RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590211.5

CAPNS1-210, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-210ENST00000590211 NBPF3Q9H094 633 aa6.66□□□□□ -1.34
CAPNS1-210ENST00000590211 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
CAPNS1-210ENST00000590211 FBXO45P0C2W1 286 aa6.65□□□□□ -1.34
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC4A3P48751 1232 aa6.65□□□□□ -1.34
CAPNS1-210ENST00000590211 NR1H3Q13133 447 aa6.65□□□□□ -1.34
CAPNS1-210ENST00000590211 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
CAPNS1-210ENST00000590211 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CAPNS1-210ENST00000590211 PIK3CDO00329 1044 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-210ENST00000590211 ATP9BO43861 1147 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-210ENST00000590211 Q3C1V9 767 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-210ENST00000590211 UNC13AQ9UPW8 1703 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-210ENST00000590211 RNF40O75150 1001 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-210ENST00000590211 APLP1P51693 650 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-210ENST00000590211 MARVELD3Q96A59 401 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-210ENST00000590211 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-210ENST00000590211 OCSTAMPQ9BR26 566 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-210ENST00000590211 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-210ENST00000590211 SCUBE3Q8IX30 993 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-210ENST00000590211 LRCH3Q96II8 777 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-210ENST00000590211 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-210ENST00000590211 FKBPLQ9UIM3 349 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-210ENST00000590211 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM205CA6NFA0 338 aa6.61□□□□□ -1.35
CAPNS1-210ENST00000590211 ZBBXA8MT70 800 aa6.61□□□□□ -1.35
CAPNS1-210ENST00000590211 EMP3P54852 163 aa6.61□□□□□ -1.35
CAPNS1-210ENST00000590211 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
CAPNS1-210ENST00000590211 ADGRD1Q6QNK2 874 aa6.61□□□□□ -1.35
CAPNS1-210ENST00000590211 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM174AQ8TBP5 190 aa6.61□□□□□ -1.35
CAPNS1-210ENST00000590211 MAP10Q9P2G4 905 aa6.61□□□□□ -1.35
CAPNS1-210ENST00000590211 PTPRNQ16849 979 aa6.6□□□□□ -1.35
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM164Q5U3C3 297 aa6.6□□□□□ -1.35
CAPNS1-210ENST00000590211 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa6.6□□□□□ -1.35
CAPNS1-210ENST00000590211 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa6.6□□□□□ -1.35
CAPNS1-210ENST00000590211 PNMA1Q8ND90 353 aa6.6□□□□□ -1.35
CAPNS1-210ENST00000590211 HS3ST6Q96QI5 342 aa6.6□□□□□ -1.35
CAPNS1-210ENST00000590211 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-210ENST00000590211 SOWAHBA6NEL2 793 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-210ENST00000590211 UNCXA6NJT0 531 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-210ENST00000590211 JUNDP17535 347 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-210ENST00000590211 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-210ENST00000590211 TXNDC2Q86VQ3 553 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-210ENST00000590211 PHTF2Q8N3S3 785 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-210ENST00000590211 STK32AQ8WU08 396 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-210ENST00000590211 SLAIN2Q9P270 581 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-210ENST00000590211 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-210ENST00000590211 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-210ENST00000590211 PRR14Q9BWN1 585 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-210ENST00000590211 CHIC2Q9UKJ5 165 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-210ENST00000590211 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-210ENST00000590211 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
CAPNS1-210ENST00000590211 USP17L3A6NCW0 530 aa6.57□□□□□ -1.36
CAPNS1-210ENST00000590211 USP17L4A6NCW7 530 aa6.57□□□□□ -1.36
CAPNS1-210ENST00000590211 DXOO77932 396 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
CAPNS1-210ENST00000590211 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
CAPNS1-210ENST00000590211 BCAMP50895 628 aa6.57□□□□□ -1.36
CAPNS1-210ENST00000590211 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
CAPNS1-210ENST00000590211 USP17L2Q6R6M4 530 aa6.57□□□□□ -1.36
CAPNS1-210ENST00000590211 USP17L1Q7RTZ2 530 aa6.57□□□□□ -1.36
CAPNS1-210ENST00000590211 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
CAPNS1-210ENST00000590211 HPS5Q9UPZ3 1129 aa6.57□□□□□ -1.36
CAPNS1-210ENST00000590211 USP17L5A8MUK1 530 aa6.56□□□□□ -1.36
CAPNS1-210ENST00000590211 MMP16P51512 607 aa6.56□□□□□ -1.36
CAPNS1-210ENST00000590211 PPP4CP60510 307 aa6.56□□□□□ -1.36
CAPNS1-210ENST00000590211 MSS51Q4VC12 460 aa6.56□□□□□ -1.36
CAPNS1-210ENST00000590211 EVA1BQ9NVM1 165 aa6.56□□□□□ -1.36
CAPNS1-210ENST00000590211 MYT1LQ9UL68 1186 aa6.56□□□□□ -1.36
CAPNS1-210ENST00000590211 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM69CQ0P6D2 419 aa6.55□□□□□ -1.36
CAPNS1-210ENST00000590211 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
CAPNS1-210ENST00000590211 LHX8Q68G74 356 aa6.55□□□□□ -1.36
CAPNS1-210ENST00000590211 PDXDC2PQ6P474 469 aa6.55□□□□□ -1.36
CAPNS1-210ENST00000590211 CEP126Q9P2H0 1117 aa6.55□□□□□ -1.36
CAPNS1-210ENST00000590211 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
CAPNS1-210ENST00000590211 GPSM3Q9Y4H4 160 aa6.55□□□□□ -1.36
CAPNS1-210ENST00000590211 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa6.55□□□□□ -1.36
CAPNS1-210ENST00000590211 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM196BA6NMK8 535 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-210ENST00000590211 NR1I2O75469 434 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-210ENST00000590211 CCNYL3P0C7X3 344 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-210ENST00000590211 SKIP12755 728 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-210ENST00000590211 SSFA2P28290 1259 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-210ENST00000590211 KCNH2Q12809 1159 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-210ENST00000590211 ANKK1Q8NFD2 765 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-210ENST00000590211 PRDM9Q9NQV7 894 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-210ENST00000590211 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
CAPNS1-210ENST00000590211 PTK7Q13308 1070 aa6.53□□□□□ -1.36
CAPNS1-210ENST00000590211 TRAF7Q6Q0C0 670 aa6.53□□□□□ -1.36
CAPNS1-210ENST00000590211 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
CAPNS1-210ENST00000590211 DEPDC4Q8N2C3 294 aa6.53□□□□□ -1.36
CAPNS1-210ENST00000590211 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP6.53□□□□□ -1.36
CAPNS1-210ENST00000590211 IGSF5Q9NSI5 407 aa6.53□□□□□ -1.36
CAPNS1-210ENST00000590211 MROH2BQ7Z745 1585 aa6.52□□□□□ -1.36
CAPNS1-210ENST00000590211 USP17L15C9J2P7 530 aa6.52□□□□□ -1.37
CAPNS1-210ENST00000590211 USP17L10C9JJH3 530 aa6.52□□□□□ -1.37
CAPNS1-210ENST00000590211 USP17L13C9JLJ4 530 aa6.52□□□□□ -1.37
CAPNS1-210ENST00000590211 USP17L12C9JPN9 530 aa6.52□□□□□ -1.37
CAPNS1-210ENST00000590211 USP17L11C9JVI0 530 aa6.52□□□□□ -1.37
CAPNS1-210ENST00000590211 USP17L21D6R901 530 aa6.52□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 320.3 ms