RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272542.7

SLC20A1-201, Transcript of solute carrier family 20 member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC20A1, Length 3,381 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC20A1-201ENST00000272542 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa20.46■□□□□ 0.87
SLC20A1-201ENST00000272542 TRIM35Q9UPQ4 493 aa20.46■□□□□ 0.87
SLC20A1-201ENST00000272542 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
SLC20A1-201ENST00000272542 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
SLC20A1-201ENST00000272542 AGLP35573 1532 aa20.45■□□□□ 0.86
SLC20A1-201ENST00000272542 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
SLC20A1-201ENST00000272542 BACH2Q9BYV9 841 aa20.45■□□□□ 0.86
SLC20A1-201ENST00000272542 TNRQ92752 1358 aa20.45■□□□□ 0.86
SLC20A1-201ENST00000272542 PHACTR3Q96KR7 559 aa20.45■□□□□ 0.86
SLC20A1-201ENST00000272542 KIF13AQ9H1H9 1805 aa20.44■□□□□ 0.86
SLC20A1-201ENST00000272542 PRKAR2BP31323 418 aa20.44■□□□□ 0.86
SLC20A1-201ENST00000272542 NSD2O96028 1365 aa20.43■□□□□ 0.86
SLC20A1-201ENST00000272542 NBR1Q14596 966 aa20.43■□□□□ 0.86
SLC20A1-201ENST00000272542 WDR63Q8IWG1 891 aa20.43■□□□□ 0.86
SLC20A1-201ENST00000272542 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP20.42■□□□□ 0.86
SLC20A1-201ENST00000272542 PRR36Q9H6K5 1346 aa20.42■□□□□ 0.86
SLC20A1-201ENST00000272542 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa20.42■□□□□ 0.86
SLC20A1-201ENST00000272542 NLRP1Q9C000 1473 aa20.42■□□□□ 0.86
SLC20A1-201ENST00000272542 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa20.42■□□□□ 0.86
SLC20A1-201ENST00000272542 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
SLC20A1-201ENST00000272542 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
SLC20A1-201ENST00000272542 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
SLC20A1-201ENST00000272542 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
SLC20A1-201ENST00000272542 ROBO2Q9HCK4 1378 aa20.41■□□□□ 0.86
SLC20A1-201ENST00000272542 CCDC61Q9Y6R9 512 aa20.4■□□□□ 0.86
SLC20A1-201ENST00000272542 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa20.4■□□□□ 0.86
SLC20A1-201ENST00000272542 IQSEC2Q5JU85 1478 aa20.39■□□□□ 0.86
SLC20A1-201ENST00000272542 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
SLC20A1-201ENST00000272542 NINLQ9Y2I6 1382 aa20.39■□□□□ 0.85
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SLC20A1-201ENST00000272542 TMEM2Q9UHN6 1383 aa20.38■□□□□ 0.85
SLC20A1-201ENST00000272542 MYH16Q9H6N6 1097 aa20.38■□□□□ 0.85
SLC20A1-201ENST00000272542 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa20.38■□□□□ 0.85
SLC20A1-201ENST00000272542 SMC4Q9NTJ3 1288 aa20.37■□□□□ 0.85
SLC20A1-201ENST00000272542 HDGFP51858 240 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
SLC20A1-201ENST00000272542 SLC4A3P48751 1232 aa20.36■□□□□ 0.85
SLC20A1-201ENST00000272542 CCDC27Q2M243 656 aa20.36■□□□□ 0.85
SLC20A1-201ENST00000272542 SSH1Q8WYL5 1049 aa20.36■□□□□ 0.85
SLC20A1-201ENST00000272542 DCTN1Q14203 1278 aa20.35■□□□□ 0.85
SLC20A1-201ENST00000272542 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
SLC20A1-201ENST00000272542 FAM83GA6ND36 823 aa20.35■□□□□ 0.85
SLC20A1-201ENST00000272542 PDE3AQ14432 1141 aa20.35■□□□□ 0.85
SLC20A1-201ENST00000272542 COG3Q96JB2 828 aa20.35■□□□□ 0.85
SLC20A1-201ENST00000272542 REREQ9P2R6 1566 aa20.34■□□□□ 0.85
SLC20A1-201ENST00000272542 USP32Q8NFA0 1604 aa20.34■□□□□ 0.85
SLC20A1-201ENST00000272542 RSPH6AQ9H0K4 717 aa20.34■□□□□ 0.85
SLC20A1-201ENST00000272542 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
SLC20A1-201ENST00000272542 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa20.33■□□□□ 0.84
SLC20A1-201ENST00000272542 PLEKHG5O94827 1062 aa20.32■□□□□ 0.84
