RNA–Protein interactions for RNA: YHL038C

CBP2, Required for splicing of the group I intron bI5 of the COB pre-mRNA, yeast

Gene CBP2, Length 1,893 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CBP2	YHL038C	MAD1	P40957	749 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CBP2	YHL038C	SAM37	P50110	327 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CBP2	YHL038C	OXR1	Q08952	273 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CBP2	YHL038C	NHA1	Q99271	985 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CBP2	YHL038C	MCM2	P29469	868 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CBP2	YHL038C	OCA5	P38738	679 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CBP2	YHL038C	UBP5	P39944	805 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CBP2	YHL038C	YNL011C	P53980	444 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CBP2	YHL038C	MNL2	Q12205	849 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CBP2	YHL038C	AI3	P03877	415 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CBP2	YHL038C	VPS35	P34110	944 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CBP2	YHL038C	LDH1	P38139	375 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CBP2	YHL038C	HXT8	P40886	569 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CBP2	YHL038C	DAK2	P43550	591 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CBP2	YHL038C	YPQ2	Q06328	317 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CBP2	YHL038C	CIC1	P38779	376 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
CBP2	YHL038C	FIR1	P40020	876 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CBP2	YHL038C	CDC55	Q00362	526 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CBP2	YHL038C	SPR28	Q04921	423 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CBP2	YHL038C	TRP3	P00937	484 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CBP2	YHL038C	VMA3	P25515	160 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CBP2	YHL038C	RMD1	Q03441	430 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CBP2	YHL038C	NOC3	Q07896	663 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
CBP2	YHL038C	Q0182	Q9ZZW1	134 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CBP2	YHL038C	CLN2	P20438	545 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CBP2	YHL038C	SHM1	P37292	490 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
CBP2	YHL038C	DYS1	P38791	387 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CBP2	YHL038C	RPS26A	P39938	119 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
CBP2	YHL038C	RPS26B	P39939	119 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
CBP2	YHL038C	YTA6	P40328	754 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CBP2	YHL038C	PSH1	Q12161	406 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CBP2	YHL038C	PDC6	P26263	563 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
CBP2	YHL038C	YBR287W	P38355	427 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CBP2	YHL038C	RAD55	P38953	406 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CBP2	YHL038C	FPR4	Q06205	392 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
CBP2	YHL038C	ESF1	Q06344	628 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
CBP2	YHL038C	MAG2	Q06436	670 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
CBP2	YHL038C	PUB1	P32588	453 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.21	□□□□□ -1.74	not detected
CBP2	YHL038C	VAC8	P39968	578 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CBP2	YHL038C	ALD6	P54115	500 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
CBP2	YHL038C	BSC2	Q05611	235 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CBP2	YHL038C	UTP4	Q06679	776 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
CBP2	YHL038C	KAE1	P36132	386 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CBP2	YHL038C	PGM2	P37012	569 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
CBP2	YHL038C	ALG14	P38242	237 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CBP2	YHL038C	TOS1	P38288	455 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CBP2	YHL038C	MSC7	P38694	644 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CBP2	YHL038C	CTH1	P47976	325 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CBP2	YHL038C	CWC24	P53769	259 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CBP2	YHL038C	SAC7	P17121	654 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CBP2	YHL038C	MLF3	P32047	452 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CBP2	YHL038C	COQ2	P32378	372 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CBP2	YHL038C	KTR2	P33550	425 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CBP2	YHL038C	PET112	P33893	541 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CBP2	YHL038C	QDR2	P40474	542 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CBP2	YHL038C	ARI1	P53111	347 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
CBP2	YHL038C	YGR122W	P53272	402 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CBP2	YHL038C	RSC4	Q02206	625 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CBP2	YHL038C	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
CBP2	YHL038C	YOL098C	Q12496	1037 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CBP2	YHL038C	BRN1	P38170	754 aa		4.19	□□□□□ -1.74
CBP2	YHL038C	VPS16	Q03308	798 aa		4.19	□□□□□ -1.74
CBP2	YHL038C	PIN2	Q12057	282 aa		4.19	□□□□□ -1.74
CBP2	YHL038C	RPP1A	P05318	106 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
CBP2	YHL038C	MSN1	P22148	382 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CBP2	YHL038C	IRS4	P36115	615 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
CBP2	YHL038C	YHL008C	P38750	627 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CBP2	YHL038C	NTA1	P40354	457 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CBP2	YHL038C	YNL165W	P53891	406 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CBP2	YHL038C	ALD3	P54114	506 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CBP2	YHL038C	INP54	Q08227	384 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
CBP2	YHL038C	MON2	P48563	1636 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
CBP2	YHL038C	CYC8	P14922	966 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CBP2	YHL038C	SRP40	P32583	406 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
CBP2	YHL038C	KAP122	P32767	1081 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CBP2	YHL038C	MNR2	P35724	969 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CBP2	YHL038C	ECM2	P38241	364 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
CBP2	YHL038C	PSY2	P40164	858 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CBP2	YHL038C	MTO1	P53070	669 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CBP2	YHL038C	DAL4	Q04895	635 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CBP2	YHL038C	RAD2	P07276	1031 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CBP2	YHL038C	ISW1	P38144	1129 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CBP2	YHL038C	MRPS18	P42847	217 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CBP2	YHL038C	BRE4	Q07660	1125 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CBP2	YHL038C	TIF6	Q12522	245 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
CBP2	YHL038C	KAR2	P16474	682 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
CBP2	YHL038C	YCR015C	P25616	317 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CBP2	YHL038C	RGD2	P43556	714 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CBP2	YHL038C	YCS4	Q06156	1176 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CBP2	YHL038C	GAS5	Q08193	484 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CBP2	YHL038C	YLR122C	Q12312	125 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CBP2	YHL038C	PRE9	P23638	258 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.74
CBP2	YHL038C	GIP1	P38229	639 aa		4.15	□□□□□ -1.74
CBP2	YHL038C	NMD2	P38798	1089 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.74
CBP2	YHL038C	MCD1	Q12158	566 aa		4.15	□□□□□ -1.74
CBP2	YHL038C	HXK1	P04806	485 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
CBP2	YHL038C	YKL091C	P33324	310 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
CBP2	YHL038C	YKL222C	P35995	705 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CBP2	YHL038C	FAA3	P39002	694 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CBP2	YHL038C	OSW7	P43611	510 aa		4.15	□□□□□ -1.75

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14.9 ms