RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482597.5

PTPRVP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type V, pseudogene, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRVP, Length 3,999 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRVP-201ENST00000482597 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
PTPRVP-201ENST00000482597 AEBP1Q8IUX7 1158 aa12.12□□□□□ -0.47
PTPRVP-201ENST00000482597 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
PTPRVP-201ENST00000482597 A0A1W2PP64 1363 aa12.12□□□□□ -0.47
PTPRVP-201ENST00000482597 LNPKQ9C0E8 428 aa12.11□□□□□ -0.47
PTPRVP-201ENST00000482597 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
PTPRVP-201ENST00000482597 POLKQ9UBT6 870 aa12.11□□□□□ -0.47
PTPRVP-201ENST00000482597 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
PTPRVP-201ENST00000482597 MLH3Q9UHC1 1453 aa12.11□□□□□ -0.47
PTPRVP-201ENST00000482597 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa12.11□□□□□ -0.47
PTPRVP-201ENST00000482597 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa12.11□□□□□ -0.47
PTPRVP-201ENST00000482597 TAOK2Q9UL54 1235 aa12.11□□□□□ -0.47
PTPRVP-201ENST00000482597 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
PTPRVP-201ENST00000482597 NPHP1O15259 732 aa12.1□□□□□ -0.47
PTPRVP-201ENST00000482597 BECN1Q14457 450 aa12.1□□□□□ -0.47
PTPRVP-201ENST00000482597 DDRGK1Q96HY6 314 aa12.1□□□□□ -0.47
PTPRVP-201ENST00000482597 NFE2L2Q16236 605 aa12.1□□□□□ -0.47
PTPRVP-201ENST00000482597 WDR63Q8IWG1 891 aa12.1□□□□□ -0.47
PTPRVP-201ENST00000482597 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa12.1□□□□□ -0.47
PTPRVP-201ENST00000482597 DDX19BQ9UMR2 479 aa12.1□□□□□ -0.47
PTPRVP-201ENST00000482597 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa12.09□□□□□ -0.47
PTPRVP-201ENST00000482597 SLC4A2P04920 1241 aa12.09□□□□□ -0.47
PTPRVP-201ENST00000482597 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
PTPRVP-201ENST00000482597 SSH1Q8WYL5 1049 aa12.09□□□□□ -0.47
PTPRVP-201ENST00000482597 DMRT2Q9Y5R5 561 aa12.09□□□□□ -0.47
PTPRVP-201ENST00000482597 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
PTPRVP-201ENST00000482597 PIP4K2BP78356 416 aa12.08□□□□□ -0.48
PTPRVP-201ENST00000482597 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.48
PTPRVP-201ENST00000482597 CHRNA2Q15822 529 aa12.08□□□□□ -0.48
PTPRVP-201ENST00000482597 CABLES1Q8TDN4 633 aa12.08□□□□□ -0.48
PTPRVP-201ENST00000482597 PHACTR3Q96KR7 559 aa12.08□□□□□ -0.48
PTPRVP-201ENST00000482597 PRDM11Q9NQV5 511 aa12.08□□□□□ -0.48
PTPRVP-201ENST00000482597 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP12.07□□□□□ -0.48
PTPRVP-201ENST00000482597 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP12.07□□□□□ -0.48
PTPRVP-201ENST00000482597 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP12.07□□□□□ -0.48
PTPRVP-201ENST00000482597 TTC5Q8N0Z6 440 aa12.07□□□□□ -0.48
PTPRVP-201ENST00000482597 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa12.07□□□□□ -0.48
PTPRVP-201ENST00000482597 GAS2L2Q8NHY3 880 aa12.07□□□□□ -0.48
PTPRVP-201ENST00000482597 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP12.07□□□□□ -0.48
PTPRVP-201ENST00000482597 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa12.07□□□□□ -0.48
PTPRVP-201ENST00000482597 RARSP54136 660 aaKnown RBP12.07□□□□□ -0.48
PTPRVP-201ENST00000482597 CASC1Q6TDU7 716 aa12.07□□□□□ -0.48
PTPRVP-201ENST00000482597 METP08581 1390 aa12.07□□□□□ -0.48
PTPRVP-201ENST00000482597 KIF16BQ96L93 1317 aa12.07□□□□□ -0.48
PTPRVP-201ENST00000482597 ORAI2Q96SN7 254 aa12.06□□□□□ -0.48
PTPRVP-201ENST00000482597 TNNQ9UQP3 1299 aa12.06□□□□□ -0.48
PTPRVP-201ENST00000482597 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa12.06□□□□□ -0.48
PTPRVP-201ENST00000482597 KRT28Q7Z3Y7 464 aa12.06□□□□□ -0.48
PTPRVP-201ENST00000482597 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
PTPRVP-201ENST00000482597 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
PTPRVP-201ENST00000482597 FANCIQ9NVI1 1328 aa12.06□□□□□ -0.48
