RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626061.2

SNAP23-222, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 237 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-222	ENST00000626061	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		10.84	□□□□□ -0.67
SNAP23-222	ENST00000626061	SLC15A2	Q16348	729 aa		10.83	□□□□□ -0.68
SNAP23-222	ENST00000626061	NRAP	Q86VF7	1730 aa		10.83	□□□□□ -0.68
SNAP23-222	ENST00000626061	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		10.83	□□□□□ -0.68
SNAP23-222	ENST00000626061	NPM3	O75607	178 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
SNAP23-222	ENST00000626061	POLD1	P28340	1107 aa		10.82	□□□□□ -0.68
SNAP23-222	ENST00000626061	AIDA	Q96BJ3	306 aa		10.82	□□□□□ -0.68
SNAP23-222	ENST00000626061	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		10.82	□□□□□ -0.68
SNAP23-222	ENST00000626061	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		10.82	□□□□□ -0.68
SNAP23-222	ENST00000626061	PLSCR1	O15162	318 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SNAP23-222	ENST00000626061	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
SNAP23-222	ENST00000626061	PDE3B	Q13370	1112 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SNAP23-222	ENST00000626061	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SNAP23-222	ENST00000626061	MBD5	Q9P267	1494 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SNAP23-222	ENST00000626061	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SNAP23-222	ENST00000626061	GCC1	Q96CN9	775 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SNAP23-222	ENST00000626061	LBX1	P52954	281 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SNAP23-222	ENST00000626061	BTG4	Q9NY30	223 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SNAP23-222	ENST00000626061	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
SNAP23-222	ENST00000626061	CUL9	Q8IWT3	2517 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SNAP23-222	ENST00000626061	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
SNAP23-222	ENST00000626061	FOXO3	O43524	673 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SNAP23-222	ENST00000626061	PLEKHG5	O94827	1062 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SNAP23-222	ENST00000626061	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	10.76	□□□□□ -0.69
SNAP23-222	ENST00000626061	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		10.75	□□□□□ -0.69
SNAP23-222	ENST00000626061	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		10.75	□□□□□ -0.69
SNAP23-222	ENST00000626061	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SNAP23-222	ENST00000626061	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	10.74	□□□□□ -0.69
SNAP23-222	ENST00000626061	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	10.74	□□□□□ -0.69
SNAP23-222	ENST00000626061	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SNAP23-222	ENST00000626061	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SNAP23-222	ENST00000626061	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	10.74	□□□□□ -0.69
SNAP23-222	ENST00000626061	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SNAP23-222	ENST00000626061	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		10.73	□□□□□ -0.69
SNAP23-222	ENST00000626061	SLC17A8	Q8NDX2	589 aa		10.73	□□□□□ -0.69
SNAP23-222	ENST00000626061	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		10.73	□□□□□ -0.69
SNAP23-222	ENST00000626061	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	10.73	□□□□□ -0.69
SNAP23-222	ENST00000626061	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		10.73	□□□□□ -0.69
SNAP23-222	ENST00000626061	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	10.72	□□□□□ -0.69
SNAP23-222	ENST00000626061	PROM2	Q8N271	834 aa		10.71	□□□□□ -0.69
SNAP23-222	ENST00000626061	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		10.71	□□□□□ -0.69
SNAP23-222	ENST00000626061	ABCA3	Q99758	1704 aa		10.71	□□□□□ -0.69
SNAP23-222	ENST00000626061	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		10.71	□□□□□ -0.69
SNAP23-222	ENST00000626061	HABP4	Q5JVS0	413 aa	Known RBP	10.7	□□□□□ -0.7
SNAP23-222	ENST00000626061	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		10.69	□□□□□ -0.7
SNAP23-222	ENST00000626061	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		10.68	□□□□□ -0.7
SNAP23-222	ENST00000626061	TXNRD1	Q16881	649 aa		10.68	□□□□□ -0.7
SNAP23-222	ENST00000626061	COL14A1	Q05707	1796 aa	Known RBP	10.67	□□□□□ -0.7
SNAP23-222	ENST00000626061	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		10.67	□□□□□ -0.7
