RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000227638.7

PANX1-201, Transcript of pannexin 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PANX1, Length 2,769 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PANX1-201ENST00000227638 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa23.18■■□□□ 1.3
PANX1-201ENST00000227638 HMOX1P09601 288 aa23.18■■□□□ 1.3
PANX1-201ENST00000227638 RIPK4P57078 832 aa23.18■■□□□ 1.3
PANX1-201ENST00000227638 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa23.17■■□□□ 1.3
PANX1-201ENST00000227638 ZRANB1Q9UGI0 708 aa23.17■■□□□ 1.3
PANX1-201ENST00000227638 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
PANX1-201ENST00000227638 PLEKHF1Q96S99 279 aa23.17■■□□□ 1.3
PANX1-201ENST00000227638 MYH16Q9H6N6 1097 aa23.17■■□□□ 1.3
PANX1-201ENST00000227638 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
PANX1-201ENST00000227638 MVPQ14764 893 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
PANX1-201ENST00000227638 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa23.15■■□□□ 1.3
PANX1-201ENST00000227638 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa23.15■■□□□ 1.3
PANX1-201ENST00000227638 CDK19Q9BWU1 502 aa23.14■■□□□ 1.3
PANX1-201ENST00000227638 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa23.14■■□□□ 1.29
PANX1-201ENST00000227638 PREX1Q8TCU6 1659 aa23.13■■□□□ 1.29
PANX1-201ENST00000227638 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
PANX1-201ENST00000227638 TMEM57Q8N5G2 664 aa23.12■■□□□ 1.29
PANX1-201ENST00000227638 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa23.12■■□□□ 1.29
PANX1-201ENST00000227638 C1orf115Q9H7X2 142 aa23.12■■□□□ 1.29
PANX1-201ENST00000227638 NGEFQ8N5V2 710 aa23.11■■□□□ 1.29
PANX1-201ENST00000227638 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa23.11■■□□□ 1.29
PANX1-201ENST00000227638 PHACTR3Q96KR7 559 aa23.11■■□□□ 1.29
PANX1-201ENST00000227638 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa23.1■■□□□ 1.29
PANX1-201ENST00000227638 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.1■■□□□ 1.29
PANX1-201ENST00000227638 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.1■■□□□ 1.29
PANX1-201ENST00000227638 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
PANX1-201ENST00000227638 CCDC27Q2M243 656 aa23.09■■□□□ 1.29
PANX1-201ENST00000227638 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
PANX1-201ENST00000227638 PRKAR2BP31323 418 aa23.08■■□□□ 1.29
PANX1-201ENST00000227638 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
PANX1-201ENST00000227638 TBC1D2Q9BYX2 928 aa23.07■■□□□ 1.28
PANX1-201ENST00000227638 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa23.07■■□□□ 1.28
PANX1-201ENST00000227638 PTPRMP28827 1452 aa23.07■■□□□ 1.28
PANX1-201ENST00000227638 NUTM2FA1L443 756 aa23.06■■□□□ 1.28
PANX1-201ENST00000227638 TSPYL6Q8N831 410 aa23.06■■□□□ 1.28
PANX1-201ENST00000227638 NLRP1Q9C000 1473 aa23.06■■□□□ 1.28
PANX1-201ENST00000227638 ABCC11Q96J66 1382 aa23.05■■□□□ 1.28
PANX1-201ENST00000227638 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa23.05■■□□□ 1.28
PANX1-201ENST00000227638 LNPKQ9C0E8 428 aa23.05■■□□□ 1.28
PANX1-201ENST00000227638 TERF2IPQ9NYB0 399 aa23.05■■□□□ 1.28
PANX1-201ENST00000227638 DIP2BQ9P265 1576 aa23.05■■□□□ 1.28
PANX1-201ENST00000227638 DCTN1Q14203 1278 aa23.03■■□□□ 1.28
PANX1-201ENST00000227638 TBC1D32Q96NH3 1257 aa23.03■■□□□ 1.28
PANX1-201ENST00000227638 NME9Q86XW9 330 aa23.02■■□□□ 1.28
PANX1-201ENST00000227638 ZFYVE9O95405 1425 aa23.02■■□□□ 1.28
PANX1-201ENST00000227638 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
PANX1-201ENST00000227638 FAM83GA6ND36 823 aa23.01■■□□□ 1.27
