RNA–Protein interactions for RNA: YJR055W

HIT1, Transcript of Protein involved in C/D snoRNP assembly, yeast

Gene HIT1, Length 495 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HIT1	YJR055W	SOG2	Q08817	791 aa		5.02	□□□□□ -1.61
HIT1	YJR055W	APC11	Q12157	165 aa		5.02	□□□□□ -1.61
HIT1	YJR055W	REC8	Q12188	680 aa		5.01	□□□□□ -1.61
HIT1	YJR055W	NAM7	P30771	971 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
HIT1	YJR055W	RRN6	P32786	894 aa		5	□□□□□ -1.61
HIT1	YJR055W	AKR1	P39010	764 aa		5	□□□□□ -1.61
HIT1	YJR055W	SUT1	P53032	299 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
HIT1	YJR055W	PUF3	Q07807	879 aa	Known RBP RIP-Chip data	5	□□□□□ -1.61	not detected
HIT1	YJR055W	FUS1	P11710	512 aa		4.99	□□□□□ -1.61
HIT1	YJR055W	TOS1	P38288	455 aa		4.99	□□□□□ -1.61
HIT1	YJR055W	NTA1	P40354	457 aa		4.99	□□□□□ -1.61
HIT1	YJR055W	LEM3	P42838	414 aa		4.99	□□□□□ -1.61
HIT1	YJR055W	CHS2	P14180	963 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HIT1	YJR055W	RPB10	P22139	70 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HIT1	YJR055W	POL5	P39985	1022 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
HIT1	YJR055W	CTH1	P47976	325 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HIT1	YJR055W	YGR130C	P53278	816 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HIT1	YJR055W	PUB1	P32588	453 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.97	□□□□□ -1.61	not detected
HIT1	YJR055W	IRC24	P40580	263 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HIT1	YJR055W	TIF6	Q12522	245 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
HIT1	YJR055W	LSO1	Q3E827	93 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HIT1	YJR055W	LIP5	P32875	414 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HIT1	YJR055W	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
HIT1	YJR055W	RAD55	P38953	406 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HIT1	YJR055W	NCE103	P53615	221 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HIT1	YJR055W	IRS4	P36115	615 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
HIT1	YJR055W	SPO74	P45819	413 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HIT1	YJR055W	AVT1	P47082	602 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HIT1	YJR055W	YJR124C	P47159	448 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HIT1	YJR055W	YNR065C	P53751	1116 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HIT1	YJR055W	SPO71	Q03868	1245 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HIT1	YJR055W	BRE4	Q07660	1125 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HIT1	YJR055W	ELG1	Q12050	791 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HIT1	YJR055W	HVG1	P0CE11	249 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HIT1	YJR055W	SMC1	P32908	1225 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HIT1	YJR055W	PSY2	P40164	858 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HIT1	YJR055W	NEO1	P40527	1151 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HIT1	YJR055W	GLO4	Q12320	285 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HIT1	YJR055W	CYC7	P00045	113 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HIT1	YJR055W	ERS1	P17261	260 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HIT1	YJR055W	BOL3	P39724	118 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HIT1	YJR055W	HAS1	Q03532	505 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
HIT1	YJR055W	MAG2	Q06436	670 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
HIT1	YJR055W	FUR4	P05316	633 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
HIT1	YJR055W	PYC2	P32327	1180 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
HIT1	YJR055W	MSB1	P21339	1137 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
HIT1	YJR055W	KIP3	P53086	805 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
HIT1	YJR055W	FET4	P40988	552 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HIT1	YJR055W	SUB2	Q07478	446 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
HIT1	YJR055W	SEA4	P38164	1038 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HIT1	YJR055W	CTR9	P89105	1077 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HIT1	YJR055W	AOS1	Q06624	347 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HIT1	YJR055W	GIC2	Q06648	383 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HIT1	YJR055W	ELM1	P32801	640 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HIT1	YJR055W	FAR11	P53917	953 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HIT1	YJR055W	SDH1	Q00711	640 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HIT1	YJR055W	COB	P00163	385 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HIT1	YJR055W	YOR223W	Q12015	292 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HIT1	YJR055W	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
HIT1	YJR055W	RSC4	Q02206	625 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HIT1	YJR055W	YMR074C	Q04773	145 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HIT1	YJR055W	GPT2	P36148	743 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HIT1	YJR055W	RIM11	P38615	370 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HIT1	YJR055W	GLO3	P38682	493 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
HIT1	YJR055W	UFD2	P54860	961 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HIT1	YJR055W	DUR3	P33413	735 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HIT1	YJR055W	WHI3	P34761	661 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
HIT1	YJR055W	QDR1	P40475	563 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HIT1	YJR055W	MMM1	P41800	426 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HIT1	YJR055W	KAR5	Q04746	504 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HIT1	YJR055W	RLF2	Q12495	606 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HIT1	YJR055W	CMR1	Q12510	522 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
HIT1	YJR055W	NPR1	P22211	790 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HIT1	YJR055W	LRG1	P35688	1017 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HIT1	YJR055W	GCV1	P48015	400 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HIT1	YJR055W	DOT1	Q04089	582 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
HIT1	YJR055W	YIG1	Q08956	461 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HIT1	YJR055W	HTS1	P07263	546 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
HIT1	YJR055W	PRP5	P21372	849 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
HIT1	YJR055W	RNQ1	P25367	405 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HIT1	YJR055W	SEG2	P34250	1132 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HIT1	YJR055W	CIT3	P43635	486 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HIT1	YJR055W	YLL054C	Q12244	843 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HIT1	YJR055W	ECM2	P38241	364 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
HIT1	YJR055W	ATG1	P53104	897 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HIT1	YJR055W	POL12	P38121	705 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
HIT1	YJR055W	RCM1	P53972	490 aa		4.78	□□□□□ -1.64
HIT1	YJR055W	RPL34A	P87262	121 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
HIT1	YJR055W	MSH6	Q03834	1242 aa		4.78	□□□□□ -1.64
HIT1	YJR055W	MNL2	Q12205	849 aa		4.78	□□□□□ -1.64
HIT1	YJR055W	UBP5	P39944	805 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HIT1	YJR055W	ACF4	P47129	309 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HIT1	YJR055W	YNL011C	P53980	444 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HIT1	YJR055W	MEC3	Q02574	474 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HIT1	YJR055W	TRS120	Q04183	1289 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HIT1	YJR055W	YOR059C	Q08448	450 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
HIT1	YJR055W	NSI1	Q12457	570 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HIT1	YJR055W	DFG16	Q99234	619 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HIT1	YJR055W	RPS4A	P0CX35	261 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
HIT1	YJR055W	RPS4B	P0CX36	261 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65

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