RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000034452.11

Ccsap-201, Transcript of Centriole, cilia and spindle-associated protein, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ccsap, Length 2,390 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccsap-201ENSMUST00000034452 CastP51125 788 aa28.75■■■□□ 2.19
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Tnpo1Q8BFY9 898 aaKnown RBP28.75■■■□□ 2.19
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Pnmal2G3X9N3 661 aa28.73■■■□□ 2.19
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Cavin4A2AMM0 362 aa28.73■■■□□ 2.19
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Cluap1Q8R3P7 413 aa28.73■■■□□ 2.19
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Zranb1Q7M760 708 aa28.72■■■□□ 2.19
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Arhgap23Q69ZH9 1483 aa28.72■■■□□ 2.19
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Ttc21aQ8C0S4 1314 aa28.71■■■□□ 2.19
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Dip2cE9PWR4 1557 aa28.71■■■□□ 2.19
Ccsap-201ENSMUST00000034452 AdgbG3UZ78 1657 aa28.71■■■□□ 2.19
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Plcd4Q8K3R3 807 aa28.7■■■□□ 2.19
Ccsap-201ENSMUST00000034452 RereQ80TZ9 1558 aa28.69■■■□□ 2.18
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Uhrf1bp1B2KF50 1429 aa28.69■■■□□ 2.18
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Znf541Q0GGX2 1363 aa28.69■■■□□ 2.18
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Adamts7Q68SA9 1657 aa28.69■■■□□ 2.18
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Ankrd50F7BE84 1390 aa28.68■■■□□ 2.18
Ccsap-201ENSMUST00000034452 PaskQ8CEE6 1383 aa28.67■■■□□ 2.18
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Map7O88735 730 aa28.67■■■□□ 2.18
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Prrc2bQ7TPM1 1486 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
Ccsap-201ENSMUST00000034452 AU019823E9PUQ3 292 aa28.66■■■□□ 2.18
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Gsto1O09131 240 aa28.66■■■□□ 2.18
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Shq1Q7TMX5 569 aa28.66■■■□□ 2.18
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Atp1b4Q99ME6 356 aa28.66■■■□□ 2.18
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Ccdc171E9Q1U1 1324 aa28.65■■■□□ 2.18
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Rbm25B2RY56 838 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Ccdc60Q8C4J0 545 aa28.65■■■□□ 2.18
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Maco1Q7TQE6 664 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.18
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Mfap1aC0HKD8 439 aaKnown RBP28.62■■■□□ 2.17
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Mfap1bC0HKD9 439 aaKnown RBP28.62■■■□□ 2.17
Ccsap-201ENSMUST00000034452 NinlQ6ZQ12 1394 aa28.6■■■□□ 2.17
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Cep170bQ80U49 1574 aa28.6■■■□□ 2.17
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Antxr1Q9CZ52 562 aa28.6■■■□□ 2.17
Ccsap-201ENSMUST00000034452 CltcQ68FD5 1675 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
Ccsap-201ENSMUST00000034452 G3bp1P97855 465 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Pik3r4Q8VD65 1358 aa28.59■■■□□ 2.17
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Fchsd2Q3USJ8 740 aa28.59■■■□□ 2.17
Ccsap-201ENSMUST00000034452 FanciQ8K368 1330 aa28.58■■■□□ 2.17
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Kif18aQ91WD7 886 aa28.58■■■□□ 2.17
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Znf330Q922H9 316 aa28.58■■■□□ 2.17
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Swt1Q9DBQ9 907 aa28.58■■■□□ 2.17
Ccsap-201ENSMUST00000034452 SkilQ60665 675 aa28.57■■■□□ 2.16
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Cdk19Q8BWD8 501 aa28.57■■■□□ 2.16
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Slc12a5Q91V14 1138 aa28.56■■■□□ 2.16
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Kif2cQ922S8 721 aa28.56■■■□□ 2.16
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Ahdc1Q6PAL7 1594 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Usp32F8VPZ3 1604 aa28.55■■■□□ 2.16
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Q4VA45 678 aa28.55■■■□□ 2.16
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Atp2b2Q9R0K7 1198 aa28.54■■■□□ 2.16