PANX1-201ENST00000227638 POLKQ9UBT6 870 aa23.01■■□□□ 1.27
PANX1-201ENST00000227638 CD163L1Q9NR16 1453 aa23.01■■□□□ 1.27
PANX1-201ENST00000227638 NINLQ9Y2I6 1382 aa23.01■■□□□ 1.27
PANX1-201ENST00000227638 ALKQ9UM73 1620 aa23■■□□□ 1.27
PANX1-201ENST00000227638 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
PANX1-201ENST00000227638 SOX12O15370 315 aa23■■□□□ 1.27
PANX1-201ENST00000227638 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
PANX1-201ENST00000227638 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
PANX1-201ENST00000227638 TXNDC2Q86VQ3 553 aa22.99■■□□□ 1.27
PANX1-201ENST00000227638 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
PANX1-201ENST00000227638 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.99■■□□□ 1.27
PANX1-201ENST00000227638 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
PANX1-201ENST00000227638 ATAD2Q6PL18 1390 aa22.98■■□□□ 1.27
PANX1-201ENST00000227638 BECN1Q14457 450 aa22.97■■□□□ 1.27
PANX1-201ENST00000227638 USP32Q8NFA0 1604 aa22.96■■□□□ 1.27
PANX1-201ENST00000227638 ANTXR1Q9H6X2 564 aa22.96■■□□□ 1.27
PANX1-201ENST00000227638 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
PANX1-201ENST00000227638 C22orf23Q9BZE7 217 aa22.95■■□□□ 1.26
PANX1-201ENST00000227638 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa22.95■■□□□ 1.26
PANX1-201ENST00000227638 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
PANX1-201ENST00000227638 KRT24Q2M2I5 525 aa22.95■■□□□ 1.26
PANX1-201ENST00000227638 RSPH6AQ9H0K4 717 aa22.95■■□□□ 1.26
PANX1-201ENST00000227638 NSD2O96028 1365 aa22.94■■□□□ 1.26
PANX1-201ENST00000227638 FOXD4L1Q9NU39 408 aa22.94■■□□□ 1.26
PANX1-201ENST00000227638 DDX19BQ9UMR2 479 aa22.94■■□□□ 1.26
PANX1-201ENST00000227638 A2ML1A8K2U0 1454 aa22.94■■□□□ 1.26
PANX1-201ENST00000227638 RIMS2Q9UQ26 1411 aa22.94■■□□□ 1.26
PANX1-201ENST00000227638 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
PANX1-201ENST00000227638 ANKRD45Q5TZF3 282 aa22.9■■□□□ 1.26
PANX1-201ENST00000227638 METP08581 1390 aa22.9■■□□□ 1.26
PANX1-201ENST00000227638 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa22.9■■□□□ 1.26
PANX1-201ENST00000227638 C8orf58Q8NAV2 365 aa22.89■■□□□ 1.26
PANX1-201ENST00000227638 ADGRB2O60241 1585 aa22.89■■□□□ 1.25
PANX1-201ENST00000227638 AEBP1Q8IUX7 1158 aa22.89■■□□□ 1.25
PANX1-201ENST00000227638 MBIPQ9NS73 344 aa22.88■■□□□ 1.25
PANX1-201ENST00000227638 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
PANX1-201ENST00000227638 APBB1O00213 710 aa22.87■■□□□ 1.25
PANX1-201ENST00000227638 VAMP4O75379 141 aa22.87■■□□□ 1.25
PANX1-201ENST00000227638 SMC5Q8IY18 1101 aa22.87■■□□□ 1.25
PANX1-201ENST00000227638 FCHSD2O94868 740 aa22.86■■□□□ 1.25
PANX1-201ENST00000227638 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
PANX1-201ENST00000227638 ZMYM3Q14202 1370 aa22.86■■□□□ 1.25
PANX1-201ENST00000227638 SIRT2Q8IXJ6 389 aa22.85■■□□□ 1.25
PANX1-201ENST00000227638 LRRC7Q96NW7 1537 aa22.85■■□□□ 1.25
PANX1-201ENST00000227638 NFE2L2Q16236 605 aa22.84■■□□□ 1.25
PANX1-201ENST00000227638 CHD1LQ86WJ1 897 aa22.83■■□□□ 1.25
PANX1-201ENST00000227638 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.24
PANX1-201ENST00000227638 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.24
PANX1-201ENST00000227638 MIS18AQ9NYP9 233 aa22.83■■□□□ 1.24
PANX1-201ENST00000227638 PNPLA6Q8IY17 1366 aa22.82■■□□□ 1.24
PANX1-201ENST00000227638 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
PANX1-201ENST00000227638 IL13P35225 146 aa22.82■■□□□ 1.24
PANX1-201ENST00000227638 NUCB1Q02818 461 aa22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.7 ms