RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589146.5

CAPNS1-207, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CAPNS1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-207ENST00000589146 BCANQ96GW7 911 aa31.11■■■□□ 2.57
CAPNS1-207ENST00000589146 NINLQ9Y2I6 1382 aa31.08■■■□□ 2.57
CAPNS1-207ENST00000589146 KNSTRNQ9Y448 316 aa31.06■■■□□ 2.56
CAPNS1-207ENST00000589146 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa31.05■■■□□ 2.56
CAPNS1-207ENST00000589146 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP31.05■■■□□ 2.56
CAPNS1-207ENST00000589146 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP31.05■■■□□ 2.56
CAPNS1-207ENST00000589146 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP31.04■■■□□ 2.56
CAPNS1-207ENST00000589146 CCDC184Q52MB2 194 aa31.04■■■□□ 2.56
CAPNS1-207ENST00000589146 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP31.04■■■□□ 2.56
CAPNS1-207ENST00000589146 ATAD2Q6PL18 1390 aa31.04■■■□□ 2.56
CAPNS1-207ENST00000589146 WAPLQ7Z5K2 1190 aa31.03■■■□□ 2.56
CAPNS1-207ENST00000589146 ANKLE2Q86XL3 938 aa31.03■■■□□ 2.56
CAPNS1-207ENST00000589146 PIK3R4Q99570 1358 aa31.03■■■□□ 2.56
CAPNS1-207ENST00000589146 PTPRUQ92729 1446 aa31.02■■■□□ 2.56
CAPNS1-207ENST00000589146 MRS2Q9HD23 443 aa31.01■■■□□ 2.55
CAPNS1-207ENST00000589146 CABP2Q9NPB3 220 aa31■■■□□ 2.55
CAPNS1-207ENST00000589146 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP31■■■□□ 2.55
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC26A8Q96RN1 970 aa30.99■■■□□ 2.55
CAPNS1-207ENST00000589146 CARD14Q9BXL6 1004 aa30.99■■■□□ 2.55
CAPNS1-207ENST00000589146 ROBO2Q9HCK4 1378 aa30.99■■■□□ 2.55
CAPNS1-207ENST00000589146 CDK19Q9BWU1 502 aa30.98■■■□□ 2.55
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa30.98■■■□□ 2.55
CAPNS1-207ENST00000589146 USP32Q8NFA0 1604 aa30.98■■■□□ 2.55
CAPNS1-207ENST00000589146 PTCH1Q13635 1447 aa30.98■■■□□ 2.55
CAPNS1-207ENST00000589146 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa30.97■■■□□ 2.55
CAPNS1-207ENST00000589146 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP30.96■■■□□ 2.55
CAPNS1-207ENST00000589146 ADGRB2O60241 1585 aa30.96■■■□□ 2.55
CAPNS1-207ENST00000589146 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP30.95■■■□□ 2.55
CAPNS1-207ENST00000589146 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP30.95■■■□□ 2.55
CAPNS1-207ENST00000589146 TMC1Q8TDI8 760 aa30.95■■■□□ 2.55
CAPNS1-207ENST00000589146 NLRP13Q86W25 1043 aa30.94■■■□□ 2.54
CAPNS1-207ENST00000589146 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa30.92■■■□□ 2.54
CAPNS1-207ENST00000589146 WASLO00401 505 aaPredicted RBP30.91■■■□□ 2.54
CAPNS1-207ENST00000589146 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP30.91■■■□□ 2.54
CAPNS1-207ENST00000589146 NSD3Q9BZ95 1437 aa30.9■■■□□ 2.54
CAPNS1-207ENST00000589146 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP30.89■■■□□ 2.54
CAPNS1-207ENST00000589146 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP30.87■■■□□ 2.53
CAPNS1-207ENST00000589146 CD163L1Q9NR16 1453 aa30.86■■■□□ 2.53
CAPNS1-207ENST00000589146 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP30.85■■■□□ 2.53
CAPNS1-207ENST00000589146 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP30.84■■■□□ 2.53
CAPNS1-207ENST00000589146 ATP7BP35670 1465 aa30.84■■■□□ 2.53
CAPNS1-207ENST00000589146 TERF2IPQ9NYB0 399 aa30.83■■■□□ 2.53
CAPNS1-207ENST00000589146 A0A1W2PP64 1363 aa30.82■■■□□ 2.52
CAPNS1-207ENST00000589146 NSD2O96028 1365 aa30.82■■■□□ 2.52
CAPNS1-207ENST00000589146 CGNL1Q0VF96 1302 aa30.8■■■□□ 2.52
CAPNS1-207ENST00000589146 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa30.8■■■□□ 2.52
CAPNS1-207ENST00000589146 PPP2R1AP30153 589 aa30.8■■■□□ 2.52
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM9BQ8IZU0 186 aa30.78■■■□□ 2.52
CAPNS1-207ENST00000589146 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP30.77■■■□□ 2.52