PTPRVP-201ENST00000482597 PTPRTO14522 1441 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRVP-201ENST00000482597 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRVP-201ENST00000482597 TBX22Q9Y458 520 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRVP-201ENST00000482597 MAGI2Q86UL8 1455 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRVP-201ENST00000482597 KCNJ4P48050 445 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRVP-201ENST00000482597 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRVP-201ENST00000482597 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP12.04□□□□□ -0.48
PTPRVP-201ENST00000482597 TMEM2Q9UHN6 1383 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRVP-201ENST00000482597 HMMRO75330 724 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRVP-201ENST00000482597 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP12.04□□□□□ -0.48
PTPRVP-201ENST00000482597 TMEM57Q8N5G2 664 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRVP-201ENST00000482597 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRVP-201ENST00000482597 FOXD4L1Q9NU39 408 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRVP-201ENST00000482597 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP12.03□□□□□ -0.48
PTPRVP-201ENST00000482597 PDE3AQ14432 1141 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRVP-201ENST00000482597 KRT24Q2M2I5 525 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRVP-201ENST00000482597 FAM161AQ3B820 660 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRVP-201ENST00000482597 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP12.03□□□□□ -0.48
PTPRVP-201ENST00000482597 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP12.03□□□□□ -0.48
PTPRVP-201ENST00000482597 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP12.02□□□□□ -0.48
PTPRVP-201ENST00000482597 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP12.02□□□□□ -0.49
PTPRVP-201ENST00000482597 BCORL1Q5H9F3 1711 aa12.02□□□□□ -0.49
PTPRVP-201ENST00000482597 F6X3S4 739 aa12.02□□□□□ -0.49
PTPRVP-201ENST00000482597 RILPL2Q969X0 211 aa12.02□□□□□ -0.49
PTPRVP-201ENST00000482597 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa12.02□□□□□ -0.49
PTPRVP-201ENST00000482597 SHROOM2Q13796 1616 aa12.01□□□□□ -0.49
PTPRVP-201ENST00000482597 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
PTPRVP-201ENST00000482597 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
PTPRVP-201ENST00000482597 HECW2Q9P2P5 1572 aa12.01□□□□□ -0.49
PTPRVP-201ENST00000482597 TATP17735 454 aaPredicted RBP12.01□□□□□ -0.49
PTPRVP-201ENST00000482597 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP12.01□□□□□ -0.49
PTPRVP-201ENST00000482597 TRPM2O94759 1503 aa12□□□□□ -0.49
PTPRVP-201ENST00000482597 MAP3K19Q56UN5 1328 aa12□□□□□ -0.49
PTPRVP-201ENST00000482597 GNAT3A8MTJ3 354 aa12□□□□□ -0.49
PTPRVP-201ENST00000482597 MYL6BP14649 208 aa12□□□□□ -0.49
PTPRVP-201ENST00000482597 MVPQ14764 893 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
PTPRVP-201ENST00000482597 KDM5DQ9BY66 1539 aa12□□□□□ -0.49
PTPRVP-201ENST00000482597 ADAMTS2O95450 1211 aa12□□□□□ -0.49
PTPRVP-201ENST00000482597 ANXA1P04083 346 aa12□□□□□ -0.49
PTPRVP-201ENST00000482597 KCNH5Q8NCM2 988 aa12□□□□□ -0.49
PTPRVP-201ENST00000482597 MBIPQ9NS73 344 aa12□□□□□ -0.49
PTPRVP-201ENST00000482597 ABCC3O15438 1527 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRVP-201ENST00000482597 TRIM27P14373 513 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRVP-201ENST00000482597 RIC3Q7Z5B4 369 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRVP-201ENST00000482597 TSPYL6Q8N831 410 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRVP-201ENST00000482597 NCLP19338 710 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
PTPRVP-201ENST00000482597 CCDC30Q5VVM6 783 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRVP-201ENST00000482597 NSD2O96028 1365 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRVP-201ENST00000482597 KDM5CP41229 1560 aa11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 300.3 ms