RNA–Protein interactions for RNA: YOL054W

PSH1, Transcript of E3 ubiquitin ligase targeting centromere-binding protein Cse4p, yeast

Gene PSH1, Length 1,221 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PSH1	YOL054W	YFL034W	P43564	1073 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PSH1	YOL054W	TPD3	P31383	635 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PSH1	YOL054W	ASF1	P32447	279 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PSH1	YOL054W	MET10	P39692	1035 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PSH1	YOL054W	CWC15	Q03772	175 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
PSH1	YOL054W	YRF1-1	P0CX20	1796 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PSH1	YOL054W	YRF1-5	P0CX21	1796 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PSH1	YOL054W	YRF1-8	P0CX22	1796 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PSH1	YOL054W	SPO14	P36126	1683 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PSH1	YOL054W	PDI1	P17967	522 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
PSH1	YOL054W	ERP5	P38819	212 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PSH1	YOL054W	ROM1	P53046	1155 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PSH1	YOL054W	BUD21	Q08492	214 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
PSH1	YOL054W	VAN1	P23642	535 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PSH1	YOL054W	IXR1	P33417	597 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PSH1	YOL054W	TPS3	P38426	1054 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
PSH1	YOL054W	PNP1	Q05788	311 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PSH1	YOL054W	ISR1	Q06098	443 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
PSH1	YOL054W	PUN1	Q06991	263 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PSH1	YOL054W	AIM44	Q99299	758 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PSH1	YOL054W	MHP1	P43638	1398 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PSH1	YOL054W	MIP1	P15801	1254 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PSH1	YOL054W	RRN6	P32786	894 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PSH1	YOL054W	PRS1	P32895	427 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
PSH1	YOL054W	IPL1	P38991	367 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PSH1	YOL054W	TRS33	Q99394	268 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PSH1	YOL054W	YSP2	Q06681	1438 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PSH1	YOL054W	NUP157	P40064	1391 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
PSH1	YOL054W	FUR4	P05316	633 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
PSH1	YOL054W	SRS2	P12954	1174 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PSH1	YOL054W	KIP2	P28743	706 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PSH1	YOL054W	GRS1	P38088	690 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
PSH1	YOL054W	ATG20	Q07528	640 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PSH1	YOL054W	CBC2	Q08920	208 aa	Known RBP RIP-Chip data	7.33	□□□□□ -1.24	not detected
PSH1	YOL054W	AIM9	P40053	627 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
PSH1	YOL054W	MSC6	Q08818	692 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
PSH1	YOL054W	YLR419W	Q06698	1435 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
PSH1	YOL054W	BUD3	P25558	1636 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PSH1	YOL054W	YDR444W	Q04093	687 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PSH1	YOL054W	YOR093C	Q12275	1648 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PSH1	YOL054W	MOD5	P07884	428 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PSH1	YOL054W	PAF1	P38351	445 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PSH1	YOL054W	YHL050C	P38721	697 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PSH1	YOL054W	YHR219W	P38900	624 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PSH1	YOL054W	HAL5	P38970	855 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
PSH1	YOL054W	ATG1	P53104	897 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PSH1	YOL054W	TY3B-I	Q7LHG5	1498 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
PSH1	YOL054W	SEC7	P11075	2009 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
PSH1	YOL054W	CWH41	P53008	833 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PSH1	YOL054W	HDA3	Q06623	655 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PSH1	YOL054W	MET32	Q12041	191 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PSH1	YOL054W	ASH1	P34233	588 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PSH1	YOL054W	BOL3	P39724	118 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PSH1	YOL054W	THI12	P42883	340 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PSH1	YOL054W	THI5	P43534	340 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PSH1	YOL054W	THI11	P47183	340 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PSH1	YOL054W	THI13	Q07748	340 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PSH1	YOL054W	TRL1	P09880	827 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
PSH1	YOL054W	NTH2	P35172	780 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PSH1	YOL054W	GLO3	P38682	493 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
PSH1	YOL054W	CHC1	P22137	1653 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
PSH1	YOL054W	PPX1	P38698	397 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PSH1	YOL054W	MDJ2	P42834	146 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PSH1	YOL054W	ALD4	P46367	519 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
PSH1	YOL054W	SYH1	Q02875	849 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
PSH1	YOL054W	YDL176W	Q12027	708 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PSH1	YOL054W	CYT1	P07143	309 aa		7.25	□□□□□ -1.25
PSH1	YOL054W	AFT1	P22149	690 aa		7.25	□□□□□ -1.25
PSH1	YOL054W	PAM1	P37304	830 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
PSH1	YOL054W	LCB5	Q06147	687 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
PSH1	YOL054W	UBP1	P25037	809 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PSH1	YOL054W	QDR1	P40475	563 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PSH1	YOL054W	POL32	P47110	350 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PSH1	YOL054W	APP1	P53933	587 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PSH1	YOL054W	RAV1	P47104	1357 aa		7.23	□□□□□ -1.25
PSH1	YOL054W	RPS6A	P0CX37	236 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
PSH1	YOL054W	RPS6B	P0CX38	236 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
PSH1	YOL054W	UTR2	P32623	467 aa		7.23	□□□□□ -1.25
PSH1	YOL054W	TBS1	P38114	1094 aa		7.23	□□□□□ -1.25
PSH1	YOL054W	EMW1	P42842	904 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
PSH1	YOL054W	ACF4	P47129	309 aa		7.23	□□□□□ -1.25
PSH1	YOL054W	RTC1	Q08281	1341 aa		7.23	□□□□□ -1.25
PSH1	YOL054W	RPP2B	P02400	110 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
PSH1	YOL054W	MKS1	P34072	584 aa		7.22	□□□□□ -1.25
PSH1	YOL054W	PUS5	Q06244	254 aa		7.22	□□□□□ -1.25
PSH1	YOL054W	BNR1	P40450	1375 aa		7.21	□□□□□ -1.25
PSH1	YOL054W	DAT1	P13483	248 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.26
PSH1	YOL054W	HST3	P53687	447 aa		7.21	□□□□□ -1.26
PSH1	YOL054W	ISU1	Q03020	165 aa		7.21	□□□□□ -1.26
PSH1	YOL054W	SPT2	P06843	333 aa	Predicted RBP	7.2	□□□□□ -1.26
PSH1	YOL054W	SWI5	P08153	709 aa		7.2	□□□□□ -1.26
PSH1	YOL054W	FBP26	P32604	452 aa		7.2	□□□□□ -1.26
PSH1	YOL054W	NUT2	Q06213	157 aa		7.2	□□□□□ -1.26
PSH1	YOL054W	SCT1	P32784	759 aa		7.19	□□□□□ -1.26
PSH1	YOL054W	SPR3	P41901	512 aa		7.19	□□□□□ -1.26
PSH1	YOL054W	ALD2	P47771	506 aa		7.19	□□□□□ -1.26
PSH1	YOL054W	PDS5	Q04264	1277 aa		7.19	□□□□□ -1.26
PSH1	YOL054W	WHI5	Q12416	295 aa		7.19	□□□□□ -1.26
PSH1	YOL054W	SUV3	P32580	737 aa		7.18	□□□□□ -1.26
PSH1	YOL054W	NGR1	P32831	672 aa	Known RBP	7.18	□□□□□ -1.26

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