RNA–Protein interactions for RNA: YJL004C

SYS1, Transcript of Integral membrane protein of the Golgi, yeast

Gene SYS1, Length 612 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYS1	YJL004C	RGD2	P43556	714 aa		6.01	□□□□□ -1.45
SYS1	YJL004C	MED7	Q08278	222 aa		6.01	□□□□□ -1.45
SYS1	YJL004C	LSO1	Q3E827	93 aa		6.01	□□□□□ -1.45
SYS1	YJL004C	RAD55	P38953	406 aa		6	□□□□□ -1.45
SYS1	YJL004C	ALD3	P54114	506 aa		5.99	□□□□□ -1.45
SYS1	YJL004C	YLR122C	Q12312	125 aa		5.99	□□□□□ -1.45
SYS1	YJL004C	RLF2	Q12495	606 aa		5.99	□□□□□ -1.45
SYS1	YJL004C	CHS2	P14180	963 aa		5.98	□□□□□ -1.45
SYS1	YJL004C	IRS4	P36115	615 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
SYS1	YJL004C	BOI1	P38041	980 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
SYS1	YJL004C	SPO71	Q03868	1245 aa		5.98	□□□□□ -1.45
SYS1	YJL004C	KTR2	P33550	425 aa		5.97	□□□□□ -1.45
SYS1	YJL004C	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	5.97	□□□□□ -1.45
SYS1	YJL004C	TFA2	P36145	328 aa		5.97	□□□□□ -1.45
SYS1	YJL004C	REC8	Q12188	680 aa		5.97	□□□□□ -1.45
SYS1	YJL004C	RPB10	P22139	70 aa		5.96	□□□□□ -1.46
SYS1	YJL004C	AKR1	P39010	764 aa		5.96	□□□□□ -1.46
SYS1	YJL004C	PSY2	P40164	858 aa		5.96	□□□□□ -1.46
SYS1	YJL004C	SUB2	Q07478	446 aa	Known RBP	5.96	□□□□□ -1.46
SYS1	YJL004C	TIF6	Q12522	245 aa	Known RBP	5.96	□□□□□ -1.46
SYS1	YJL004C	YKR073C	P36153	106 aa		5.95	□□□□□ -1.46
SYS1	YJL004C	POL5	P39985	1022 aa	Known RBP	5.95	□□□□□ -1.46
SYS1	YJL004C	TRP3	P00937	484 aa		5.94	□□□□□ -1.46
SYS1	YJL004C	NEO1	P40527	1151 aa		5.94	□□□□□ -1.46
SYS1	YJL004C	PUF3	Q07807	879 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.94	□□□□□ -1.46	not detected
SYS1	YJL004C	ELG1	Q12050	791 aa		5.94	□□□□□ -1.46
SYS1	YJL004C	TOS1	P38288	455 aa		5.93	□□□□□ -1.46
SYS1	YJL004C	BOL3	P39724	118 aa		5.93	□□□□□ -1.46
SYS1	YJL004C	YGR130C	P53278	816 aa		5.93	□□□□□ -1.46
SYS1	YJL004C	NAM7	P30771	971 aa	Known RBP	5.92	□□□□□ -1.46
SYS1	YJL004C	LIP5	P32875	414 aa		5.92	□□□□□ -1.46
SYS1	YJL004C	YJR124C	P47159	448 aa		5.92	□□□□□ -1.46
SYS1	YJL004C	YNR065C	P53751	1116 aa		5.92	□□□□□ -1.46
SYS1	YJL004C	PYC2	P32327	1180 aa	Known RBP	5.91	□□□□□ -1.46
SYS1	YJL004C	PUB1	P32588	453 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.91	□□□□□ -1.46	RIP-Chip
SYS1	YJL004C	IRC24	P40580	263 aa		5.91	□□□□□ -1.46
SYS1	YJL004C	SPO74	P45819	413 aa		5.91	□□□□□ -1.46
SYS1	YJL004C	NCE103	P53615	221 aa		5.91	□□□□□ -1.46
SYS1	YJL004C	FAR11	P53917	953 aa		5.91	□□□□□ -1.46
SYS1	YJL004C	RPL34A	P87262	121 aa	Predicted RBP	5.91	□□□□□ -1.46
SYS1	YJL004C	GLO4	Q12320	285 aa		5.91	□□□□□ -1.46
SYS1	YJL004C	HVG1	P0CE11	249 aa		5.9	□□□□□ -1.46
SYS1	YJL004C	MSB1	P21339	1137 aa	Known RBP	5.9	□□□□□ -1.46
SYS1	YJL004C	FET4	P40988	552 aa		5.9	□□□□□ -1.46
SYS1	YJL004C	HAS1	Q03532	505 aa	Known RBP	5.9	□□□□□ -1.46
SYS1	YJL004C	UFD2	P54860	961 aa		5.89	□□□□□ -1.47
SYS1	YJL004C	CYC7	P00045	113 aa		5.88	□□□□□ -1.47
SYS1	YJL004C	ERS1	P17261	260 aa		5.88	□□□□□ -1.47
SYS1	YJL004C	KAR5	Q04746	504 aa		5.88	□□□□□ -1.47
SYS1	YJL004C	BRE4	Q07660	1125 aa		5.88	□□□□□ -1.47
SYS1	YJL004C	GLO3	P38682	493 aa	Known RBP	5.87	□□□□□ -1.47
SYS1	YJL004C	KIP3	P53086	805 aa	Known RBP	5.87	□□□□□ -1.47
SYS1	YJL004C	GIC2	Q06648	383 aa		5.87	□□□□□ -1.47
SYS1	YJL004C	YLL054C	Q12244	843 aa		5.87	□□□□□ -1.47
SYS1	YJL004C	ECM2	P38241	364 aa	Known RBP	5.86	□□□□□ -1.47