SLC20A1-201ENST00000272542 MS4A1P11836 297 aa20.32■□□□□ 0.84
SLC20A1-201ENST00000272542 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa20.32■□□□□ 0.84
SLC20A1-201ENST00000272542 AEBP1Q8IUX7 1158 aa20.32■□□□□ 0.84
SLC20A1-201ENST00000272542 ACEP12821 1306 aa20.32■□□□□ 0.84
SLC20A1-201ENST00000272542 NUTM2GQ5VZR2 741 aa20.32■□□□□ 0.84
SLC20A1-201ENST00000272542 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
SLC20A1-201ENST00000272542 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
SLC20A1-201ENST00000272542 CPS1P31327 1500 aa20.3■□□□□ 0.84
SLC20A1-201ENST00000272542 FCHSD2O94868 740 aa20.3■□□□□ 0.84
SLC20A1-201ENST00000272542 IL13P35225 146 aa20.29■□□□□ 0.84
SLC20A1-201ENST00000272542 EID1Q9Y6B2 187 aa20.29■□□□□ 0.84
SLC20A1-201ENST00000272542 PNPLA6Q8IY17 1366 aa20.29■□□□□ 0.84
SLC20A1-201ENST00000272542 TRIM27P14373 513 aa20.29■□□□□ 0.84
SLC20A1-201ENST00000272542 TSPYL6Q8N831 410 aa20.29■□□□□ 0.84
SLC20A1-201ENST00000272542 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa20.29■□□□□ 0.84
SLC20A1-201ENST00000272542 BCL11AQ9H165 835 aa20.29■□□□□ 0.84
SLC20A1-201ENST00000272542 C8orf34Q49A92 452 aa20.28■□□□□ 0.84
SLC20A1-201ENST00000272542 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
SLC20A1-201ENST00000272542 NEFMP07197 916 aa20.28■□□□□ 0.84
SLC20A1-201ENST00000272542 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa20.28■□□□□ 0.84
SLC20A1-201ENST00000272542 ITPRIPQ8IWB1 547 aa20.28■□□□□ 0.84
SLC20A1-201ENST00000272542 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa20.27■□□□□ 0.84
SLC20A1-201ENST00000272542 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.83
SLC20A1-201ENST00000272542 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
SLC20A1-201ENST00000272542 PTPRUQ92729 1446 aa20.25■□□□□ 0.83
SLC20A1-201ENST00000272542 SULT6B1Q6IMI4 303 aa20.25■□□□□ 0.83
SLC20A1-201ENST00000272542 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
SLC20A1-201ENST00000272542 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
SLC20A1-201ENST00000272542 SEC24BO95487 1268 aa20.24■□□□□ 0.83
SLC20A1-201ENST00000272542 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa20.24■□□□□ 0.83
SLC20A1-201ENST00000272542 DLC1Q96QB1 1528 aa20.23■□□□□ 0.83
SLC20A1-201ENST00000272542 ATP7BP35670 1465 aa20.23■□□□□ 0.83
SLC20A1-201ENST00000272542 MVPQ14764 893 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
SLC20A1-201ENST00000272542 NFE2L2Q16236 605 aa20.23■□□□□ 0.83
SLC20A1-201ENST00000272542 KRT24Q2M2I5 525 aa20.23■□□□□ 0.83
SLC20A1-201ENST00000272542 FAM161AQ3B820 660 aa20.23■□□□□ 0.83
SLC20A1-201ENST00000272542 TMEM57Q8N5G2 664 aa20.23■□□□□ 0.83
SLC20A1-201ENST00000272542 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
SLC20A1-201ENST00000272542 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
SLC20A1-201ENST00000272542 LRRC7Q96NW7 1537 aa20.21■□□□□ 0.83
SLC20A1-201ENST00000272542 MED14O60244 1454 aa20.21■□□□□ 0.83
SLC20A1-201ENST00000272542 KCNA6P17658 529 aa20.21■□□□□ 0.83
SLC20A1-201ENST00000272542 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa20.2■□□□□ 0.82
SLC20A1-201ENST00000272542 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
SLC20A1-201ENST00000272542 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa20.2■□□□□ 0.82
SLC20A1-201ENST00000272542 MCM10Q7L590 875 aa20.2■□□□□ 0.82
SLC20A1-201ENST00000272542 MBIPQ9NS73 344 aa20.2■□□□□ 0.82
SLC20A1-201ENST00000272542 MIS18AQ9NYP9 233 aa20.19■□□□□ 0.82
SLC20A1-201ENST00000272542 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
SLC20A1-201ENST00000272542 ADGRB2O60241 1585 aa20.19■□□□□ 0.82
SLC20A1-201ENST00000272542 C14orf37Q86TY3 774 aa20.18■□□□□ 0.82
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