SNAP23-222	ENST00000626061	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	10.67	□□□□□ -0.7
SNAP23-222	ENST00000626061	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	10.66	□□□□□ -0.7
SNAP23-222	ENST00000626061	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		10.66	□□□□□ -0.7
SNAP23-222	ENST00000626061	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		10.66	□□□□□ -0.7
SNAP23-222	ENST00000626061	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		10.66	□□□□□ -0.7
SNAP23-222	ENST00000626061	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		10.65	□□□□□ -0.7
SNAP23-222	ENST00000626061	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		10.65	□□□□□ -0.7
SNAP23-222	ENST00000626061	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		10.65	□□□□□ -0.7
SNAP23-222	ENST00000626061	TECPR2	O15040	1411 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SNAP23-222	ENST00000626061	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SNAP23-222	ENST00000626061	USP35	Q9P2H5	1018 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SNAP23-222	ENST00000626061	KIF15	Q9NS87	1388 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SNAP23-222	ENST00000626061	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SNAP23-222	ENST00000626061	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SNAP23-222	ENST00000626061	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SNAP23-222	ENST00000626061	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SNAP23-222	ENST00000626061	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SNAP23-222	ENST00000626061	TSPY4	P0CV99	314 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SNAP23-222	ENST00000626061	TSPY10	P0CW01	314 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SNAP23-222	ENST00000626061	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SNAP23-222	ENST00000626061	WBP1L	Q9NX94	342 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SNAP23-222	ENST00000626061	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SNAP23-222	ENST00000626061	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SNAP23-222	ENST00000626061	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	10.6	□□□□□ -0.71
SNAP23-222	ENST00000626061	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SNAP23-222	ENST00000626061	ARHGEF10	O15013	1369 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SNAP23-222	ENST00000626061	MET	P08581	1390 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SNAP23-222	ENST00000626061	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SNAP23-222	ENST00000626061	KANK1	Q14678	1352 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SNAP23-222	ENST00000626061	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		10.58	□□□□□ -0.71
SNAP23-222	ENST00000626061	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	10.58	□□□□□ -0.72
SNAP23-222	ENST00000626061	STRN4	Q9NRL3	753 aa		10.58	□□□□□ -0.72
SNAP23-222	ENST00000626061	SBF2	Q86WG5	1849 aa		10.58	□□□□□ -0.72
SNAP23-222	ENST00000626061	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		10.57	□□□□□ -0.72
SNAP23-222	ENST00000626061	CREBZF	Q9NS37	354 aa		10.57	□□□□□ -0.72
SNAP23-222	ENST00000626061	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		10.57	□□□□□ -0.72
SNAP23-222	ENST00000626061	PEAK1	Q9H792	1746 aa		10.56	□□□□□ -0.72
SNAP23-222	ENST00000626061	CNTNAP1	P78357	1384 aa		10.56	□□□□□ -0.72
SNAP23-222	ENST00000626061	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		10.56	□□□□□ -0.72
SNAP23-222	ENST00000626061	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		10.56	□□□□□ -0.72
SNAP23-222	ENST00000626061	SOX10	P56693	466 aa		10.56	□□□□□ -0.72
SNAP23-222	ENST00000626061	PSME1	Q06323	249 aa		10.56	□□□□□ -0.72
SNAP23-222	ENST00000626061	ZNF827	Q17R98	1081 aa		10.56	□□□□□ -0.72
SNAP23-222	ENST00000626061	RRAGC	Q9HB90	399 aa		10.56	□□□□□ -0.72
SNAP23-222	ENST00000626061	PAPPA	Q13219	1627 aa		10.55	□□□□□ -0.72
SNAP23-222	ENST00000626061	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		10.55	□□□□□ -0.72
SNAP23-222	ENST00000626061	NBPF15	Q8N660	670 aa		10.55	□□□□□ -0.72
SNAP23-222	ENST00000626061	CACNA1A	O00555	2505 aa		10.55	□□□□□ -0.72
SNAP23-222	ENST00000626061	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		10.55	□□□□□ -0.72
SNAP23-222	ENST00000626061	KIF1A	Q12756	1690 aa		10.54	□□□□□ -0.72
SNAP23-222	ENST00000626061	MNX1	P50219	401 aa	Predicted RBP	10.54	□□□□□ -0.72

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.3 ms