RNA–Protein interactions for RNA: YKR070W

YKR070W, Transcript of Putative protein of unknown function, yeast

Gene YKR070W, Length 1,059 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKR070W	YKR070W	FIR1	P40020	876 aa		6.63	□□□□□ -1.35
YKR070W	YKR070W	SPR3	P41901	512 aa		6.63	□□□□□ -1.35
YKR070W	YKR070W	SUT1	P53032	299 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
YKR070W	YKR070W	CUS1	Q02554	436 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
YKR070W	YKR070W	LSO1	Q3E827	93 aa		6.62	□□□□□ -1.35
YKR070W	YKR070W	NCL1	P38205	684 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
YKR070W	YKR070W	SYT1	Q06836	1226 aa		6.61	□□□□□ -1.35
YKR070W	YKR070W	DPH6	Q12429	685 aa		6.61	□□□□□ -1.35
YKR070W	YKR070W	YDR461C-A	Q2V2P7	80 aa		6.61	□□□□□ -1.35
YKR070W	YKR070W	YBR287W	P38355	427 aa		6.6	□□□□□ -1.35
YKR070W	YKR070W	QDR1	P40475	563 aa		6.6	□□□□□ -1.35
YKR070W	YKR070W	HXT8	P40886	569 aa		6.6	□□□□□ -1.35
YKR070W	YKR070W	YBL113C	Q7M4S9	792 aa		6.6	□□□□□ -1.35
YKR070W	YKR070W	RPC31	P17890	251 aa		6.59	□□□□□ -1.35
YKR070W	YKR070W	BOI1	P38041	980 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
YKR070W	YKR070W	GRS1	P38088	690 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
YKR070W	YKR070W	GIP1	P38229	639 aa		6.59	□□□□□ -1.35
YKR070W	YKR070W	APM2	P38700	605 aa		6.59	□□□□□ -1.35
YKR070W	YKR070W	ISW1	P38144	1129 aa		6.58	□□□□□ -1.36
YKR070W	YKR070W	SKP1	P52286	194 aa		6.58	□□□□□ -1.36
YKR070W	YKR070W	YOR296W	Q08748	1289 aa		6.58	□□□□□ -1.36
YKR070W	YKR070W	ATG1	P53104	897 aa		6.57	□□□□□ -1.36
YKR070W	YKR070W	RPB10	P22139	70 aa		6.56	□□□□□ -1.36
YKR070W	YKR070W	MSN1	P22148	382 aa		6.56	□□□□□ -1.36
YKR070W	YKR070W	TRK2	P28584	889 aa		6.56	□□□□□ -1.36
YKR070W	YKR070W	SMC1	P32908	1225 aa		6.56	□□□□□ -1.36
YKR070W	YKR070W	BSD2	P38356	321 aa		6.56	□□□□□ -1.36
YKR070W	YKR070W	ERP5	P38819	212 aa		6.56	□□□□□ -1.36
YKR070W	YKR070W	JJJ3	P47138	172 aa		6.56	□□□□□ -1.36
YKR070W	YKR070W	HEH2	Q03281	663 aa		6.56	□□□□□ -1.36
YKR070W	YKR070W	APC11	Q12157	165 aa		6.56	□□□□□ -1.36
YKR070W	YKR070W	ACF4	P47129	309 aa		6.55	□□□□□ -1.36
YKR070W	YKR070W	YNR040W	P53736	256 aa		6.54	□□□□□ -1.36
YKR070W	YKR070W	NAB2	P32505	525 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.53	□□□□□ -1.36	not detected
YKR070W	YKR070W	SSF1	P38789	453 aa	Predicted RBP	6.53	□□□□□ -1.36
YKR070W	YKR070W	RAD55	P38953	406 aa		6.53	□□□□□ -1.36
YKR070W	YKR070W	TY1A-DR2	Q03964	440 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
YKR070W	YKR070W	TRL1	P09880	827 aa	Known RBP	6.52	□□□□□ -1.37
YKR070W	YKR070W	ITC1	P53125	1264 aa		6.52	□□□□□ -1.37
YKR070W	YKR070W	UFD2	P54860	961 aa		6.52	□□□□□ -1.37
YKR070W	YKR070W	MSC7	P38694	644 aa		6.51	□□□□□ -1.37
YKR070W	YKR070W	AIM46	P38885	310 aa		6.51	□□□□□ -1.37
YKR070W	YKR070W	SLD2	P34252	453 aa		6.5	□□□□□ -1.37
YKR070W	YKR070W	NTA1	P40354	457 aa		6.5	□□□□□ -1.37
YKR070W	YKR070W	MDJ2	P42834	146 aa		6.5	□□□□□ -1.37
YKR070W	YKR070W	GPM1	P00950	247 aa	Known RBP	6.49	□□□□□ -1.37
YKR070W	YKR070W	STM1	P39015	273 aa	Known RBP	6.49	□□□□□ -1.37
