RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492730.1

C4BPB-208, Transcript of complement component 4 binding protein beta, human

TSL 4

Gene C4BPB, Length 564 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
C4BPB-208	ENST00000492730	CLTCL1	P53675	1640 aa		8.05	□□□□□ -1.12
C4BPB-208	ENST00000492730	KLHL34	Q8N239	644 aa		8.05	□□□□□ -1.12
C4BPB-208	ENST00000492730	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		8.05	□□□□□ -1.12
C4BPB-208	ENST00000492730	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	8.05	□□□□□ -1.12
C4BPB-208	ENST00000492730	TRAF7	Q6Q0C0	670 aa		8.04	□□□□□ -1.12
C4BPB-208	ENST00000492730	NLRP1	Q9C000	1473 aa		8.04	□□□□□ -1.12
C4BPB-208	ENST00000492730	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		8.04	□□□□□ -1.12
C4BPB-208	ENST00000492730	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		8.03	□□□□□ -1.12
C4BPB-208	ENST00000492730	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		8.03	□□□□□ -1.12
C4BPB-208	ENST00000492730	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		8.03	□□□□□ -1.12
C4BPB-208	ENST00000492730	TET3	O43151	1660 aa		8.03	□□□□□ -1.12
C4BPB-208	ENST00000492730	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		8.03	□□□□□ -1.12
C4BPB-208	ENST00000492730	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		8.03	□□□□□ -1.12
C4BPB-208	ENST00000492730	ST20-MTHFS	A0A0A6YYL1	179 aa		8.03	□□□□□ -1.12
C4BPB-208	ENST00000492730	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		8.03	□□□□□ -1.12
C4BPB-208	ENST00000492730	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		8.03	□□□□□ -1.12
C4BPB-208	ENST00000492730	LAMC1	P11047	1609 aa		8.03	□□□□□ -1.12
C4BPB-208	ENST00000492730	PTPRT	O14522	1441 aa		8.03	□□□□□ -1.12
C4BPB-208	ENST00000492730	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		8.02	□□□□□ -1.13
C4BPB-208	ENST00000492730	GSE1	Q14687	1217 aa		8.02	□□□□□ -1.13
C4BPB-208	ENST00000492730	LHX6	Q9UPM6	363 aa		8.02	□□□□□ -1.13
C4BPB-208	ENST00000492730	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		8.02	□□□□□ -1.13
C4BPB-208	ENST00000492730	LAPTM4A	Q15012	233 aa		8.01	□□□□□ -1.13
C4BPB-208	ENST00000492730	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	8.01	□□□□□ -1.13
C4BPB-208	ENST00000492730	TRPM2	O94759	1503 aa		8.01	□□□□□ -1.13
C4BPB-208	ENST00000492730	SYNM	O15061	1565 aa		8.01	□□□□□ -1.13
C4BPB-208	ENST00000492730	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	8.01	□□□□□ -1.13
C4BPB-208	ENST00000492730	IQGAP1	P46940	1657 aa		8	□□□□□ -1.13
C4BPB-208	ENST00000492730	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	8	□□□□□ -1.13
C4BPB-208	ENST00000492730	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		8	□□□□□ -1.13
C4BPB-208	ENST00000492730	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	7.99	□□□□□ -1.13
C4BPB-208	ENST00000492730	NUDT7	P0C024	238 aa		7.99	□□□□□ -1.13
C4BPB-208	ENST00000492730	IFNLR1	Q8IU57	520 aa	Predicted RBP	7.99	□□□□□ -1.13
C4BPB-208	ENST00000492730	TESK2	Q96S53	571 aa		7.99	□□□□□ -1.13
C4BPB-208	ENST00000492730	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		7.99	□□□□□ -1.13
C4BPB-208	ENST00000492730	PIK3C2B	O00750	1634 aa		7.99	□□□□□ -1.13
C4BPB-208	ENST00000492730	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		7.98	□□□□□ -1.13
C4BPB-208	ENST00000492730	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		7.98	□□□□□ -1.13
C4BPB-208	ENST00000492730	PTPN5	P54829	565 aa		7.98	□□□□□ -1.13
C4BPB-208	ENST00000492730	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	7.98	□□□□□ -1.13
C4BPB-208	ENST00000492730	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		7.98	□□□□□ -1.13
C4BPB-208	ENST00000492730	IFT172	Q9UG01	1749 aa		7.98	□□□□□ -1.13
C4BPB-208	ENST00000492730	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	7.97	□□□□□ -1.13
C4BPB-208	ENST00000492730	MRS2	Q9HD23	443 aa		7.97	□□□□□ -1.13
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	7.97	□□□□□ -1.13
C4BPB-208	ENST00000492730	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	7.96	□□□□□ -1.13
C4BPB-208	ENST00000492730	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		7.96	□□□□□ -1.14
C4BPB-208	ENST00000492730	SPOCK2	Q92563	424 aa		7.96	□□□□□ -1.14
C4BPB-208	ENST00000492730	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	7.96	□□□□□ -1.14
