RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273482.10

TRPC1-201, Transcript of transient receptor potential cation channel subfamily C member 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPC1, Length 4,324 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1-201ENST00000273482 ESPNB1AK53 854 aa20.99■□□□□ 0.95
TRPC1-201ENST00000273482 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
TRPC1-201ENST00000273482 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP20.98■□□□□ 0.95
TRPC1-201ENST00000273482 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP20.98■□□□□ 0.95
TRPC1-201ENST00000273482 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP20.97■□□□□ 0.95
TRPC1-201ENST00000273482 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa20.97■□□□□ 0.95
TRPC1-201ENST00000273482 TAOK2Q9UL54 1235 aa20.97■□□□□ 0.95
TRPC1-201ENST00000273482 HMMRO75330 724 aa20.97■□□□□ 0.95
TRPC1-201ENST00000273482 MCTP1Q6DN14 999 aa20.97■□□□□ 0.95
TRPC1-201ENST00000273482 CHMP4AQ9BY43 222 aa20.97■□□□□ 0.95
TRPC1-201ENST00000273482 TEX14Q8IWB6 1497 aa20.96■□□□□ 0.95
TRPC1-201ENST00000273482 TNRQ92752 1358 aa20.96■□□□□ 0.95
TRPC1-201ENST00000273482 WWC1Q8IX03 1113 aa20.96■□□□□ 0.95
TRPC1-201ENST00000273482 ATP7AQ04656 1500 aa20.96■□□□□ 0.95
TRPC1-201ENST00000273482 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa20.96■□□□□ 0.95
TRPC1-201ENST00000273482 RNF123Q5XPI4 1314 aa20.95■□□□□ 0.95
TRPC1-201ENST00000273482 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
TRPC1-201ENST00000273482 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
TRPC1-201ENST00000273482 FOXO3O43524 673 aa20.95■□□□□ 0.94
TRPC1-201ENST00000273482 KIF16BQ96L93 1317 aa20.94■□□□□ 0.94
TRPC1-201ENST00000273482 NUCB2P80303 420 aa20.94■□□□□ 0.94
TRPC1-201ENST00000273482 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa20.94■□□□□ 0.94
TRPC1-201ENST00000273482 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
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TRPC1-201ENST00000273482 TBC1D2Q9BYX2 928 aa20.93■□□□□ 0.94
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TRPC1-201ENST00000273482 TMPOP42166 694 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
TRPC1-201ENST00000273482 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
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TRPC1-201ENST00000273482 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
TRPC1-201ENST00000273482 DCTN1Q14203 1278 aa20.9■□□□□ 0.94
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TRPC1-201ENST00000273482 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa20.9■□□□□ 0.94
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TRPC1-201ENST00000273482 REC8O95072 547 aa20.88■□□□□ 0.93
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TRPC1-201ENST00000273482 ZMYM3Q14202 1370 aa20.88■□□□□ 0.93
TRPC1-201ENST00000273482 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa20.88■□□□□ 0.93
TRPC1-201ENST00000273482 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa20.87■□□□□ 0.93
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TRPC1-201ENST00000273482 CCDC173Q0VFZ6 552 aa20.87■□□□□ 0.93
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TRPC1-201ENST00000273482 STRN4Q9NRL3 753 aa20.85■□□□□ 0.93
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TRPC1-201ENST00000273482 CDC45O75419 566 aa20.85■□□□□ 0.93
TRPC1-201ENST00000273482 ZNF428Q96B54 188 aa20.85■□□□□ 0.93
TRPC1-201ENST00000273482 C1orf115Q9H7X2 142 aa20.85■□□□□ 0.93
TRPC1-201ENST00000273482 ZRANB1Q9UGI0 708 aa20.85■□□□□ 0.93
TRPC1-201ENST00000273482 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
TRPC1-201ENST00000273482 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa20.84■□□□□ 0.93
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TRPC1-201ENST00000273482 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
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TRPC1-201ENST00000273482 MAST1Q9Y2H9 1570 aa20.81■□□□□ 0.92
TRPC1-201ENST00000273482 TBC1D32Q96NH3 1257 aa20.8■□□□□ 0.92
TRPC1-201ENST00000273482 ARHGEF5Q12774 1597 aa20.8■□□□□ 0.92
TRPC1-201ENST00000273482 SLC4A2P04920 1241 aa20.8■□□□□ 0.92
TRPC1-201ENST00000273482 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa20.8■□□□□ 0.92
TRPC1-201ENST00000273482 PARD3Q8TEW0 1356 aa20.8■□□□□ 0.92
TRPC1-201ENST00000273482 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
TRPC1-201ENST00000273482 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
TRPC1-201ENST00000273482 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP20.79■□□□□ 0.92
TRPC1-201ENST00000273482 HDAC5Q9UQL6 1122 aa20.79■□□□□ 0.92
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