ -1.55not detected
YMR196WYMR196W HYR1P40581 163 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
YMR196WYMR196W ENP2P48234 707 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
YMR196WYMR196W GIR2Q03768 265 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
YMR196WYMR196W WRS1Q12109 432 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
YMR196WYMR196W SLN1P39928 1220 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
YMR196WYMR196W YGL081WP53156 320 aa5.36□□□□□ -1.55
YMR196WYMR196W GAS5Q08193 484 aa5.36□□□□□ -1.55
YMR196WYMR196W YLR407WQ06070 228 aa5.36□□□□□ -1.55
YMR196WYMR196W SPN1Q06505 410 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
YMR196WYMR196W PSF3Q12146 194 aa5.36□□□□□ -1.55
YMR196WYMR196W YPL150WQ12152 901 aa5.36□□□□□ -1.55
YMR196WYMR196W GSC2P40989 1895 aa5.36□□□□□ -1.55
YMR196WYMR196W CPA2P03965 1118 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
YMR196WYMR196W CTT1P06115 562 aa5.36□□□□□ -1.55
YMR196WYMR196W KNS1P32350 737 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
YMR196WYMR196W RER2P35196 286 aa5.36□□□□□ -1.55
YMR196WYMR196W ARL1P38116 183 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
YMR196WYMR196W NSG2P53898 299 aa5.36□□□□□ -1.55
YMR196WYMR196W GRX6Q12438 231 aa5.36□□□□□ -1.55
YMR196WYMR196W PRX1P34227 261 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
YMR196WYMR196W YHL050CP38721 697 aa5.35□□□□□ -1.55
YMR196WYMR196W SLX8P40072 274 aa5.35□□□□□ -1.55
YMR196WYMR196W JJJ2P46997 583 aa5.35□□□□□ -1.55
YMR196WYMR196W NNF2P53253 936 aa5.35□□□□□ -1.55
YMR196WYMR196W ARP5P53946 755 aa5.35□□□□□ -1.55
YMR196WYMR196W HDA1P53973 706 aa5.35□□□□□ -1.55
YMR196WYMR196W APL5Q08951 932 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
YMR196WYMR196W FLO11P08640 1367 aa5.35□□□□□ -1.55
YMR196WYMR196W ARG82P07250 355 aa5.35□□□□□ -1.55
YMR196WYMR196W PET111P08468 800 aa5.35□□□□□ -1.55
YMR196WYMR196W YHL017WP38745 532 aa5.35□□□□□ -1.55
YMR196WYMR196W YKE2P52553 114 aa5.35□□□□□ -1.55
YMR196WYMR196W KRE33P53914 1056 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
YMR196WYMR196W ESF1Q06344 628 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
YMR196WYMR196W ELG1Q12050 791 aa5.35□□□□□ -1.55
YMR196WYMR196W MDL2P33311 773 aa5.35□□□□□ -1.55
YMR196WYMR196W TTI1P36097 1038 aa5.35□□□□□ -1.55
YMR196WYMR196W ENT3P47160 408 aa5.35□□□□□ -1.55
YMR196WYMR196W RCF1Q03713 159 aa5.35□□□□□ -1.55
YMR196WYMR196W PRP42Q03776 544 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
YMR196WYMR196W YDR341CQ05506 607 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
YMR196WYMR196W ICL1P28240 557 aaPredicted RBP5.34□□□□□ -1.55
YMR196WYMR196W MPE1P35728 441 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
YMR196WYMR196W PTK2P47116 818 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
YMR196WYMR196W UFD2P54860 961 aa5.34□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 46.7 ms