RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608317.1

PAXIP1-AS1-201, Transcript of PAXIP1 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

BASIC

Gene PAXIP1-AS1, Length 2,256 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 PTPRUQ92729 1446 aa28.52■■■□□ 2.16
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 MED14O60244 1454 aa28.51■■■□□ 2.15
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 ROBO2Q9HCK4 1378 aa28.5■■■□□ 2.15
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP28.5■■■□□ 2.15
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 KNSTRNQ9Y448 316 aa28.5■■■□□ 2.15
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 CDK19Q9BWU1 502 aa28.49■■■□□ 2.15
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 FAM9BQ8IZU0 186 aa28.48■■■□□ 2.15
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP28.47■■■□□ 2.15
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 MYT1Q01538 1121 aa28.46■■■□□ 2.15
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 PARD3Q8TEW0 1356 aa28.46■■■□□ 2.15
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 DLC1Q96QB1 1528 aa28.46■■■□□ 2.15
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa28.45■■■□□ 2.15
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa28.44■■■□□ 2.14
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 ANKLE2Q86XL3 938 aa28.44■■■□□ 2.14
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 TBX22Q9Y458 520 aa28.44■■■□□ 2.14
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 RALBP1Q15311 655 aa28.43■■■□□ 2.14
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa28.42■■■□□ 2.14
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 TECPR2O15040 1411 aa28.42■■■□□ 2.14
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP28.41■■■□□ 2.14
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa28.39■■■□□ 2.13
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 CABP1Q9NZU7 370 aa28.38■■■□□ 2.13
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 NSD3Q9BZ95 1437 aa28.37■■■□□ 2.13
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 CPS1P31327 1500 aa28.37■■■□□ 2.13
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 NUTM2FA1L443 756 aa28.36■■■□□ 2.13
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 FAM135BQ49AJ0 1406 aa28.36■■■□□ 2.13
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 WASLO00401 505 aaPredicted RBP28.36■■■□□ 2.13
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 KCNA6P17658 529 aa28.36■■■□□ 2.13
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 KNDC1Q76NI1 1749 aa28.35■■■□□ 2.13
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 SIRT1Q96EB6 747 aa28.34■■■□□ 2.13
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 A0A1W2PP64 1363 aa28.33■■■□□ 2.13
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 HSPA2P54652 639 aa28.32■■■□□ 2.12
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP28.31■■■□□ 2.12
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 CD163L1Q9NR16 1453 aa28.31■■■□□ 2.12
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 NLRP13Q86W25 1043 aa28.3■■■□□ 2.12
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 ATAD2Q6PL18 1390 aa28.3■■■□□ 2.12
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa28.3■■■□□ 2.12
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 PPP2R1AP30153 589 aa28.29■■■□□ 2.12
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 PRR36Q9H6K5 1346 aa28.29■■■□□ 2.12
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 DIP2AQ14689 1571 aa28.24■■■□□ 2.11
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa28.23■■■□□ 2.11
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 PTCH1Q13635 1447 aa28.21■■■□□ 2.11
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa28.21■■■□□ 2.11
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 GGNBP2Q9H3C7 697 aa28.2■■■□□ 2.11
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 TERF2IPQ9NYB0 399 aa28.2■■■□□ 2.1
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 CGNL1Q0VF96 1302 aa28.19■■■□□ 2.1
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 CCDC61Q9Y6R9 512 aa28.18■■■□□ 2.1
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 NINLQ9Y2I6 1382 aa28.18■■■□□ 2.1
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP28.18■■■□□ 2.1
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 ATP7BP35670 1465 aa28.18■■■□□ 2.1
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 MORC1Q86VD1 984 aa28.17■■■□□ 2.1
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 FYB1O15117 783 aa28.16■■■□□ 2.1
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 PIK3R4Q99570 1358 aa28.16■■■□□ 2.1
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 ADGRB2O60241 1585 aa28.12■■■□□ 2.09
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 FBLN1P23142 703 aa28.12■■■□□ 2.09
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa28.11■■■□□ 2.09
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 ZRANB1Q9UGI0 708 aa28.1■■■□□ 2.09
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 USP32Q8NFA0 1604 aa28.08■■■□□ 2.09
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 LMTK3Q96Q04 1460 aa28.07■■■□□ 2.08
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 ADAMTS8Q9UP79 889 aa28.07■■■□□ 2.08
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 ACEP12821 1306 aa28.06■■■□□ 2.08
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 NME9Q86XW9 330 aa28.06■■■□□ 2.08
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 MTHFSP49914 203 aa28.04■■■□□ 2.08
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa28.02■■■□□ 2.08
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 NALCNQ8IZF0 1738 aa28.01■■■□□ 2.08
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 PLEKHG3A1L390 1219 aa28■■■□□ 2.07
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 NSD2O96028 1365 aa27.99■■■□□ 2.07
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 C14orf37Q86TY3 774 aa27.99■■■□□ 2.07
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa27.99■■■□□ 2.07
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 ZBED9Q6R2W3 1325 aa27.97■■■□□ 2.07
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP27.97■■■□□ 2.07
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP27.97■■■□□ 2.07
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP27.94■■■□□ 2.06
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP27.94■■■□□ 2.06
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 CCDC146Q8IYE0 955 aa27.94■■■□□ 2.06
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 STRCP1A6NGW2 1772 aa27.93■■■□□ 2.06
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 AKAP12Q02952 1782 aa27.93■■■□□ 2.06
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 MON2Q7Z3U7 1717 aa27.93■■■□□ 2.06
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 STRCQ7RTU9 1775 aa27.92■■■□□ 2.06
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 KIF20BQ96Q89 1820 aa27.92■■■□□ 2.06
PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14 ms