SYS1	YJL004C	QDR1	P40475	563 aa		5.86	□□□□□ -1.47
SYS1	YJL004C	MAG2	Q06436	670 aa	Known RBP	5.86	□□□□□ -1.47
SYS1	YJL004C	AVT1	P47082	602 aa		5.85	□□□□□ -1.47
SYS1	YJL004C	CTH1	P47976	325 aa		5.85	□□□□□ -1.47
SYS1	YJL004C	YMR074C	Q04773	145 aa		5.85	□□□□□ -1.47
SYS1	YJL004C	YOR223W	Q12015	292 aa		5.85	□□□□□ -1.47
SYS1	YJL004C	ATG1	P53104	897 aa		5.84	□□□□□ -1.47
SYS1	YJL004C	RSC4	Q02206	625 aa		5.84	□□□□□ -1.47
SYS1	YJL004C	ACF4	P47129	309 aa		5.82	□□□□□ -1.48
SYS1	YJL004C	GCV1	P48015	400 aa		5.82	□□□□□ -1.48
SYS1	YJL004C	CTR9	P89105	1077 aa		5.82	□□□□□ -1.48
SYS1	YJL004C	AOS1	Q06624	347 aa		5.82	□□□□□ -1.48
SYS1	YJL004C	NSI1	Q12457	570 aa		5.82	□□□□□ -1.48
SYS1	YJL004C	YIG1	Q08956	461 aa		5.81	□□□□□ -1.48
SYS1	YJL004C	MMM1	P41800	426 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SYS1	YJL004C	TRS120	Q04183	1289 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SYS1	YJL004C	SSA1	P10591	642 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
SYS1	YJL004C	NPR1	P22211	790 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SYS1	YJL004C	ELM1	P32801	640 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SYS1	YJL004C	RIM11	P38615	370 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SYS1	YJL004C	CIT3	P43635	486 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SYS1	YJL004C	YNL011C	P53980	444 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SYS1	YJL004C	MSH6	Q03834	1242 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SYS1	YJL004C	DOT1	Q04089	582 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
SYS1	YJL004C	YOR059C	Q08448	450 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
SYS1	YJL004C	COB	P00163	385 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SYS1	YJL004C	HTS1	P07263	546 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
SYS1	YJL004C	GPT2	P36148	743 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SYS1	YJL004C	BSC2	Q05611	235 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SYS1	YJL004C	CMR1	Q12510	522 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
SYS1	YJL004C	PRP5	P21372	849 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
SYS1	YJL004C	CDC55	Q00362	526 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SYS1	YJL004C	MEC3	Q02574	474 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SYS1	YJL004C	WHI3	P34761	661 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
SYS1	YJL004C	YHL008C	P38750	627 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SYS1	YJL004C	UTP22	P53254	1237 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
SYS1	YJL004C	SDH1	Q00711	640 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SYS1	YJL004C	PMT7	Q06644	662 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SYS1	YJL004C	FLP1	P03870	423 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SYS1	YJL004C	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
SYS1	YJL004C	CDC3	P32457	520 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
SYS1	YJL004C	SAP155	P43612	1002 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SYS1	YJL004C	RCM1	P53972	490 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SYS1	YJL004C	DUR3	P33413	735 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SYS1	YJL004C	ARL1	P38116	183 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49

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