CAPNS1-207ENST00000589146 CABP1Q9NZU7 370 aa30.77■■■□□ 2.52
CAPNS1-207ENST00000589146 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP30.76■■■□□ 2.51
CAPNS1-207ENST00000589146 KCNA6P17658 529 aa30.75■■■□□ 2.51
CAPNS1-207ENST00000589146 INSRP06213 1382 aa30.75■■■□□ 2.51
CAPNS1-207ENST00000589146 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP30.74■■■□□ 2.51
CAPNS1-207ENST00000589146 CCDC61Q9Y6R9 512 aa30.74■■■□□ 2.51
CAPNS1-207ENST00000589146 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa30.73■■■□□ 2.51
CAPNS1-207ENST00000589146 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa30.73■■■□□ 2.51
CAPNS1-207ENST00000589146 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa30.72■■■□□ 2.51
CAPNS1-207ENST00000589146 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa30.72■■■□□ 2.51
CAPNS1-207ENST00000589146 PRR36Q9H6K5 1346 aa30.71■■■□□ 2.51
CAPNS1-207ENST00000589146 NWD1Q149M9 1564 aa30.71■■■□□ 2.51
CAPNS1-207ENST00000589146 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP30.69■■■□□ 2.5
CAPNS1-207ENST00000589146 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa30.68■■■□□ 2.5
CAPNS1-207ENST00000589146 MORC1Q86VD1 984 aa30.67■■■□□ 2.5
CAPNS1-207ENST00000589146 AKAP12Q02952 1782 aa30.66■■■□□ 2.5
CAPNS1-207ENST00000589146 PLEKHG3A1L390 1219 aa30.66■■■□□ 2.5
CAPNS1-207ENST00000589146 MON2Q7Z3U7 1717 aa30.64■■■□□ 2.5
CAPNS1-207ENST00000589146 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP30.64■■■□□ 2.49
CAPNS1-207ENST00000589146 ANKARQ7Z5J8 1434 aa30.64■■■□□ 2.49
CAPNS1-207ENST00000589146 KIF20BQ96Q89 1820 aa30.63■■■□□ 2.49
CAPNS1-207ENST00000589146 ITSN1Q15811 1721 aa30.62■■■□□ 2.49
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP30.62■■■□□ 2.49
CAPNS1-207ENST00000589146 FYB1O15117 783 aa30.61■■■□□ 2.49
CAPNS1-207ENST00000589146 FMN2Q9NZ56 1722 aa30.61■■■□□ 2.49
CAPNS1-207ENST00000589146 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP30.6■■■□□ 2.49
CAPNS1-207ENST00000589146 ZBED9Q6R2W3 1325 aa30.6■■■□□ 2.49
CAPNS1-207ENST00000589146 LMTK3Q96Q04 1460 aa30.59■■■□□ 2.49
CAPNS1-207ENST00000589146 NALCNQ8IZF0 1738 aa30.58■■■□□ 2.49
CAPNS1-207ENST00000589146 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP30.56■■■□□ 2.48
CAPNS1-207ENST00000589146 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP30.56■■■□□ 2.48
CAPNS1-207ENST00000589146 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa30.56■■■□□ 2.48
CAPNS1-207ENST00000589146 GGNBP2Q9H3C7 697 aa30.52■■■□□ 2.48
CAPNS1-207ENST00000589146 NRKQ7Z2Y5 1582 aa30.52■■■□□ 2.48
CAPNS1-207ENST00000589146 ACEP12821 1306 aa30.5■■■□□ 2.47
CAPNS1-207ENST00000589146 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP30.5■■■□□ 2.47
CAPNS1-207ENST00000589146 SSH2Q76I76 1423 aa30.48■■■□□ 2.47
CAPNS1-207ENST00000589146 HSPA2P54652 639 aa30.48■■■□□ 2.47
CAPNS1-207ENST00000589146 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP30.48■■■□□ 2.47
CAPNS1-207ENST00000589146 USP6P35125 1406 aa30.47■■■□□ 2.47
CAPNS1-207ENST00000589146 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP30.47■■■□□ 2.47
CAPNS1-207ENST00000589146 STRCQ7RTU9 1775 aa30.46■■■□□ 2.47
CAPNS1-207ENST00000589146 MTHFSP49914 203 aa30.45■■■□□ 2.47
CAPNS1-207ENST00000589146 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP30.45■■■□□ 2.47
CAPNS1-207ENST00000589146 ADAMTS8Q9UP79 889 aa30.45■■■□□ 2.47
CAPNS1-207ENST00000589146 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa30.45■■■□□ 2.46
CAPNS1-207ENST00000589146 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP30.44■■■□□ 2.46
CAPNS1-207ENST00000589146 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa30.44■■■□□ 2.46
CAPNS1-207ENST00000589146 SHPRHQ149N8 1683 aa30.43■■■□□ 2.46
CAPNS1-207ENST00000589146 NUTM2FA1L443 756 aa30.43■■■□□ 2.46
CAPNS1-207ENST00000589146 CFAP53Q96M91 514 aa30.43■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.3 ms