RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000089378.4

Sh3bp1-203, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,001 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tspyl2Q7TQI8 677 aa27.19■■□□□ 1.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 IghaA0A0A6YXW6 389 aa27.17■■□□□ 1.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pank1Q8K4K6 548 aa27.17■■□□□ 1.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Uhrf1bp1B2KF50 1429 aa27.15■■□□□ 1.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Safb2Q80YR5 991 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ciz1Q8VEH2 845 aa27.14■■□□□ 1.94
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Map3k19E9Q3S4 1311 aa27.13■■□□□ 1.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slit3Q9WVB4 1523 aa27.13■■□□□ 1.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ccar1Q8CH18 1146 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Kif1aP33173 1695 aa27.12■■□□□ 1.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dbr1Q923B1 550 aa27.12■■□□□ 1.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ksr2Q3UVC0 959 aa27.11■■□□□ 1.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dusp27Q148W8 1138 aa27.11■■□□□ 1.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cps1Q8C196 1500 aa27.09■■□□□ 1.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 PaskQ8CEE6 1383 aa27.09■■□□□ 1.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ccdc27Q3V036 639 aa27.08■■□□□ 1.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cavin4A2AMM0 362 aa27.06■■□□□ 1.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Duxf3A0A0N4SV92 674 aa27.05■■□□□ 1.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Trim28Q62318 834 aa27.05■■□□□ 1.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dip2bQ3UH60 1574 aa27.04■■□□□ 1.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 NudcO35685 332 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 PzpQ61838 1495 aa27.04■■□□□ 1.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 ChgaP26339 463 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Polr3glQ8R0C0 218 aa27.03■■□□□ 1.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ttc21aQ8C0S4 1314 aa27.03■■□□□ 1.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pik3c2bE9QAN8 1632 aa27.02■■□□□ 1.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nkx1-2P42580 305 aa27.02■■□□□ 1.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fchsd2Q3USJ8 740 aa27.02■■□□□ 1.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Znf316Q6PGE4 1016 aa27.02■■□□□ 1.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Atp7bQ64446 1462 aa27.01■■□□□ 1.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Idi2Q8BFZ6 227 aa27.01■■□□□ 1.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ankrd50F7BE84 1390 aa27■■□□□ 1.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 PtpruB1AUH1 1446 aa27■■□□□ 1.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rlbp1Q9Z275 317 aa27■■□□□ 1.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 HnrnpmQ9D0E1 729 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tnrc6bQ8BKI2 1810 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc12a5Q91V14 1138 aa26.99■■□□□ 1.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 CastP51125 788 aa26.97■■□□□ 1.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Spef2Q8C9J3 1734 aa26.96■■□□□ 1.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pik3r4Q8VD65 1358 aa26.96■■□□□ 1.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Trim26Q99PN3 545 aa26.95■■□□□ 1.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Arap3Q8R5G7 1538 aa26.95■■□□□ 1.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 PalmQ9Z0P4 383 aa26.95■■□□□ 1.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Q4VA45 678 aa26.94■■□□□ 1.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ppp1r15aP17564 657 aa26.94■■□□□ 1.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tmc1Q8R4P5 757 aa26.92■■□□□ 1.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Iqcf3Q9D498 203 aa26.92■■□□□ 1.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 CanxP35564 591 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ccdc171E9Q1U1 1324 aa26.91■■□□□ 1.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Swt1Q9DBQ9 907 aa26.91■■□□□ 1.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rreb1Q3UH06 1700 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 CatipB9EKE5 520 aa26.9■■□□□ 1.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Birc3O08863 600 aa26.9■■□□□ 1.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rbm25B2RY56 838 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ppm1gQ61074 542 aa26.89■■□□□ 1.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Uhrf1bp1lA2RSJ4 1457 aa26.88■■□□□ 1.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ipo8Q7TMY7 1010 aa26.88■■□□□ 1.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Chd4Q6PDQ2 1915 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Trim30dE9PWL0 497 aa26.87■■□□□ 1.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 N4bp2F8VQG7 1678 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mdc1Q5PSV9 1707 aa26.87■■□□□ 1.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dnai1Q8C0M8 701 aa26.87■■□□□ 1.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 4930407I10RikD3Z5T8 1512 aa26.86■■□□□ 1.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ccdc183A2AJB1 534 aa26.86■■□□□ 1.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Q3UJC8 639 aa26.86■■□□□ 1.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Sirt1Q923E4 737 aa26.85■■□□□ 1.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ak7Q9D2H2 614 aa26.85■■□□□ 1.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Hoxb7P09024 217 aa26.84■■□□□ 1.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Atl3Q91YH5 541 aa26.84■■□□□ 1.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ccdc60Q8C4J0 545 aa26.83■■□□□ 1.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ppp1r3fQ9JIG4 799 aa26.82■■□□□ 1.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ppp2r3aB2RXC8 1150 aa26.82■■□□□ 1.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Hs1bp3Q3TC93 395 aa26.81■■□□□ 1.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 D430041D05RikF6ZGR6 1678 aa26.81■■□□□ 1.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 4930567H17RikQ3V0K5 233 aa26.8■■□□□ 1.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Kif20bQ80WE4 1774 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rsph6aQ8CDR2 708 aa26.78■■□□□ 1.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Med1Q925J9 1575 aa26.78■■□□□ 1.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 G3bp1P97855 465 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 NalcnQ8BXR5 1738 aa26.78■■□□□ 1.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Bcl9Q9D219 1425 aa26.78■■□□□ 1.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Armcx1Q9CX83 456 aa26.77■■□□□ 1.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cdc37l1Q9CZP7 335 aa26.77■■□□□ 1.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Sart3Q9JLI8 962 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Maco1Q7TQE6 664 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Lmtk3Q5XJV6 1424 aa26.75■■□□□ 1.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Hsp90ab1P11499 724 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mre11Q61216 706 aa26.74■■□□□ 1.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Astn2Q80Z10 1352 aa26.74■■□□□ 1.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Znf335A2A5K6 1337 aa26.73■■□□□ 1.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 C5P06684 1680 aa26.73■■□□□ 1.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Abcc10Q8R4P9 1501 aa26.73■■□□□ 1.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nsd3Q6P2L6 1439 aa26.73■■□□□ 1.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gnai1B2RSH2 354 aa26.72■■□□□ 1.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gnai3Q9DC51 354 aa26.72■■□□□ 1.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Als2Q920R0 1651 aa26.72■■□□□ 1.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 GphnQ8BUV3 769 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rims2Q9EQZ7 1530 aa26.71■■□□□ 1.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pcdh10E9PXQ7 1057 aa26.7■■□□□ 1.87
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ecm2Q5FW85 670 aa26.7■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 35.7 ms