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Qser1A2BIE1 1698 aa28.54■■■□□ 2.16
Ccsap-201ENSMUST00000034452 PtprmP28828 1452 aa28.53■■■□□ 2.16
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Trim28Q62318 834 aa28.52■■■□□ 2.16
Ccsap-201ENSMUST00000034452 PalmQ9Z0P4 383 aa28.52■■■□□ 2.16
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Ipo4Q8VI75 1082 aa28.52■■■□□ 2.16
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Atp7bQ64446 1462 aa28.52■■■□□ 2.16
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Utp14aQ640M1 767 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Yeats2Q3TUF7 1407 aa28.51■■■□□ 2.15
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Catsper2A2ARP9 588 aa28.51■■■□□ 2.15
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Brd1E9PZ26 1189 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Rangap1P46061 589 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Arhgef28P97433 1693 aa28.5■■■□□ 2.15
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Terf2O35144 541 aa28.5■■■□□ 2.15
Ccsap-201ENSMUST00000034452 KnstrnQ9D9Z1 312 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Cog6Q8R3I3 657 aa28.48■■■□□ 2.15
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Q9D9H8 365 aa28.48■■■□□ 2.15
Ccsap-201ENSMUST00000034452 4933402E13RikQ9D4D2 429 aa28.48■■■□□ 2.15
Ccsap-201ENSMUST00000034452 NktrP30415 1453 aa28.48■■■□□ 2.15
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Nutm1Q8BHP2 1126 aa28.47■■■□□ 2.15
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Naip7Q9JIB3 1402 aa28.46■■■□□ 2.15
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Plekhm2Q80TQ5 1018 aa28.46■■■□□ 2.15
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Amer1Q7TS75 1132 aa28.46■■■□□ 2.15
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Aldh1l1Q8R0Y6 902 aa28.46■■■□□ 2.15
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Wwc1Q5SXA9 1104 aa28.45■■■□□ 2.15
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Plekhg1F6S200 1446 aa28.45■■■□□ 2.14
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Q3UPC7 1272 aa28.44■■■□□ 2.14
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Tmco5bQ80X59 307 aa28.44■■■□□ 2.14
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Cdc37l1Q9CZP7 335 aa28.44■■■□□ 2.14
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Nectin2P32507 530 aa28.43■■■□□ 2.14
Ccsap-201ENSMUST00000034452 MvpQ9EQK5 861 aa28.43■■■□□ 2.14
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Abca14E9Q8F8 1683 aa28.43■■■□□ 2.14
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Nsd3Q6P2L6 1439 aa28.42■■■□□ 2.14
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Vamp4O70480 141 aa28.42■■■□□ 2.14
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Chmp4bQ9D8B3 224 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Ppp1r15aP17564 657 aa28.4■■■□□ 2.14
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Cetn4Q8K4K1 168 aa28.39■■■□□ 2.14
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Spryd3E9Q9B3 442 aa28.39■■■□□ 2.14
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Cul9Q80TT8 1865 aa28.39■■■□□ 2.13
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Gm10093D3YYI8 482 aa28.38■■■□□ 2.13
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Hdac1O09106 482 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Map3k19E9Q3S4 1311 aa28.38■■■□□ 2.13
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Gnai1B2RSH2 354 aa28.37■■■□□ 2.13
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Ankrd44B2RXR6 993 aa28.37■■■□□ 2.13
Ccsap-201ENSMUST00000034452 LifrP42703 1092 aa28.37■■■□□ 2.13
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Gnai3Q9DC51 354 aa28.37■■■□□ 2.13
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Mcm4P49717 862 aa28.36■■■□□ 2.13
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Ssh1Q76I79 1042 aa28.36■■■□□ 2.13
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Dnttip2Q8R2M2 758 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
Ccsap-201ENSMUST00000034452 AU015836B2RUM3 263 aa28.34■■■□□ 2.13
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Fgd1P52734 960 aa28.34■■■□□ 2.13
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Wdr63B2RY71 923 aa28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 22.4 ms