C4BPB-208	ENST00000492730	TBX22	Q9Y458	520 aa		7.96	□□□□□ -1.14
C4BPB-208	ENST00000492730	STRC	Q7RTU9	1775 aa		7.96	□□□□□ -1.14
C4BPB-208	ENST00000492730	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		7.96	□□□□□ -1.14
C4BPB-208	ENST00000492730	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		7.95	□□□□□ -1.14
C4BPB-208	ENST00000492730	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	7.95	□□□□□ -1.14
C4BPB-208	ENST00000492730	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		7.95	□□□□□ -1.14
C4BPB-208	ENST00000492730	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	7.95	□□□□□ -1.14
C4BPB-208	ENST00000492730	DMRTA1	Q5VZB9	504 aa		7.95	□□□□□ -1.14
C4BPB-208	ENST00000492730	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		7.95	□□□□□ -1.14
C4BPB-208	ENST00000492730	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		7.95	□□□□□ -1.14
C4BPB-208	ENST00000492730	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		7.94	□□□□□ -1.14
C4BPB-208	ENST00000492730	SLIT1	O75093	1534 aa		7.94	□□□□□ -1.14
C4BPB-208	ENST00000492730	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		7.94	□□□□□ -1.14
C4BPB-208	ENST00000492730	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		7.94	□□□□□ -1.14
C4BPB-208	ENST00000492730	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		7.94	□□□□□ -1.14
C4BPB-208	ENST00000492730	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		7.94	□□□□□ -1.14
C4BPB-208	ENST00000492730	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	7.94	□□□□□ -1.14
C4BPB-208	ENST00000492730	CERK	Q8TCT0	537 aa		7.94	□□□□□ -1.14
C4BPB-208	ENST00000492730	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		7.94	□□□□□ -1.14
C4BPB-208	ENST00000492730	KIF1B	O60333	1816 aa		7.94	□□□□□ -1.14
C4BPB-208	ENST00000492730	ZFYVE9	O95405	1425 aa		7.94	□□□□□ -1.14
C4BPB-208	ENST00000492730	ADGRB3	O60242	1522 aa		7.93	□□□□□ -1.14
C4BPB-208	ENST00000492730	MYOM1	P52179	1685 aa		7.93	□□□□□ -1.14
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	7.93	□□□□□ -1.14
C4BPB-208	ENST00000492730	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		7.93	□□□□□ -1.14
C4BPB-208	ENST00000492730	KCNA6	P17658	529 aa		7.93	□□□□□ -1.14
C4BPB-208	ENST00000492730	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	7.93	□□□□□ -1.14
C4BPB-208	ENST00000492730	STAC3	Q96MF2	364 aa		7.93	□□□□□ -1.14
C4BPB-208	ENST00000492730	STK26	Q9P289	416 aa		7.93	□□□□□ -1.14
C4BPB-208	ENST00000492730	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		7.93	□□□□□ -1.14
C4BPB-208	ENST00000492730	MED14	O60244	1454 aa		7.93	□□□□□ -1.14
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF775	Q96BV0	537 aa	Predicted RBP	7.92	□□□□□ -1.14
C4BPB-208	ENST00000492730	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	7.92	□□□□□ -1.14
C4BPB-208	ENST00000492730	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	7.92	□□□□□ -1.14
C4BPB-208	ENST00000492730	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		7.92	□□□□□ -1.14
C4BPB-208	ENST00000492730	PPL	O60437	1756 aa		7.92	□□□□□ -1.14
C4BPB-208	ENST00000492730	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	7.91	□□□□□ -1.14
C4BPB-208	ENST00000492730	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	7.91	□□□□□ -1.14
C4BPB-208	ENST00000492730	EFCAB3	Q8N7B9	438 aa		7.91	□□□□□ -1.14
C4BPB-208	ENST00000492730	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		7.91	□□□□□ -1.14
C4BPB-208	ENST00000492730	MYOM2	P54296	1465 aa		7.91	□□□□□ -1.14
C4BPB-208	ENST00000492730	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		7.91	□□□□□ -1.14
C4BPB-208	ENST00000492730	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		7.9	□□□□□ -1.14
C4BPB-208	ENST00000492730	MET	P08581	1390 aa		7.9	□□□□□ -1.14
C4BPB-208	ENST00000492730	C14orf37	Q86TY3	774 aa		7.9	□□□□□ -1.14
C4BPB-208	ENST00000492730	TSHZ2	Q9NRE2	1034 aa		7.9	□□□□□ -1.14
C4BPB-208	ENST00000492730	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	7.89	□□□□□ -1.15
C4BPB-208	ENST00000492730	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		7.89	□□□□□ -1.15
C4BPB-208	ENST00000492730	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	7.89	□□□□□ -1.15
C4BPB-208	ENST00000492730	PSEN2	P49810	448 aa		7.89	□□□□□ -1.15
C4BPB-208	ENST00000492730	PANK3	Q9H999	370 aa		7.89	□□□□□ -1.15

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