RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273482.10

TRPC1-201, Transcript of transient receptor potential cation channel subfamily C member 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPC1, Length 4,324 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1-201ENST00000273482 ESPNB1AK53 854 aa20.99■□□□□ 0.95
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TRPC1-201ENST00000273482 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP20.98■□□□□ 0.95
TRPC1-201ENST00000273482 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP20.97■□□□□ 0.95
TRPC1-201ENST00000273482 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa20.97■□□□□ 0.95
TRPC1-201ENST00000273482 TAOK2Q9UL54 1235 aa20.97■□□□□ 0.95
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TRPC1-201ENST00000273482 MCTP1Q6DN14 999 aa20.97■□□□□ 0.95
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TRPC1-201ENST00000273482 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa20.96■□□□□ 0.95
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TRPC1-201ENST00000273482 ZNF428Q96B54 188 aa20.85■□□□□ 0.93
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TRPC1-201ENST00000273482 TBC1D32Q96NH3 1257 aa20.8■□□□□ 0.92
TRPC1-201ENST00000273482 ARHGEF5Q12774 1597 aa20.8■□□□□ 0.92
TRPC1-201ENST00000273482 SLC4A2P04920 1241 aa20.8■□□□□ 0.92
TRPC1-201ENST00000273482 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa20.8■□□□□ 0.92
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TRPC1-201ENST00000273482 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP20.79■□□□□ 0.92
TRPC1-201ENST00000273482 HDAC5Q9UQL6 1122 aa20.79■□□□□ 0.92
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