RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000061239.13

Sh3bp1-202, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cavin4A2AMM0 362 aa23.31■■□□□ 1.32
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Zranb1Q7M760 708 aa23.31■■□□□ 1.32
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Pank1Q8K4K6 548 aa23.31■■□□□ 1.32
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Kif1aP33173 1695 aa23.31■■□□□ 1.32
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Trim28Q62318 834 aa23.31■■□□□ 1.32
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cps1Q8C196 1500 aa23.31■■□□□ 1.32
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Dusp27Q148W8 1138 aa23.3■■□□□ 1.32
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ksr2Q3UVC0 959 aa23.3■■□□□ 1.32
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tmc1Q8R4P5 757 aa23.29■■□□□ 1.32
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Map3k19E9Q3S4 1311 aa23.29■■□□□ 1.32
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ttc21aQ8C0S4 1314 aa23.28■■□□□ 1.32
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 NudcO35685 332 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Atp7bQ64446 1462 aa23.28■■□□□ 1.32
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 PtpruB1AUH1 1446 aa23.26■■□□□ 1.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Duxf3A0A0N4SV92 674 aa23.25■■□□□ 1.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Nkx1-2P42580 305 aa23.25■■□□□ 1.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Chd2E9PZM4 1827 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ankrd50F7BE84 1390 aa23.24■■□□□ 1.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Slit3Q9WVB4 1523 aa23.23■■□□□ 1.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ccdc171E9Q1U1 1324 aa23.22■■□□□ 1.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Dbr1Q923B1 550 aa23.22■■□□□ 1.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Pik3r4Q8VD65 1358 aa23.22■■□□□ 1.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ppp1r15aP17564 657 aa23.21■■□□□ 1.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Idi2Q8BFZ6 227 aa23.21■■□□□ 1.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 CastP51125 788 aa23.21■■□□□ 1.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ppm1gQ61074 542 aa23.21■■□□□ 1.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Hoxb7P09024 217 aa23.2■■□□□ 1.3
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Hs1bp3Q3TC93 395 aa23.19■■□□□ 1.3
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Slc12a5Q91V14 1138 aa23.19■■□□□ 1.3
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Q4VA45 678 aa23.18■■□□□ 1.3
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Atl3Q91YH5 541 aa23.18■■□□□ 1.3
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Swt1Q9DBQ9 907 aa23.18■■□□□ 1.3
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rlbp1Q9Z275 317 aa23.18■■□□□ 1.3
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Mdc1Q5PSV9 1707 aa23.17■■□□□ 1.3
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Spef2Q8C9J3 1734 aa23.17■■□□□ 1.3
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 ChgaP26339 463 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Psme1P97371 249 aa23.17■■□□□ 1.3
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ipo8Q7TMY7 1010 aa23.16■■□□□ 1.3
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Arap3Q8R5G7 1538 aa23.16■■□□□ 1.3
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Polr3glQ8R0C0 218 aa23.16■■□□□ 1.3
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Iqcf3Q9D498 203 aa23.16■■□□□ 1.3
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Adamtsl3G3UXC7 1706 aa23.15■■□□□ 1.3
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Sirt1Q923E4 737 aa23.15■■□□□ 1.3
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 PalmQ9Z0P4 383 aa23.14■■□□□ 1.3
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tnrc6bQ8BKI2 1810 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Dip2bQ3UH60 1574 aa23.14■■□□□ 1.29
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 CanxP35564 591 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Pik3c2bE9QAN8 1632 aa23.13■■□□□ 1.29
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Asxl2Q8BZ32 1370 aa23.13■■□□□ 1.29
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Txndc2Q6P902 515 aa23.13■■□□□ 1.29
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Dnai1Q8C0M8 701 aa23.13■■□□□ 1.29
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rbm25B2RY56 838 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 PzpQ61838 1495 aa23.12■■□□□ 1.29
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ccdc183A2AJB1 534 aa23.12■■□□□ 1.29
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 CatipB9EKE5 520 aa23.12■■□□□ 1.29
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rims2Q9EQZ7 1530 aa23.1■■□□□ 1.29
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ppp2r3aB2RXC8 1150 aa23.1■■□□□ 1.29
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ak7Q9D2H2 614 aa23.08■■□□□ 1.29
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Znf335A2A5K6 1337 aa23.08■■□□□ 1.28
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Trim30dE9PWL0 497 aa23.08■■□□□ 1.28
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Mre11Q61216 706 aa23.07■■□□□ 1.28
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Dnajc5gQ8C632 165 aa23.07■■□□□ 1.28
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Trim26Q99PN3 545 aa23.07■■□□□ 1.28
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Uhrf1bp1lA2RSJ4 1457 aa23.07■■□□□ 1.28
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ccdc60Q8C4J0 545 aa23.06■■□□□ 1.28
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Astn2Q80Z10 1352 aa23.06■■□□□ 1.28
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ccdc9Q8VC31 543 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Med1Q925J9 1575 aa23.06■■□□□ 1.28
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 N4bp2F8VQG7 1678 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 G3bp1P97855 465 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rsph6aQ8CDR2 708 aa23.04■■□□□ 1.28
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Lmtk3Q5XJV6 1424 aa23.04■■□□□ 1.28
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Birc3O08863 600 aa23.04■■□□□ 1.28
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Sos1Q62245 1319 aa23.03■■□□□ 1.28
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 IghaA0A0A6YXW6 389 aa23.02■■□□□ 1.28
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gnai1B2RSH2 354 aa23.02■■□□□ 1.28
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gnai3Q9DC51 354 aa23.02■■□□□ 1.28
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 NalcnQ8BXR5 1738 aa23.02■■□□□ 1.28
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cdc37l1Q9CZP7 335 aa23.02■■□□□ 1.28
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rreb1Q3UH06 1700 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Safb2Q80YR5 991 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Phlpp2Q8BXA7 1320 aa23.01■■□□□ 1.27
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Chmp4bQ9D8B3 224 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Maco1Q7TQE6 664 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 CemipQ8BI06 1361 aa22.99■■□□□ 1.27
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Pcdh10E9PXQ7 1057 aa22.99■■□□□ 1.27
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Hsp90aa1P07901 733 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Hsp90ab1P11499 724 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cavin2Q63918 418 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ppp1r9bQ6R891 817 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Chd4Q6PDQ2 1915 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ppp1r3fQ9JIG4 799 aa22.98■■□□□ 1.27
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Sart3Q9JLI8 962 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Aldh1l1Q8R0Y6 902 aa22.98■■□□□ 1.27
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 4930567H17RikQ3V0K5 233 aa22.97■■□□□ 1.27
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Nsd3Q6P2L6 1439 aa22.97■■□□□ 1.27
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Vamp4O70480 141 aa22.96■■□□□ 1.27
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Zfp777B9EKF4 885 aa22.96■■□□□ 1.27
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Plekhm2Q80TQ5 1018 aa22.96■■□□□ 1.27
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Mon2Q80TL7 1715 aa22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 33.8 ms