YKR070W	YKR070W	RGD2	P43556	714 aa		6.49	□□□□□ -1.37
YKR070W	YKR070W	TRS120	Q04183	1289 aa		6.49	□□□□□ -1.37
YKR070W	YKR070W	RSC2	Q06488	889 aa		6.49	□□□□□ -1.37
YKR070W	YKR070W	AI1	P03875	834 aa		6.48	□□□□□ -1.37
YKR070W	YKR070W	KTR2	P33550	425 aa		6.48	□□□□□ -1.37
YKR070W	YKR070W	IRS4	P36115	615 aa	Known RBP	6.48	□□□□□ -1.37
YKR070W	YKR070W	PSY2	P40164	858 aa		6.48	□□□□□ -1.37
YKR070W	YKR070W	YIL165C	P40446	119 aa		6.48	□□□□□ -1.37
YKR070W	YKR070W	PDC5	P16467	563 aa	Known RBP	6.47	□□□□□ -1.37
YKR070W	YKR070W	KNS1	P32350	737 aa	Predicted RBP	6.47	□□□□□ -1.37
YKR070W	YKR070W	YHL050C	P38721	697 aa		6.47	□□□□□ -1.37
YKR070W	YKR070W	YHR219W	P38900	624 aa		6.47	□□□□□ -1.37
YKR070W	YKR070W	PRK1	P40494	810 aa		6.47	□□□□□ -1.37
YKR070W	YKR070W	EMG1	Q06287	252 aa	Known RBP	6.47	□□□□□ -1.37
YKR070W	YKR070W	TIF6	Q12522	245 aa	Known RBP	6.47	□□□□□ -1.37
YKR070W	YKR070W	IDI1	P15496	288 aa		6.46	□□□□□ -1.38
YKR070W	YKR070W	YER156C	P40093	338 aa	Known RBP	6.46	□□□□□ -1.38
YKR070W	YKR070W	YJL181W	P46987	611 aa		6.46	□□□□□ -1.38
YKR070W	YKR070W	PPT1	P53043	513 aa		6.46	□□□□□ -1.38
YKR070W	YKR070W	YNR014W	P53719	212 aa		6.46	□□□□□ -1.38
YKR070W	YKR070W	YML020W	Q03722	664 aa		6.46	□□□□□ -1.38
YKR070W	YKR070W	THI72	Q08579	599 aa		6.46	□□□□□ -1.38
YKR070W	YKR070W	MET1	P36150	593 aa		6.45	□□□□□ -1.38
YKR070W	YKR070W	ECM2	P38241	364 aa	Known RBP	6.45	□□□□□ -1.38
YKR070W	YKR070W	THI12	P42883	340 aa		6.45	□□□□□ -1.38
YKR070W	YKR070W	THI5	P43534	340 aa		6.45	□□□□□ -1.38
YKR070W	YKR070W	THI11	P47183	340 aa		6.45	□□□□□ -1.38
YKR070W	YKR070W	NUT2	Q06213	157 aa		6.45	□□□□□ -1.38
YKR070W	YKR070W	THI13	Q07748	340 aa		6.45	□□□□□ -1.38
YKR070W	YKR070W	YNL011C	P53980	444 aa		6.44	□□□□□ -1.38
YKR070W	YKR070W	NSG2	P53898	299 aa		6.43	□□□□□ -1.38
YKR070W	YKR070W	FRT1	Q99332	602 aa		6.43	□□□□□ -1.38
YKR070W	YKR070W	INO80	P53115	1489 aa		6.42	□□□□□ -1.38
YKR070W	YKR070W	SEC20	P28791	383 aa		6.42	□□□□□ -1.38
YKR070W	YKR070W	ALG14	P38242	237 aa		6.42	□□□□□ -1.38
YKR070W	YKR070W	BOI2	P39969	1040 aa		6.42	□□□□□ -1.38
YKR070W	YKR070W	MSC6	Q08818	692 aa	Known RBP	6.42	□□□□□ -1.38
YKR070W	YKR070W	BSC2	Q05611	235 aa		6.41	□□□□□ -1.38
YKR070W	YKR070W	MDJ1	P35191	511 aa		6.4	□□□□□ -1.38
YKR070W	YKR070W	PGM2	P37012	569 aa	Known RBP	6.4	□□□□□ -1.38
YKR070W	YKR070W	SBE2	P42223	864 aa	Known RBP	6.4	□□□□□ -1.38
YKR070W	YKR070W	CDC55	Q00362	526 aa		6.4	□□□□□ -1.38
YKR070W	YKR070W	RSC4	Q02206	625 aa		6.4	□□□□□ -1.38
YKR070W	YKR070W	NHA1	Q99271	985 aa		6.4	□□□□□ -1.38
YKR070W	YKR070W	MRP10	O75012	95 aa		6.39	□□□□□ -1.39
YKR070W	YKR070W	YHL008C	P38750	627 aa		6.39	□□□□□ -1.39
YKR070W	YKR070W	PPX1	P38698	397 aa		6.38	□□□□□ -1.39
YKR070W	YKR070W	IPL1	P38991	367 aa		6.38	□□□□□ -1.39
YKR070W	YKR070W	INP51	P40559	946 aa	Known RBP	6.38	□□□□□ -1.39
YKR070W	YKR070W	SAM37	P50110	327 aa		6.38	□□□□□ -1.39
YKR070W	YKR070W	MNL2	Q12205	849 aa		6.38	□□□□□ -1.39
YKR070W	YKR070W	FUS1	P11710	512 aa		6.37	□□□□□ -1.39
YKR070W	YKR070W	NAR1	P23503	491 aa	Known RBP	6.37	□□□□□ -1.39

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 15.3 ms